More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0567 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0567  rod shape-determining protein roda  100 
 
 		 360 aa  719    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.398514  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2764  rod shape-determining protein RodA  85.47 
 
 		 359 aa  599  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07034  hypothetical protein  72.35 
 
 		 360 aa  520  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000981  rod shape-determining protein RodA  70.59 
 
 		 360 aa  503  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  48.75 
 
 		 373 aa  335  9e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  49.41 
 
 		 373 aa  331  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  46.72 
 
 		 374 aa  328  8e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  49.7 
 
 		 376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  49.55 
 
 		 383 aa  320  3e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  44.51 
 
 		 368 aa  319  5e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  45.51 
 
 		 367 aa  318  7e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  45.51 
 
 		 367 aa  318  7e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  45.51 
 
 		 367 aa  318  7e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  45.51 
 
 		 368 aa  318  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01216  hypothetical protein  48.03 
 
 		 373 aa  317  2e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  47.35 
 
 		 370 aa  315  5e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  47.35 
 
 		 370 aa  312  4.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  46.07 
 
 		 368 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  44.38 
 
 		 368 aa  311  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  45.79 
 
 		 368 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  45.79 
 
 		 368 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  45.79 
 
 		 368 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  45.94 
 
 		 366 aa  311  2e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  45.51 
 
 		 368 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  47.77 
 
 		 370 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  44.78 
 
 		 368 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  46.33 
 
 		 370 aa  305  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  46.33 
 
 		 370 aa  305  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  46.33 
 
 		 370 aa  305  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  46.33 
 
 		 370 aa  305  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  46.33 
 
 		 370 aa  305  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  44.29 
 
 		 373 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00603  cell wall shape-determining protein  47.48 
 
 		 370 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0209477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2992  rod shape-determining protein RodA  47.48 
 
 		 370 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000333692  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0723  cell wall shape-determining protein  47.48 
 
 		 370 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000246706  normal  0.373531 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1169  cell wall shape-determining protein  48.07 
 
 		 370 aa  304  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25541  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  47.48 
 
 		 370 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3011  cell wall shape-determining protein  47.48 
 
 		 370 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000406019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  47.48 
 
 		 370 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000809378  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  47.48 
 
 		 370 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  47.06 
 
 		 370 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  47.06 
 
 		 370 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  47.06 
 
 		 370 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  45.58 
 
 		 371 aa  303  4.0000000000000003e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  45.38 
 
 		 372 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004223  rod shape-determining protein RodA  47.93 
 
 		 373 aa  302  7.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000217373  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  46.63 
 
 		 370 aa  301  8.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  42.82 
 
 		 371 aa  298  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  46.5 
 
 		 380 aa  295  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  44.41 
 
 		 372 aa  293  3e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1200  cell wall shape-determining protein  48.07 
 
 		 370 aa  291  8e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  43.68 
 
 		 368 aa  291  8e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1091  cell wall shape-determining protein  48.06 
 
 		 370 aa  291  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  44.7 
 
 		 372 aa  286  4e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2710  rod shape-determining protein RodA  47.26 
 
 		 361 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.217076  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  44.19 
 
 		 372 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  44.07 
 
 		 376 aa  280  4e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  43.26 
 
 		 368 aa  278  8e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  44.05 
 
 		 373 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  46.53 
 
 		 366 aa  275  6e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  44.99 
 
 		 370 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0322  rod shape-determining protein RodA  41.67 
 
 		 382 aa  272  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  41.67 
 
 		 382 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1546  rod shape-determining protein RodA  44.91 
 
 		 381 aa  271  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.317218  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1270  rod shape-determining protein RodA  41.93 
 
 		 402 aa  268  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.681615  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3169  rod shape-determining protein RodA  41.69 
 
 		 382 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940392  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3450  rod shape-determining protein RodA  40.97 
 
 		 370 aa  267  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.921865 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  41.69 
 
 		 382 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  41.69 
 
 		 382 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  41.69 
 
 		 382 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  43.92 
 
 		 380 aa  266  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3052  rod shape-determining protein RodA  41.41 
 
 		 382 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  41.69 
 
 		 382 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0615  rod shape-determining protein RodA  43.14 
 
 		 381 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.131957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2495  rod shape-determining protein RodA  40.68 
 
 		 364 aa  264  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0104  rod shape-determining protein RodA  43.02 
 
 		 377 aa  263  4e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1786  rod shape-determining protein RodA  41.19 
 
 		 380 aa  263  4e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04258  rod shape-determining protein RodA  39.04 
 
 		 372 aa  262  8e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239433  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4364  cell cycle protein  42.86 
 
 		 381 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0048  rod shape-determining protein RodA  41.78 
 
 		 382 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3797  rod shape-determining protein RodA  43.98 
 
 		 381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.692479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4859  rod shape-determining protein RodA  42.86 
 
 		 380 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4824  rod-shape-determining protein RodA  42.58 
 
 		 381 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0362  rod shape-determining protein RodA  42.5 
 
 		 382 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0500  rod shape-determining protein RodA  42.22 
 
 		 384 aa  257  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107532 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0079  putative rod shape-determining transmembrane protein  42.86 
 
 		 385 aa  258  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1485  rod shape-determining protein RodA  41.06 
 
 		 380 aa  256  4e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3111  rod shape-determining protein RodA  41.97 
 
 		 382 aa  256  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0177  rod shape-determining protein RodA  41.5 
 
 		 382 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365127  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0158  rod shape-determining protein RodA  41.5 
 
 		 382 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2290  rod shape-determining protein RodA  41.5 
 
 		 382 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.765831  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2789  rod shape-determining protein RodA  41.5 
 
 		 382 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0166  rod shape-determining protein RodA  41.5 
 
 		 382 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2370  rod shape-determining protein RodA  41.5 
 
 		 382 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0236  cell wall shape-determining protein  45.61 
 
 		 363 aa  255  6e-67  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0080  rod shape-determining protein RodA  39.83 
 
 		 380 aa  255  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453004  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4681  rod shape-determining protein RodA  43.14 
 
 		 380 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  39.66 
 
 		 364 aa  255  8e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  43.13 
 
 		 384 aa  255  9e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0055  rod shape-determining protein RodA  40.11 
 
 		 380 aa  255  9e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00692025  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>