More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2368 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2368  cell cycle protein  100 
 
 		 389 aa  777    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0217329  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  33.16 
 
 		 365 aa  193  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  34.41 
 
 		 376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  31.35 
 
 		 367 aa  190  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  33.69 
 
 		 369 aa  189  7e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  32.45 
 
 		 372 aa  187  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0484  cell cycle protein  34.9 
 
 		 509 aa  182  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  33.63 
 
 		 378 aa  179  7e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2816  cell cycle protein  30.95 
 
 		 374 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  31.87 
 
 		 380 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  30.38 
 
 		 388 aa  169  7e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0777  cell division protein FtsW  31.61 
 
 		 361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.968195  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1526  cell cycle protein  34.31 
 
 		 379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66841  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3647  rod shape-determining protein RodA  34.88 
 
 		 390 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2957  rod shape-determining protein RodA  34.88 
 
 		 390 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  31.07 
 
 		 421 aa  163  4.0000000000000004e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  31.82 
 
 		 368 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  30.26 
 
 		 389 aa  162  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  31.4 
 
 		 368 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0621  rod shape-determining protein RodA, putative  34.68 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.898284  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1303  cell division protein FtsW  34.62 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  31.13 
 
 		 368 aa  160  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1234  rod shape-determining protein RodA  33.04 
 
 		 366 aa  159  6e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  31.25 
 
 		 387 aa  159  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  34.42 
 
 		 374 aa  159  7e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2391  cell cycle protein FtsW  32.17 
 
 		 374 aa  159  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00202721  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  31.12 
 
 		 373 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0322  rod shape-determining protein RodA  34.08 
 
 		 382 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  29.78 
 
 		 423 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  30.63 
 
 		 412 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0240  rod shape-determining protein RodA  35.34 
 
 		 380 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  32.74 
 
 		 368 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2103  cell cycle protein FtsW  31.88 
 
 		 374 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000319192  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  30.85 
 
 		 367 aa  156  6e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  30.85 
 
 		 367 aa  156  6e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  30.58 
 
 		 367 aa  156  7e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  28.65 
 
 		 379 aa  155  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  31.25 
 
 		 372 aa  155  8e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  29.26 
 
 		 412 aa  155  9e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  33.44 
 
 		 382 aa  155  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0079  putative rod shape-determining transmembrane protein  31.27 
 
 		 385 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  30.97 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  31 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  28.61 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  30.97 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  30.97 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  30.97 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  32.26 
 
 		 384 aa  155  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0055  rod shape-determining protein RodA  31.45 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00692025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  30.28 
 
 		 363 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1031  cell division protein FtsW  29.05 
 
 		 467 aa  154  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  30.56 
 
 		 378 aa  153  5e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2349  cell cycle protein  30.86 
 
 		 367 aa  152  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  31.85 
 
 		 368 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  30.34 
 
 		 372 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  29.55 
 
 		 426 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  34.91 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  29.78 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  29.91 
 
 		 419 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0846  rod shape-determining protein RodA  33.44 
 
 		 386 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813507 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  31.63 
 
 		 403 aa  150  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  30.47 
 
 		 405 aa  150  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  31.63 
 
 		 364 aa  150  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  30.68 
 
 		 368 aa  149  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  30.7 
 
 		 368 aa  149  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  32.12 
 
 		 384 aa  149  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  32.69 
 
 		 382 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  32.38 
 
 		 413 aa  149  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  30.28 
 
 		 367 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  29.36 
 
 		 366 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  31.1 
 
 		 380 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  29.48 
 
 		 369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  29.79 
 
 		 388 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  33.23 
 
 		 363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  30.19 
 
 		 378 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  29.17 
 
 		 366 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  31.14 
 
 		 386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  30.64 
 
 		 386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3169  rod shape-determining protein RodA  32.69 
 
 		 382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2650  cell cycle protein  32.71 
 
 		 391 aa  147  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.115542  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  29.63 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  32.16 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4040  cell cycle protein  30.21 
 
 		 380 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283521  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0482  cell division protein FtsW  31.82 
 
 		 370 aa  147  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000160421  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  29.31 
 
 		 398 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3052  rod shape-determining protein RodA  32.69 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  32.05 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  32.05 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  32.05 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  28.23 
 
 		 368 aa  146  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  29.44 
 
 		 382 aa  146  5e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22691  cell division membrane protein  27.47 
 
 		 427 aa  146  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.260767 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  28.98 
 
 		 373 aa  146  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2013  rod shape-determining protein RodA  30.4 
 
 		 385 aa  146  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0547466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  32.23 
 
 		 370 aa  145  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  32.23 
 
 		 370 aa  145  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  32.53 
 
 		 370 aa  145  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  28.53 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  29.79 
 
 		 366 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1261  cell cycle protein  32.56 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0112895  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>