More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0160 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 368 aa  738    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  65.94 
 
 		 371 aa  485  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  66.21 
 
 		 371 aa  464  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2824  rod shape-determining protein RodA  65.4 
 
 		 371 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.806923 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  59.29 
 
 		 369 aa  435  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  59.95 
 
 		 373 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  48.78 
 
 		 366 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  47.43 
 
 		 366 aa  310  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  47.41 
 
 		 366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  45.53 
 
 		 366 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  44.59 
 
 		 366 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  43.9 
 
 		 366 aa  288  8e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  44.47 
 
 		 365 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  42.39 
 
 		 366 aa  277  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  40.97 
 
 		 371 aa  260  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  39.57 
 
 		 378 aa  258  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  37.1 
 
 		 379 aa  256  4e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  40.38 
 
 		 373 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  40.38 
 
 		 373 aa  252  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  42.06 
 
 		 368 aa  250  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  39.3 
 
 		 365 aa  248  9e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  40.73 
 
 		 370 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  40.11 
 
 		 373 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  40.23 
 
 		 380 aa  246  4e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  40.41 
 
 		 368 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  40.41 
 
 		 368 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  40.41 
 
 		 368 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  40.41 
 
 		 368 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  40.41 
 
 		 368 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5928  rod shape-determining protein RodA  39.62 
 
 		 378 aa  245  8e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  39.89 
 
 		 370 aa  245  9e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  39.41 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  41 
 
 		 368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  40.12 
 
 		 367 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  40.12 
 
 		 367 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  39.28 
 
 		 368 aa  241  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  39.82 
 
 		 367 aa  241  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  37.85 
 
 		 374 aa  241  2e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  39.53 
 
 		 372 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  40.76 
 
 		 370 aa  239  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  40.12 
 
 		 368 aa  239  5e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  41.27 
 
 		 373 aa  238  9e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  39.36 
 
 		 372 aa  236  4e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  39.88 
 
 		 371 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  41.05 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  38.61 
 
 		 370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  38.89 
 
 		 370 aa  234  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  38.89 
 
 		 370 aa  234  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  41.19 
 
 		 387 aa  233  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  38.89 
 
 		 370 aa  234  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  39.32 
 
 		 374 aa  234  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1169  cell wall shape-determining protein  40.88 
 
 		 370 aa  233  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25541  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1091  cell wall shape-determining protein  41.18 
 
 		 370 aa  232  6e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  38.52 
 
 		 384 aa  232  8.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1371  rod shape-determining protein RodA  39.62 
 
 		 373 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0444396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  40.29 
 
 		 370 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  42.12 
 
 		 371 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  40.29 
 
 		 370 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  40.58 
 
 		 368 aa  231  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  40.29 
 
 		 368 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  40.29 
 
 		 370 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  40.29 
 
 		 370 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  40.29 
 
 		 370 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  40.29 
 
 		 370 aa  229  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  37.39 
 
 		 369 aa  229  7e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  40.62 
 
 		 372 aa  229  7e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  38.29 
 
 		 373 aa  229  8e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00603  cell wall shape-determining protein  40.29 
 
 		 370 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0209477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2992  rod shape-determining protein RodA  40.29 
 
 		 370 aa  228  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000333692  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  40.29 
 
 		 370 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  40.29 
 
 		 370 aa  228  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  40.29 
 
 		 370 aa  228  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000809378  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0723  cell wall shape-determining protein  40.29 
 
 		 370 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000246706  normal  0.373531 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2391  cell cycle protein FtsW  37.7 
 
 		 374 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00202721  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3011  cell wall shape-determining protein  40.29 
 
 		 370 aa  228  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000406019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1200  cell wall shape-determining protein  40.24 
 
 		 370 aa  227  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  37.84 
 
 		 377 aa  228  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2103  cell cycle protein FtsW  37.7 
 
 		 374 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000319192  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  38.44 
 
 		 373 aa  226  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  40.41 
 
 		 368 aa  226  6e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0236  cell wall shape-determining protein  45.58 
 
 		 363 aa  226  6e-58  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  41.14 
 
 		 412 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  38.11 
 
 		 379 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  42.44 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1234  rod shape-determining protein RodA  37.46 
 
 		 366 aa  223  3e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  38.76 
 
 		 373 aa  223  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  40.16 
 
 		 367 aa  222  7e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  45.2 
 
 		 366 aa  222  8e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  38.42 
 
 		 379 aa  222  9e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  38.42 
 
 		 379 aa  222  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0079  putative rod shape-determining transmembrane protein  41.28 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  43.99 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  43.99 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01216  hypothetical protein  38.59 
 
 		 373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  38.58 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  36.29 
 
 		 363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  38.58 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  38.58 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3371  rod shape-determining protein RodA  40.87 
 
 		 384 aa  220  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  34.08 
 
 		 371 aa  220  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>