More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_17001 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_17001  cell division membrane protein  100 
 
 
426 aa  835    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.746049 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  66.41 
 
 
412 aa  543  1e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22691  cell division membrane protein  65.55 
 
 
427 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.260767 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  67.94 
 
 
412 aa  541  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1152  cell division membrane protein  61.18 
 
 
424 aa  504  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20261  cell division membrane protein  60.24 
 
 
424 aa  498  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.36733  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  53.16 
 
 
423 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  55.26 
 
 
422 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  55.08 
 
 
422 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  54.76 
 
 
422 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  49.01 
 
 
421 aa  372  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  46.96 
 
 
417 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  46.96 
 
 
417 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  46.45 
 
 
417 aa  342  8e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  48.8 
 
 
419 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  45.13 
 
 
426 aa  316  6e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  42.42 
 
 
438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2623  rod shape-determining protein RodA  43.45 
 
 
437 aa  313  3.9999999999999997e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  39.5 
 
 
378 aa  224  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  37.04 
 
 
380 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  41.21 
 
 
387 aa  220  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  38.12 
 
 
369 aa  219  6e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  36.16 
 
 
379 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  36.57 
 
 
376 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  36.16 
 
 
379 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  37.34 
 
 
371 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  37.61 
 
 
365 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  33.42 
 
 
379 aa  213  5.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  36.04 
 
 
368 aa  212  9e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  38.49 
 
 
390 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  37.75 
 
 
379 aa  209  7e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  36.62 
 
 
368 aa  208  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  36.1 
 
 
368 aa  207  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  36.36 
 
 
368 aa  208  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  35.32 
 
 
368 aa  205  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  33.43 
 
 
369 aa  205  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  35.38 
 
 
365 aa  205  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  37.96 
 
 
368 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  37.68 
 
 
372 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  37.96 
 
 
368 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  37.96 
 
 
368 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  35.96 
 
 
371 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  37.96 
 
 
368 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  37.05 
 
 
368 aa  204  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  37.05 
 
 
370 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  33.88 
 
 
384 aa  203  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  37.68 
 
 
367 aa  203  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  36.44 
 
 
382 aa  202  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  36.81 
 
 
378 aa  203  6e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  37.39 
 
 
367 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  37.39 
 
 
367 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  39.57 
 
 
377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3371  rod shape-determining protein RodA  34.82 
 
 
384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  34.55 
 
 
368 aa  199  6e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  37.05 
 
 
370 aa  199  7e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  33.17 
 
 
389 aa  199  9e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  34.07 
 
 
366 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  36.49 
 
 
370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  33.01 
 
 
371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  37.67 
 
 
370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  35.61 
 
 
372 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  37.67 
 
 
370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  35.07 
 
 
371 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  37.67 
 
 
370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  34.08 
 
 
366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3647  rod shape-determining protein RodA  33.95 
 
 
390 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2957  rod shape-determining protein RodA  33.95 
 
 
390 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0500  rod shape-determining protein RodA  38.46 
 
 
384 aa  196  6e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107532 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  35.85 
 
 
366 aa  196  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2824  rod shape-determining protein RodA  37.72 
 
 
371 aa  196  7e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.806923 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  35.33 
 
 
366 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1091  rod shape-determining protein RodA  34.27 
 
 
384 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  35.32 
 
 
368 aa  195  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  32.05 
 
 
374 aa  195  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  34.35 
 
 
366 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  35.18 
 
 
412 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  37.12 
 
 
370 aa  193  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  38.5 
 
 
370 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  38.5 
 
 
370 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  38.5 
 
 
370 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  38.5 
 
 
370 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  38.5 
 
 
370 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00603  cell wall shape-determining protein  37.12 
 
 
370 aa  193  6e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0209477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2992  rod shape-determining protein RodA  37.12 
 
 
370 aa  193  6e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000333692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  37.12 
 
 
370 aa  193  6e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  37.12 
 
 
370 aa  193  6e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000809378  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3011  cell wall shape-determining protein  37.12 
 
 
370 aa  193  6e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000406019  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0723  cell wall shape-determining protein  37.12 
 
 
370 aa  193  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000246706  normal  0.373531 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  37.12 
 
 
370 aa  193  6e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  32.07 
 
 
372 aa  192  7e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  35.73 
 
 
366 aa  192  8e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1169  cell wall shape-determining protein  37.4 
 
 
370 aa  192  9e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25541  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0941  rod shape-determining protein RodA  35.61 
 
 
384 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  33 
 
 
378 aa  192  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3649  rod shape-determining protein RodA  36.01 
 
 
379 aa  192  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.115468 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  35.26 
 
 
405 aa  192  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  37.18 
 
 
373 aa  192  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0846  rod shape-determining protein RodA  33.02 
 
 
386 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0813507 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  34.9 
 
 
366 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1200  cell wall shape-determining protein  35.93 
 
 
370 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>