More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0983 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  100 
 
 		 376 aa  742    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  56.53 
 
 		 378 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  41.96 
 
 		 369 aa  281  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  42.27 
 
 		 365 aa  267  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  41.05 
 
 		 388 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  40.37 
 
 		 379 aa  245  8e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  39.73 
 
 		 378 aa  242  7e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  36.44 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  38.69 
 
 		 378 aa  231  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  36.22 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  37.05 
 
 		 363 aa  225  8e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  31.73 
 
 		 426 aa  222  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  40.51 
 
 		 371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0672  rod shape-determining protein  37.54 
 
 		 353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.722456  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0591  rod shape-determining protein RodA  35.18 
 
 		 373 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  34.63 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  37.6 
 
 		 373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  40.75 
 
 		 412 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  37.6 
 
 		 373 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  33.74 
 
 		 419 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  38.08 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  35.54 
 
 		 386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  37.03 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  35.87 
 
 		 413 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  33.81 
 
 		 421 aa  213  3.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04258  rod shape-determining protein RodA  34.22 
 
 		 372 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239433  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  36.31 
 
 		 387 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  34.72 
 
 		 417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  33.6 
 
 		 368 aa  211  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1543  rod shape-determining protein RodA  37.67 
 
 		 401 aa  212  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.391462  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  34.71 
 
 		 368 aa  212  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  35.55 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  36.11 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  38.25 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  36.34 
 
 		 371 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  37.47 
 
 		 423 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  32.97 
 
 		 368 aa  209  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  35.26 
 
 		 388 aa  209  5e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3450  rod shape-determining protein RodA  34.5 
 
 		 370 aa  208  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.921865 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  39.66 
 
 		 370 aa  208  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  34.97 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  40.66 
 
 		 371 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  35.67 
 
 		 372 aa  207  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  37.33 
 
 		 373 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  34.12 
 
 		 422 aa  206  6e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  35.13 
 
 		 371 aa  206  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  33.24 
 
 		 364 aa  206  7e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  33.24 
 
 		 403 aa  206  8e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  33.7 
 
 		 366 aa  205  9e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  34.65 
 
 		 371 aa  205  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  35.28 
 
 		 366 aa  205  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  35.06 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7281  rod shape-determining protein RodA  34.85 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  32.41 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  33.8 
 
 		 372 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  33.62 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2816  cell cycle protein  33.78 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  32.41 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  36.07 
 
 		 372 aa  204  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  35.95 
 
 		 372 aa  204  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  35.64 
 
 		 365 aa  203  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  36.14 
 
 		 380 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  35.09 
 
 		 373 aa  203  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  36.27 
 
 		 368 aa  202  6e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  33.16 
 
 		 371 aa  202  8e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  39.93 
 
 		 366 aa  202  9e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  37.99 
 
 		 370 aa  202  9e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  37.99 
 
 		 370 aa  202  9e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  38.27 
 
 		 370 aa  202  9e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  35.65 
 
 		 422 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  34.44 
 
 		 367 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  34.44 
 
 		 367 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  33.24 
 
 		 373 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  34.7 
 
 		 366 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1371  rod shape-determining protein RodA  36.22 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0444396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  37.7 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  34.44 
 
 		 367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08400  rod shape-determining protein RodA  36.92 
 
 		 382 aa  200  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41497  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  35.26 
 
 		 366 aa  199  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  34.11 
 
 		 368 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  34.11 
 
 		 368 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  34.11 
 
 		 368 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  34.11 
 
 		 368 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  34.7 
 
 		 366 aa  199  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1200  cell wall shape-determining protein  36.36 
 
 		 370 aa  199  7e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  33.17 
 
 		 422 aa  199  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  34.8 
 
 		 368 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  38.22 
 
 		 369 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  36.76 
 
 		 370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  33.52 
 
 		 412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  33.94 
 
 		 374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2992  rod shape-determining protein RodA  36.36 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000333692  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  36.76 
 
 		 370 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  36.76 
 
 		 370 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  36.36 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  36.36 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  36.36 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000809378  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  36.76 
 
 		 370 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  36.76 
 
 		 370 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  36.76 
 
 		 370 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>