More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1543 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1543  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 401 aa  780    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.391462  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  59.36 
 
 		 387 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  56.74 
 
 		 386 aa  373  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1215  cell cycle protein  58.67 
 
 		 411 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323316  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5265  cell cycle protein  56.88 
 
 		 411 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  54.93 
 
 		 390 aa  364  1e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  53.39 
 
 		 413 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7281  rod shape-determining protein RodA  53.46 
 
 		 407 aa  336  5e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1684  rod shape-determining protein RodA  53.07 
 
 		 381 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.199967 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  42.78 
 
 		 380 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2186  Sfr protein  52.19 
 
 		 407 aa  277  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117598  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  45.73 
 
 		 382 aa  273  3e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  40.97 
 
 		 365 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0752  cell cycle protein  48.77 
 
 		 401 aa  271  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11520  rod shape-determining protein RodA  46.09 
 
 		 423 aa  261  2e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0049464  normal  0.455948 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  39.2 
 
 		 419 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  43.8 
 
 		 377 aa  253  5.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  40.42 
 
 		 378 aa  252  9.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  40.74 
 
 		 373 aa  249  5e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  38.6 
 
 		 379 aa  248  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  41.01 
 
 		 398 aa  246  4.9999999999999997e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  37.69 
 
 		 376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  38.05 
 
 		 412 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  42.75 
 
 		 388 aa  243  6e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  40.53 
 
 		 367 aa  240  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  41.88 
 
 		 378 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  37.77 
 
 		 421 aa  233  4.0000000000000004e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  38.38 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  35.49 
 
 		 417 aa  230  4e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  37.68 
 
 		 417 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  37.68 
 
 		 417 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2650  cell cycle protein  38.03 
 
 		 391 aa  229  6e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.115542  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  38.87 
 
 		 367 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  38.19 
 
 		 426 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  36.34 
 
 		 369 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  38.87 
 
 		 363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  35.92 
 
 		 378 aa  215  9e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2816  cell cycle protein  38.13 
 
 		 374 aa  215  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  33.25 
 
 		 371 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  37.5 
 
 		 366 aa  212  9e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  36.88 
 
 		 407 aa  212  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  36.51 
 
 		 371 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  37.1 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  41.64 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1203  rod shape-determining protein RodA  42.49 
 
 		 374 aa  209  7e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  34.85 
 
 		 371 aa  209  8e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  38.06 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  40.06 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1554  rod shape-determining protein RodA  41.44 
 
 		 357 aa  207  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1234  rod shape-determining protein RodA  34.59 
 
 		 366 aa  206  8e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  36.48 
 
 		 364 aa  205  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  37.88 
 
 		 376 aa  205  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  36.9 
 
 		 366 aa  205  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  34.13 
 
 		 388 aa  204  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  36.58 
 
 		 403 aa  204  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  36.58 
 
 		 380 aa  202  8e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  38.79 
 
 		 370 aa  202  9e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  36.63 
 
 		 366 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  35.99 
 
 		 374 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  38.86 
 
 		 370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  39.07 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  42.31 
 
 		 382 aa  200  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  34.78 
 
 		 373 aa  199  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4083  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  34.11 
 
 		 386 aa  199  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  38.14 
 
 		 376 aa  199  7e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  38.54 
 
 		 370 aa  199  7.999999999999999e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  38.54 
 
 		 370 aa  199  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  38.54 
 
 		 370 aa  199  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  37.86 
 
 		 370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  39.37 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3691  cell cycle protein FtsW  36.41 
 
 		 393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3708  cell cycle protein FtsW  36.41 
 
 		 393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000336622  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2349  cell cycle protein  39.78 
 
 		 367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  35.93 
 
 		 373 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1113  cell cycle protein  33.33 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1258  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  33.94 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  34.57 
 
 		 421 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4051  cell division protein,FtsW/RodA/SpoVE family  36.24 
 
 		 392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  40.72 
 
 		 384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  37.67 
 
 		 370 aa  197  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1200  cell wall shape-determining protein  37.86 
 
 		 370 aa  197  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  35 
 
 		 368 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  36.73 
 
 		 365 aa  196  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1261  cell cycle protein  37.43 
 
 		 397 aa  196  6e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0112895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  35.71 
 
 		 374 aa  196  7e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00603  cell wall shape-determining protein  37.67 
 
 		 370 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0209477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2992  rod shape-determining protein RodA  37.67 
 
 		 370 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000333692  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0723  cell wall shape-determining protein  37.67 
 
 		 370 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000246706  normal  0.373531 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  37.67 
 
 		 370 aa  196  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3011  cell wall shape-determining protein  37.67 
 
 		 370 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000406019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  37.67 
 
 		 370 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000809378  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  37.67 
 
 		 370 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  35.92 
 
 		 369 aa  195  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  37.75 
 
 		 370 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  36.36 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  37.75 
 
 		 370 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  37.75 
 
 		 370 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  37.75 
 
 		 370 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  37.75 
 
 		 370 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1169  cell wall shape-determining protein  38.87 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25541  normal  0.27842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>