More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1459 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  100 
 
 		 388 aa  768    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  59.22 
 
 		 380 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  51.95 
 
 		 412 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  54.28 
 
 		 377 aa  386  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  52.51 
 
 		 378 aa  362  9e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  48.06 
 
 		 387 aa  326  5e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  43.31 
 
 		 379 aa  315  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  45.14 
 
 		 378 aa  311  1e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  42.02 
 
 		 365 aa  294  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  43.04 
 
 		 372 aa  264  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  42.86 
 
 		 365 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  40.64 
 
 		 371 aa  243  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  38.74 
 
 		 421 aa  239  6.999999999999999e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  41.89 
 
 		 417 aa  238  9e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  41.89 
 
 		 417 aa  238  9e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  42.6 
 
 		 417 aa  236  4e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  41.13 
 
 		 366 aa  235  8e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  39.52 
 
 		 367 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1261  cell cycle protein  40.93 
 
 		 397 aa  233  4.0000000000000004e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0112895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  40.49 
 
 		 426 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  39.79 
 
 		 374 aa  232  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  35.51 
 
 		 369 aa  233  6e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  41.53 
 
 		 363 aa  232  7.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  37.9 
 
 		 371 aa  232  8.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  41.3 
 
 		 419 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  39.84 
 
 		 366 aa  231  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  44.01 
 
 		 384 aa  229  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1565  cell division protein FtsW  40.77 
 
 		 364 aa  228  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  38.5 
 
 		 366 aa  227  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  38.5 
 
 		 367 aa  227  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  39.24 
 
 		 365 aa  227  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  36.49 
 
 		 374 aa  226  4e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  39.84 
 
 		 367 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3738  stage V sporulation protein E  42.62 
 
 		 363 aa  226  6e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29605  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  40.21 
 
 		 366 aa  225  9e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3957  stage V sporulation protein E  42.35 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3762  stage V sporulation protein E  42.35 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3653  stage V sporulation protein E  42.35 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3670  stage V sporulation protein E  42.35 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3926  stage V sporulation protein E  42.35 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000164467 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4050  stage V sporulation protein E  42.35 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3964  stage V sporulation protein E  42.35 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261778  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  37.07 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4012  stage V sporulation protein E  42.08 
 
 		 363 aa  223  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000045407  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06110  rod shape-determining protein RodA  39.2 
 
 		 404 aa  224  3e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000223269 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  40.11 
 
 		 364 aa  223  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  38.5 
 
 		 366 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  36.63 
 
 		 368 aa  223  6e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  37.03 
 
 		 373 aa  223  6e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  40.05 
 
 		 413 aa  222  7e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1229  stage V sporulation protein E  41.8 
 
 		 363 aa  222  8e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000285067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  36.63 
 
 		 368 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  40.48 
 
 		 387 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  39.52 
 
 		 368 aa  220  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  37.47 
 
 		 403 aa  219  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  37.47 
 
 		 364 aa  219  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  36.76 
 
 		 374 aa  219  7e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  37.5 
 
 		 398 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  37.77 
 
 		 373 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2561  stage V sporulation protein E  42.35 
 
 		 363 aa  217  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.119412  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  38.81 
 
 		 382 aa  216  4e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  37.77 
 
 		 373 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1234  rod shape-determining protein RodA  35.47 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1371  rod shape-determining protein RodA  39.05 
 
 		 373 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0444396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  36.78 
 
 		 368 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  35.25 
 
 		 376 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  36.59 
 
 		 367 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  43.09 
 
 		 382 aa  212  7e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  40.21 
 
 		 366 aa  211  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  36.59 
 
 		 367 aa  212  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  36.59 
 
 		 367 aa  212  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  36.78 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1543  rod shape-determining protein RodA  42.35 
 
 		 401 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.391462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1303  cell division protein FtsW  36.56 
 
 		 365 aa  210  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  40.21 
 
 		 366 aa  211  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2103  cell cycle protein FtsW  35.7 
 
 		 374 aa  210  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000319192  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0825  cell cycle protein  38.12 
 
 		 364 aa  210  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0999607  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  36.36 
 
 		 388 aa  210  4e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  39.94 
 
 		 372 aa  210  4e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  36.78 
 
 		 368 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  36.78 
 
 		 368 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  39.87 
 
 		 368 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  36.78 
 
 		 368 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  44.08 
 
 		 366 aa  209  6e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  37.87 
 
 		 405 aa  209  7e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  39.87 
 
 		 373 aa  208  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  36.88 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  39.02 
 
 		 363 aa  208  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2391  cell cycle protein FtsW  35.43 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00202721  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1020  stage V sporulation protein E  39.94 
 
 		 366 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  38.7 
 
 		 371 aa  206  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  40.07 
 
 		 373 aa  207  4e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  44.12 
 
 		 370 aa  206  5e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  35.6 
 
 		 368 aa  206  6e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0975  stage V sporulation protein E  35.42 
 
 		 383 aa  206  7e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000101202  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2788  cell division protein FtsW  37.99 
 
 		 371 aa  206  7e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5265  cell cycle protein  43.22 
 
 		 411 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  38.03 
 
 		 373 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  36.76 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  35.06 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>