More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0155 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0155  cell cycle protein  100 
 
 		 429 aa  866    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1454  cell cycle protein  47.91 
 
 		 411 aa  393  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00585  putative transmembrane rod shape-determining protein  50.35 
 
 		 417 aa  363  3e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.510358  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3304  rod shape-determining protein  45.12 
 
 		 434 aa  358  8e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2014  rod shape-determining protein RodA  44.68 
 
 		 427 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0804  rod shape-determining protein RodA  43.54 
 
 		 421 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.901806 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3201  cell cycle protein  41.67 
 
 		 426 aa  334  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000354109  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0245  hypothetical protein  40.14 
 
 		 429 aa  300  2e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0190  cell cycle protein  39.02 
 
 		 429 aa  279  8e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0469067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  33.83 
 
 		 421 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  35.45 
 
 		 407 aa  213  5.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  36.05 
 
 		 407 aa  213  5.999999999999999e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0631  rod shape-determining protein RodA  35.4 
 
 		 418 aa  208  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  35.38 
 
 		 408 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0457  rod shape-determining protein RodA  36.95 
 
 		 412 aa  199  6e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336208  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1392  rod shape-determining protein RodA, putative  53.76 
 
 		 485 aa  195  2e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.011069 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1998  rod shape-determining protein RodA  34.64 
 
 		 408 aa  194  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0307055  normal  0.0830692 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  31.12 
 
 		 380 aa  190  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1792  rod shape-determining protein RodA  35.78 
 
 		 407 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000820178  normal  0.0217876 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1353  rod shape-determining protein RodA  29.19 
 
 		 433 aa  172  9e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  32.13 
 
 		 378 aa  172  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  29.83 
 
 		 366 aa  171  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  29.95 
 
 		 379 aa  169  9e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  30.07 
 
 		 365 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  34.34 
 
 		 412 aa  169  1e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2816  cell cycle protein  28.82 
 
 		 374 aa  167  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2503  cell cycle protein  28.96 
 
 		 438 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000231774  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  28.27 
 
 		 374 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22691  cell division membrane protein  33.86 
 
 		 427 aa  166  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.260767 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  32.75 
 
 		 421 aa  164  4.0000000000000004e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  31.46 
 
 		 426 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  29.21 
 
 		 368 aa  161  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  27.67 
 
 		 374 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  29.66 
 
 		 371 aa  160  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  30.08 
 
 		 367 aa  160  6e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  31.87 
 
 		 419 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  29.83 
 
 		 373 aa  159  7e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  29.88 
 
 		 372 aa  159  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  31.63 
 
 		 417 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  31.63 
 
 		 417 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  33.33 
 
 		 412 aa  159  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  28.81 
 
 		 366 aa  158  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  30.84 
 
 		 438 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  28.75 
 
 		 368 aa  158  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2013  rod shape-determining protein RodA  30.86 
 
 		 385 aa  158  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0547466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  29.85 
 
 		 368 aa  158  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  29.07 
 
 		 368 aa  158  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  28.13 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  29.05 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  29.79 
 
 		 382 aa  156  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  28.43 
 
 		 368 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  28.43 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  28.43 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  33.43 
 
 		 423 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  28.43 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  29.03 
 
 		 366 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  26.8 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3052  rod shape-determining protein RodA  29.53 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  26.8 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  28.68 
 
 		 368 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3169  rod shape-determining protein RodA  29.53 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940392  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1691  cell cycle protein FtsW  30.09 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.951767  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  27.42 
 
 		 378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  28.92 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  28.92 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  28.92 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  34.56 
 
 		 422 aa  154  4e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  27.83 
 
 		 388 aa  153  5.9999999999999996e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  27.73 
 
 		 373 aa  152  8e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  26.89 
 
 		 390 aa  152  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  27.68 
 
 		 367 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  28.68 
 
 		 368 aa  152  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  27.66 
 
 		 370 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  29.26 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  28.88 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  27.68 
 
 		 367 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  27.68 
 
 		 367 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  26.54 
 
 		 377 aa  151  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  28.36 
 
 		 369 aa  151  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  26.03 
 
 		 367 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  27.99 
 
 		 413 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1377  cell cycle protein  28.8 
 
 		 451 aa  150  5e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  31.03 
 
 		 387 aa  150  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  27.83 
 
 		 379 aa  150  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  34.28 
 
 		 422 aa  149  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  31.22 
 
 		 370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20261  cell division membrane protein  32.03 
 
 		 424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.36733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1152  cell division membrane protein  32.02 
 
 		 424 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  29.36 
 
 		 373 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  30.99 
 
 		 370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0322  rod shape-determining protein RodA  28.89 
 
 		 382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  32.77 
 
 		 370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  32.77 
 
 		 370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  32.77 
 
 		 370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  29.15 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  32.77 
 
 		 370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  32.77 
 
 		 370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  31.65 
 
 		 370 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06110  rod shape-determining protein RodA  28.5 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000223269 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  31.09 
 
 		 370 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>