More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5265 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5265  cell cycle protein  100 
 
 
411 aa  815    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1215  cell cycle protein  88.05 
 
 
411 aa  671    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323316  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  53.68 
 
 
413 aa  358  7e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1543  rod shape-determining protein RodA  56.88 
 
 
401 aa  355  8.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.391462  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  48.21 
 
 
387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  46.77 
 
 
390 aa  302  6.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7281  rod shape-determining protein RodA  48.28 
 
 
407 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  45.52 
 
 
386 aa  299  8e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0752  cell cycle protein  46.27 
 
 
401 aa  297  2e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1684  rod shape-determining protein RodA  44.97 
 
 
381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.199967 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2186  Sfr protein  47.18 
 
 
407 aa  256  4e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117598  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  38.67 
 
 
365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11520  rod shape-determining protein RodA  43.43 
 
 
423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0049464  normal  0.455948 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  39.79 
 
 
377 aa  239  4e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  36.39 
 
 
378 aa  234  3e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  36.1 
 
 
379 aa  232  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  38.56 
 
 
382 aa  231  2e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  38.56 
 
 
367 aa  229  7e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  37.8 
 
 
380 aa  229  8e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  40.62 
 
 
378 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2816  cell cycle protein  36.77 
 
 
374 aa  219  7e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  34.92 
 
 
419 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  37.02 
 
 
398 aa  219  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  35.59 
 
 
426 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  36.17 
 
 
373 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  36.04 
 
 
387 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  39.9 
 
 
388 aa  213  7e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  32.62 
 
 
417 aa  209  7e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  34.22 
 
 
412 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  35.32 
 
 
417 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  35.32 
 
 
417 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  35.31 
 
 
421 aa  206  5e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  34.29 
 
 
371 aa  204  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  37.93 
 
 
372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2349  cell cycle protein  38.56 
 
 
367 aa  200  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1234  rod shape-determining protein RodA  34.23 
 
 
366 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  32.38 
 
 
376 aa  199  5e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  35.58 
 
 
366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  31.7 
 
 
378 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  33.63 
 
 
373 aa  197  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  32.18 
 
 
367 aa  194  2e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  35.75 
 
 
367 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  33.51 
 
 
368 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  34.86 
 
 
369 aa  193  5e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  32.8 
 
 
422 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  32.98 
 
 
368 aa  190  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  33.68 
 
 
388 aa  190  5e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  34.85 
 
 
363 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  36.41 
 
 
366 aa  189  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  34.57 
 
 
366 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  33.96 
 
 
368 aa  187  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  33.86 
 
 
423 aa  186  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0674  cell cycle protein  29.76 
 
 
408 aa  186  9e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.935594  normal  0.572504 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  30.98 
 
 
438 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  32.72 
 
 
405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  33.24 
 
 
374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4534  cell division protein FtsW  34.13 
 
 
404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  32.71 
 
 
374 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2203  cell cycle protein FtsW  35.99 
 
 
369 aa  180  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  32.26 
 
 
422 aa  180  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0930  rod shape-determining protein RodA  31.35 
 
 
371 aa  180  4e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  32.98 
 
 
375 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  33.42 
 
 
371 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  35.76 
 
 
412 aa  179  9e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3738  stage V sporulation protein E  35.68 
 
 
363 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3957  stage V sporulation protein E  35.95 
 
 
363 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392233  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2650  cell cycle protein  33.78 
 
 
391 aa  178  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.115542  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3762  stage V sporulation protein E  35.95 
 
 
363 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3653  stage V sporulation protein E  35.95 
 
 
363 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3964  stage V sporulation protein E  35.95 
 
 
363 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261778  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3670  stage V sporulation protein E  35.95 
 
 
363 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4050  stage V sporulation protein E  35.95 
 
 
363 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  30.46 
 
 
407 aa  179  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  31.58 
 
 
369 aa  179  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3926  stage V sporulation protein E  35.68 
 
 
363 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000164467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3268  cell division protein FtsW  33.24 
 
 
511 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162204  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  31.82 
 
 
364 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3257  cell division protein FtsW  33.24 
 
 
511 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19497  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0385  cell division protein FtsW  34.23 
 
 
403 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0110798 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  31.82 
 
 
403 aa  178  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1034  cell cycle protein  34.18 
 
 
402 aa  178  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  34.21 
 
 
384 aa  178  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3744  cell division protein FtsW  34.23 
 
 
403 aa  178  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000784985 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  32.85 
 
 
408 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3319  cell division protein FtsW  33.24 
 
 
511 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40135  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  32.97 
 
 
368 aa  178  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  32.26 
 
 
422 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06110  rod shape-determining protein RodA  34.92 
 
 
404 aa  177  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000223269 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2391  cell cycle protein FtsW  32.55 
 
 
374 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00202721  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3812  cell division protein FtsW  34.03 
 
 
405 aa  177  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3571  cell division protein FtsW  33.96 
 
 
403 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0409  cell division protein FtsW  34.46 
 
 
410 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146554 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04258  rod shape-determining protein RodA  35.23 
 
 
372 aa  177  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239433  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  28.77 
 
 
374 aa  177  4e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0486  cell division protein FtsW  34.23 
 
 
403 aa  176  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4220  cell division protein FtsW  34.23 
 
 
403 aa  176  6e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4083  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  32 
 
 
386 aa  176  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1980  cell division protein FtsW  34.72 
 
 
398 aa  176  7e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  34.08 
 
 
380 aa  176  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1229  stage V sporulation protein E  35.41 
 
 
363 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000285067  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>