More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3461 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 413 aa  800    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5265  cell cycle protein  53.68 
 
 		 411 aa  345  8.999999999999999e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1215  cell cycle protein  55.56 
 
 		 411 aa  339  5e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323316  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7281  rod shape-determining protein RodA  49.47 
 
 		 407 aa  331  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1543  rod shape-determining protein RodA  53.39 
 
 		 401 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.391462  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  50.71 
 
 		 387 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  48.83 
 
 		 386 aa  311  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1684  rod shape-determining protein RodA  49.74 
 
 		 381 aa  291  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.199967 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  46.87 
 
 		 390 aa  291  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0752  cell cycle protein  49.04 
 
 		 401 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  40.6 
 
 		 365 aa  281  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  37.63 
 
 		 379 aa  270  5e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  42.15 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  40.27 
 
 		 380 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11520  rod shape-determining protein RodA  48.21 
 
 		 423 aa  259  7e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0049464  normal  0.455948 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2186  Sfr protein  47.86 
 
 		 407 aa  256  4e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117598  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  38.89 
 
 		 367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  40.91 
 
 		 377 aa  248  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  41.27 
 
 		 378 aa  243  6e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  36.58 
 
 		 378 aa  236  4e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  41.3 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  37.98 
 
 		 373 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  34.41 
 
 		 419 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  36.59 
 
 		 376 aa  230  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  35.36 
 
 		 371 aa  231  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  38.48 
 
 		 398 aa  229  7e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  35.71 
 
 		 412 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  40.05 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  37.09 
 
 		 369 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0975  stage V sporulation protein E  35.08 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000101202  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  37.94 
 
 		 368 aa  219  6e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  38.42 
 
 		 366 aa  219  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1565  cell division protein FtsW  39.31 
 
 		 364 aa  218  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  37.91 
 
 		 367 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  36.39 
 
 		 372 aa  217  2.9999999999999998e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  32.88 
 
 		 378 aa  216  8e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  37.36 
 
 		 366 aa  216  8e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  36.63 
 
 		 367 aa  215  9e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1234  rod shape-determining protein RodA  35.62 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  37.77 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  37.77 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  41.82 
 
 		 366 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  35.37 
 
 		 379 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  35.42 
 
 		 386 aa  213  7e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  34.25 
 
 		 407 aa  212  7.999999999999999e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2816  cell cycle protein  37 
 
 		 374 aa  212  7.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  36.8 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  37.36 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  40 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3771  cell division protein FtsW  37.6 
 
 		 432 aa  211  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.351351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  37.68 
 
 		 368 aa  211  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1203  rod shape-determining protein RodA  40.37 
 
 		 374 aa  210  5e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  35.87 
 
 		 421 aa  209  6e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  38.56 
 
 		 403 aa  209  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  35.83 
 
 		 368 aa  209  6e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  38.8 
 
 		 366 aa  209  7e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  38.56 
 
 		 364 aa  209  9e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  36.58 
 
 		 426 aa  209  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  37.36 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  38.4 
 
 		 376 aa  208  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  36.54 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  38.84 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  38.6 
 
 		 368 aa  209  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  36.68 
 
 		 371 aa  208  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  38.36 
 
 		 373 aa  207  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  35.96 
 
 		 408 aa  206  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  36.47 
 
 		 373 aa  206  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  37.33 
 
 		 366 aa  205  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  33.6 
 
 		 371 aa  205  1e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  38.41 
 
 		 383 aa  205  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  38.48 
 
 		 368 aa  205  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  34.81 
 
 		 371 aa  204  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0825  cell cycle protein  37.05 
 
 		 364 aa  204  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0999607  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  38.51 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  33 
 
 		 417 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  33 
 
 		 417 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  35.87 
 
 		 372 aa  202  6e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  37.95 
 
 		 368 aa  203  6e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  37.95 
 
 		 368 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  37.95 
 
 		 368 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  37.46 
 
 		 376 aa  202  7e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  37.95 
 
 		 368 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  35.71 
 
 		 367 aa  202  7e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  35.71 
 
 		 367 aa  202  7e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  32.76 
 
 		 374 aa  202  8e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  36.29 
 
 		 363 aa  202  9e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2013  rod shape-determining protein RodA  37.78 
 
 		 385 aa  202  9e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0547466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  35.44 
 
 		 367 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  36.89 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  36.16 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  30.07 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0449  cell division protein FtsW  36.05 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  34.38 
 
 		 421 aa  200  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  38.11 
 
 		 368 aa  201  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  36.75 
 
 		 372 aa  199  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  38.91 
 
 		 368 aa  199  6e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  36.47 
 
 		 373 aa  199  7e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  38.04 
 
 		 366 aa  199  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  32.45 
 
 		 388 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  36.56 
 
 		 382 aa  199  9e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>