More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4040 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4040  cell cycle protein  100 
 
 
380 aa  754    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283521  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  45.58 
 
 
367 aa  331  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2349  cell cycle protein  46.38 
 
 
367 aa  282  6.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2816  cell cycle protein  40.21 
 
 
374 aa  266  5e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  39.38 
 
 
366 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  33.68 
 
 
380 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  35.75 
 
 
365 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  33.69 
 
 
388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  36.41 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  34.57 
 
 
371 aa  207  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  32.64 
 
 
378 aa  205  9e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  33.78 
 
 
366 aa  203  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  33.07 
 
 
378 aa  203  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  32.54 
 
 
379 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  32.89 
 
 
369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  35.49 
 
 
376 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  38.14 
 
 
388 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  34.62 
 
 
398 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  37.21 
 
 
387 aa  194  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  33.53 
 
 
366 aa  193  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  34.68 
 
 
371 aa  192  8e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  34.69 
 
 
366 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  35.06 
 
 
365 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  36.2 
 
 
412 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  34.42 
 
 
366 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  32.7 
 
 
363 aa  190  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  36.81 
 
 
371 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  34.86 
 
 
413 aa  185  9e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  33.15 
 
 
366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  34.2 
 
 
367 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  34.71 
 
 
386 aa  182  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  33.86 
 
 
378 aa  182  7e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  36.31 
 
 
369 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  33.96 
 
 
366 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  34.04 
 
 
372 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  34.77 
 
 
371 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  35.09 
 
 
373 aa  179  8e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2824  rod shape-determining protein RodA  37.46 
 
 
371 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.806923 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  33.15 
 
 
368 aa  178  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06110  rod shape-determining protein RodA  33.67 
 
 
404 aa  177  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000223269 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1276  stage V sporulation protein E  36.97 
 
 
374 aa  177  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3450  rod shape-determining protein RodA  34.35 
 
 
370 aa  177  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.921865 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  34.15 
 
 
376 aa  177  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  33.96 
 
 
368 aa  176  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  31.89 
 
 
382 aa  176  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  32.82 
 
 
372 aa  176  9e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  34.86 
 
 
366 aa  175  9e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  36.18 
 
 
368 aa  176  9e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  35.78 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  36.02 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  32.79 
 
 
419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  35.22 
 
 
384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3340  putative rod shape-determining protein RodA  34.58 
 
 
381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00193411  normal  0.0192453 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  31.22 
 
 
407 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  34.39 
 
 
364 aa  173  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  33.75 
 
 
367 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  32.82 
 
 
382 aa  173  5e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  35.2 
 
 
368 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  34.05 
 
 
417 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  34.46 
 
 
368 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  33.75 
 
 
367 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  33.75 
 
 
367 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  34.05 
 
 
417 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  33.23 
 
 
368 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  33.23 
 
 
368 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  36.14 
 
 
385 aa  172  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  33.23 
 
 
368 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  33.23 
 
 
368 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  34.95 
 
 
370 aa  172  9e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  29.38 
 
 
364 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  34.65 
 
 
370 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  32.31 
 
 
363 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  29.38 
 
 
403 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  34.37 
 
 
368 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  30.27 
 
 
366 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  32.92 
 
 
372 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  35.8 
 
 
370 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  36.53 
 
 
368 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  34.58 
 
 
368 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0591  rod shape-determining protein RodA  34.02 
 
 
373 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0672  rod shape-determining protein  34.02 
 
 
353 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.722456  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  35.65 
 
 
387 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  36.11 
 
 
370 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  36.11 
 
 
370 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  35.44 
 
 
377 aa  171  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  31.35 
 
 
390 aa  170  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  32.83 
 
 
379 aa  171  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  32.21 
 
 
373 aa  170  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1091  cell wall shape-determining protein  36.17 
 
 
370 aa  170  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04258  rod shape-determining protein RodA  35.74 
 
 
372 aa  170  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239433  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  32.5 
 
 
373 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  33.44 
 
 
368 aa  169  5e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3738  stage V sporulation protein E  35.52 
 
 
363 aa  170  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1543  rod shape-determining protein RodA  36.76 
 
 
401 aa  169  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.391462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1303  cell division protein FtsW  35.48 
 
 
365 aa  169  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1526  cell cycle protein  34.77 
 
 
379 aa  169  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66841  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  33.95 
 
 
365 aa  169  7e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  33.89 
 
 
372 aa  169  8e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  33.54 
 
 
376 aa  169  8e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  33.89 
 
 
372 aa  169  9e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>