More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0190 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0190  cell cycle protein  100 
 
 		 429 aa  858    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0469067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3304  rod shape-determining protein  45.62 
 
 		 434 aa  349  6e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0804  rod shape-determining protein RodA  43.76 
 
 		 421 aa  338  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.901806 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3201  cell cycle protein  42.86 
 
 		 426 aa  338  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000354109  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2014  rod shape-determining protein RodA  44.13 
 
 		 427 aa  333  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1454  cell cycle protein  39.48 
 
 		 411 aa  298  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0245  hypothetical protein  38.74 
 
 		 429 aa  295  1e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0155  cell cycle protein  39.02 
 
 		 429 aa  290  4e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1392  rod shape-determining protein RodA, putative  36.81 
 
 		 485 aa  266  5.999999999999999e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.011069 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00585  putative transmembrane rod shape-determining protein  40.53 
 
 		 417 aa  264  2e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.510358  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  34.8 
 
 		 421 aa  233  6e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  35.13 
 
 		 407 aa  232  1e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  35.48 
 
 		 408 aa  231  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  34.86 
 
 		 407 aa  227  3e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0631  rod shape-determining protein RodA  37.8 
 
 		 418 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1998  rod shape-determining protein RodA  35.9 
 
 		 408 aa  220  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0307055  normal  0.0830692 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0457  rod shape-determining protein RodA  37.95 
 
 		 412 aa  207  4e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336208  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1792  rod shape-determining protein RodA  35.66 
 
 		 407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000820178  normal  0.0217876 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  33.8 
 
 		 371 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  34.83 
 
 		 373 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  33.83 
 
 		 373 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1353  rod shape-determining protein RodA  31.59 
 
 		 433 aa  181  2.9999999999999997e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  30.72 
 
 		 368 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  30.72 
 
 		 367 aa  180  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  30.72 
 
 		 367 aa  180  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  30.72 
 
 		 367 aa  179  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  31.91 
 
 		 368 aa  179  8e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  30.39 
 
 		 438 aa  179  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  30.55 
 
 		 373 aa  178  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  30.05 
 
 		 372 aa  177  4e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  32.51 
 
 		 426 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  32.54 
 
 		 419 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  30.48 
 
 		 368 aa  176  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  36.53 
 
 		 417 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  36.53 
 
 		 417 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  31.84 
 
 		 368 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  31.78 
 
 		 368 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  31.35 
 
 		 379 aa  173  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  35.58 
 
 		 379 aa  173  6.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  33.93 
 
 		 379 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  33.93 
 
 		 379 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  31.78 
 
 		 368 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  31.78 
 
 		 368 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  31.78 
 
 		 368 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  34.41 
 
 		 373 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  30.32 
 
 		 368 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  29.44 
 
 		 380 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  32.65 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  35.41 
 
 		 421 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  32.69 
 
 		 378 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  30.28 
 
 		 390 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  31.33 
 
 		 373 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  29.95 
 
 		 366 aa  171  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  30.48 
 
 		 372 aa  170  5e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  32 
 
 		 387 aa  170  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  29.95 
 
 		 373 aa  168  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  32 
 
 		 367 aa  168  2e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  48.48 
 
 		 374 aa  167  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  33.06 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  30.48 
 
 		 380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  33.06 
 
 		 364 aa  167  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  33.33 
 
 		 412 aa  166  5e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  33.43 
 
 		 422 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  30.96 
 
 		 371 aa  167  5e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  30.94 
 
 		 369 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  30.32 
 
 		 368 aa  166  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  32.62 
 
 		 366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  30.73 
 
 		 382 aa  166  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1377  cell cycle protein  30.97 
 
 		 451 aa  165  1.0000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  31.18 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  31.31 
 
 		 417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  31.85 
 
 		 377 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  34.77 
 
 		 423 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3371  rod shape-determining protein RodA  30.07 
 
 		 384 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  29.31 
 
 		 366 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  32.6 
 
 		 385 aa  163  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0469  rod shape-determining protein RodA  31.66 
 
 		 379 aa  163  7e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  29.38 
 
 		 382 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  29.38 
 
 		 382 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  29.38 
 
 		 382 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2503  cell cycle protein  27.9 
 
 		 438 aa  162  8.000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000231774  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  30.09 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2957  rod shape-determining protein RodA  29.1 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  30 
 
 		 378 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3647  rod shape-determining protein RodA  29.1 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4036  rod shape-determining protein RodA  29.23 
 
 		 380 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.924124  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  32.17 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3052  rod shape-determining protein RodA  29.86 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  30.59 
 
 		 372 aa  162  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0055  rod shape-determining protein RodA  30.57 
 
 		 380 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00692025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  30.47 
 
 		 413 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0080  rod shape-determining protein RodA  30.56 
 
 		 380 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453004  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2495  rod shape-determining protein RodA  31.52 
 
 		 364 aa  160  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  30.41 
 
 		 412 aa  160  5e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2816  cell cycle protein  30.37 
 
 		 374 aa  160  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  29.13 
 
 		 373 aa  159  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3169  rod shape-determining protein RodA  29.86 
 
 		 382 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940392  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5928  rod shape-determining protein RodA  31 
 
 		 378 aa  159  9e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  32.95 
 
 		 422 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  29.33 
 
 		 386 aa  158  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>