More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3302 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  100 
 
 		 417 aa  828    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  59.35 
 
 		 419 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  58.75 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  58.75 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  56.13 
 
 		 438 aa  482  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  57.28 
 
 		 426 aa  461  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2623  rod shape-determining protein RodA  54.87 
 
 		 437 aa  450  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  56.68 
 
 		 421 aa  438  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  50.86 
 
 		 412 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  51.41 
 
 		 412 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22691  cell division membrane protein  49.04 
 
 		 427 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.260767 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1152  cell division membrane protein  46.46 
 
 		 424 aa  331  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20261  cell division membrane protein  46.46 
 
 		 424 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.36733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  44.67 
 
 		 422 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  43.4 
 
 		 422 aa  319  6e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  44.16 
 
 		 422 aa  318  9e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  41.63 
 
 		 423 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17001  cell division membrane protein  46.45 
 
 		 426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.746049 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  41.5 
 
 		 380 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  39.94 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  42.06 
 
 		 377 aa  241  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  41.57 
 
 		 412 aa  239  9e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  42.66 
 
 		 387 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  36.06 
 
 		 373 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  38.44 
 
 		 388 aa  233  5e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  42.58 
 
 		 378 aa  229  7e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  36.76 
 
 		 378 aa  228  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  35.08 
 
 		 366 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  35.2 
 
 		 369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  35.29 
 
 		 379 aa  220  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  35.71 
 
 		 379 aa  219  5e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  36.29 
 
 		 398 aa  219  7.999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  35.61 
 
 		 374 aa  218  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  37.01 
 
 		 366 aa  216  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  37.47 
 
 		 387 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  38.04 
 
 		 376 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  34.72 
 
 		 376 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  35.01 
 
 		 403 aa  212  9e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  35.01 
 
 		 364 aa  212  9e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  36.3 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  35.91 
 
 		 365 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  36.57 
 
 		 369 aa  209  6e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  37.25 
 
 		 366 aa  209  9e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  34.97 
 
 		 373 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  34.44 
 
 		 363 aa  208  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  34.55 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  33.41 
 
 		 382 aa  208  2e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  37.16 
 
 		 371 aa  207  2e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  34.51 
 
 		 368 aa  207  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  34.97 
 
 		 373 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  35.35 
 
 		 368 aa  207  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  36.52 
 
 		 368 aa  206  5e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  37.18 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  35.1 
 
 		 367 aa  206  6e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  35.1 
 
 		 367 aa  206  6e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  33.5 
 
 		 368 aa  206  7e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  36.81 
 
 		 371 aa  206  7e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  36.34 
 
 		 368 aa  206  7e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  34.85 
 
 		 367 aa  205  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  33.6 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  37.22 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  37.57 
 
 		 372 aa  204  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  37.28 
 
 		 368 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  37.28 
 
 		 368 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  37.28 
 
 		 368 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  37.28 
 
 		 368 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1543  rod shape-determining protein RodA  35.01 
 
 		 401 aa  204  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.391462  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  35.25 
 
 		 373 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  35.88 
 
 		 368 aa  202  7e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  37.33 
 
 		 371 aa  202  7e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  35.59 
 
 		 382 aa  202  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  37.18 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  35.16 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  33.74 
 
 		 368 aa  199  9e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  33.7 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  35.24 
 
 		 405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  37.22 
 
 		 390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  34.83 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  35.84 
 
 		 379 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  35.84 
 
 		 379 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  34.17 
 
 		 373 aa  197  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  36.24 
 
 		 366 aa  197  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  34.12 
 
 		 384 aa  196  7e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2503  cell cycle protein  34.31 
 
 		 438 aa  196  7e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000231774  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  34.5 
 
 		 366 aa  196  9e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  36.77 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1998  rod shape-determining protein RodA  33.42 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0307055  normal  0.0830692 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3371  rod shape-determining protein RodA  33.8 
 
 		 384 aa  195  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  34.37 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  35.7 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  32.43 
 
 		 371 aa  195  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  36.19 
 
 		 378 aa  195  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  36.03 
 
 		 373 aa  195  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  34.76 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5265  cell cycle protein  35.26 
 
 		 411 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  33.25 
 
 		 407 aa  193  5e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  33.15 
 
 		 367 aa  192  1e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  36.54 
 
 		 362 aa  192  1e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  34.68 
 
 		 373 aa  192  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  34.63 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>