More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0474 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 378 aa  741    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  56.53 
 
 		 376 aa  427  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  41.5 
 
 		 365 aa  259  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  41.34 
 
 		 388 aa  251  2e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  38.74 
 
 		 369 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  35.98 
 
 		 380 aa  239  8e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  35.9 
 
 		 426 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  38.5 
 
 		 379 aa  234  3e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  36.24 
 
 		 363 aa  229  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  36.66 
 
 		 387 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  34.64 
 
 		 421 aa  225  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  36.41 
 
 		 386 aa  222  8e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  37.5 
 
 		 390 aa  222  9e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  37.7 
 
 		 378 aa  220  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  36.81 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  32.34 
 
 		 413 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  36.74 
 
 		 366 aa  216  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  35.07 
 
 		 368 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  35.56 
 
 		 373 aa  215  9e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  37.6 
 
 		 378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  36.19 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  38.01 
 
 		 374 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  36.89 
 
 		 387 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04258  rod shape-determining protein RodA  34.17 
 
 		 372 aa  212  7.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239433  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  33.33 
 
 		 372 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  35.7 
 
 		 412 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  33.8 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  33.8 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  35.52 
 
 		 375 aa  210  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  35.56 
 
 		 371 aa  206  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  33.06 
 
 		 372 aa  206  5e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  33.9 
 
 		 371 aa  206  6e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  31.69 
 
 		 367 aa  206  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  34.68 
 
 		 373 aa  205  9e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  36.49 
 
 		 366 aa  205  9e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  36.49 
 
 		 366 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  34.95 
 
 		 373 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  31.25 
 
 		 368 aa  205  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  32.42 
 
 		 419 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  37.33 
 
 		 372 aa  203  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1543  rod shape-determining protein RodA  35.92 
 
 		 401 aa  204  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.391462  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  33.98 
 
 		 368 aa  203  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  30.5 
 
 		 438 aa  202  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  34.32 
 
 		 377 aa  202  6e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  34.26 
 
 		 366 aa  202  7e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  36.99 
 
 		 366 aa  202  9e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  34.96 
 
 		 374 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  36.31 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0591  rod shape-determining protein RodA  31.93 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7281  rod shape-determining protein RodA  32.89 
 
 		 407 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  32.44 
 
 		 372 aa  200  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  33.15 
 
 		 368 aa  199  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  36.77 
 
 		 367 aa  199  6e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0672  rod shape-determining protein  32.56 
 
 		 353 aa  199  6e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.722456  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  31.94 
 
 		 388 aa  199  7e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  31.34 
 
 		 412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  31.98 
 
 		 367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  31.98 
 
 		 367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  34.91 
 
 		 383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  33.14 
 
 		 412 aa  197  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  33.87 
 
 		 373 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  35.24 
 
 		 374 aa  197  3e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  35.83 
 
 		 365 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  36.67 
 
 		 371 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  34.8 
 
 		 382 aa  196  5.000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1152  cell division membrane protein  34.16 
 
 		 424 aa  196  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  31.18 
 
 		 373 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1554  rod shape-determining protein RodA  34.73 
 
 		 357 aa  196  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  31.96 
 
 		 367 aa  196  7e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1034  cell cycle protein  35.8 
 
 		 402 aa  195  8.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  32.43 
 
 		 368 aa  195  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  32.43 
 
 		 368 aa  195  9e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  32.43 
 
 		 368 aa  195  9e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  32.88 
 
 		 403 aa  195  9e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2816  cell cycle protein  33.6 
 
 		 374 aa  195  9e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  32.43 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  32.78 
 
 		 364 aa  195  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5265  cell cycle protein  32.13 
 
 		 411 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3450  rod shape-determining protein RodA  32.58 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.921865 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20261  cell division membrane protein  34.16 
 
 		 424 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.36733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1215  cell cycle protein  32.99 
 
 		 411 aa  193  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323316  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22691  cell division membrane protein  30.43 
 
 		 427 aa  193  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.260767 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  35.09 
 
 		 362 aa  192  6e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  32.02 
 
 		 405 aa  192  7e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2623  rod shape-determining protein RodA  31.52 
 
 		 437 aa  192  7e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3975  cell division protein FtsW  34.35 
 
 		 359 aa  192  9e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  30.83 
 
 		 371 aa  192  9e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  32.79 
 
 		 382 aa  191  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  33.06 
 
 		 373 aa  191  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4040  cell cycle protein  33.86 
 
 		 380 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283521  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  34.45 
 
 		 367 aa  192  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  32.27 
 
 		 423 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  29.89 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  31.75 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1303  cell division protein FtsW  33.51 
 
 		 365 aa  190  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  36.01 
 
 		 371 aa  190  4e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3070  cell cycle protein FtsW  35.28 
 
 		 354 aa  189  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2824  rod shape-determining protein RodA  35.04 
 
 		 371 aa  189  5e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.806923 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  32.74 
 
 		 373 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  33.54 
 
 		 372 aa  189  8e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>