More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1106 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1106  cell cycle protein  100 
 
 		 371 aa  729    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.860681  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  38.68 
 
 		 366 aa  222  7e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  38.91 
 
 		 372 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  38.91 
 
 		 372 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1203  rod shape-determining protein RodA  36.19 
 
 		 374 aa  215  8e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  40.46 
 
 		 366 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  39.48 
 
 		 368 aa  211  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  37.18 
 
 		 374 aa  209  4e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  36.41 
 
 		 382 aa  209  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  35.63 
 
 		 403 aa  208  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  36.69 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  37.07 
 
 		 364 aa  207  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  40.52 
 
 		 366 aa  207  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  38.22 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0322  rod shape-determining protein RodA  36.31 
 
 		 382 aa  206  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  39.42 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0496  rod shape-determining protein RodA  37.18 
 
 		 366 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0674851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  35.69 
 
 		 368 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  34.4 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  32.66 
 
 		 417 aa  200  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  37.5 
 
 		 366 aa  199  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3371  rod shape-determining protein RodA  34.07 
 
 		 384 aa  199  7e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  33.03 
 
 		 412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  35.96 
 
 		 374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  34.55 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  38.2 
 
 		 365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  33.71 
 
 		 421 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  36.48 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  34.28 
 
 		 369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  34.28 
 
 		 367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  34.28 
 
 		 367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  37.32 
 
 		 369 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  33.99 
 
 		 367 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  35.15 
 
 		 373 aa  196  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  36.95 
 
 		 373 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  32.8 
 
 		 389 aa  196  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  36.39 
 
 		 370 aa  196  8.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  36.95 
 
 		 373 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  35.22 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07034  hypothetical protein  35.11 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5928  rod shape-determining protein RodA  34.72 
 
 		 378 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  35.22 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  35.22 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  34.44 
 
 		 386 aa  194  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  34.23 
 
 		 412 aa  194  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  35.22 
 
 		 368 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0048  rod shape-determining protein RodA  36.59 
 
 		 382 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  35.17 
 
 		 373 aa  193  5e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  35.74 
 
 		 368 aa  192  6e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  33.25 
 
 		 379 aa  192  7e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  33.64 
 
 		 383 aa  192  7e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  36.71 
 
 		 379 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  36.71 
 
 		 379 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0500  rod shape-determining protein RodA  32.79 
 
 		 384 aa  192  8e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107532 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3169  rod shape-determining protein RodA  33.78 
 
 		 382 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940392  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  34.68 
 
 		 377 aa  191  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  36.33 
 
 		 380 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  35.53 
 
 		 370 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  37.2 
 
 		 371 aa  192  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3647  rod shape-determining protein RodA  33.14 
 
 		 390 aa  192  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2957  rod shape-determining protein RodA  33.14 
 
 		 390 aa  192  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  33.78 
 
 		 382 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  33.78 
 
 		 382 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  33.78 
 
 		 382 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  36.04 
 
 		 368 aa  191  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  33.78 
 
 		 382 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0567  rod shape-determining protein roda  37.8 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.398514  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2710  rod shape-determining protein RodA  35.95 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.217076  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  36.58 
 
 		 371 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3052  rod shape-determining protein RodA  33.51 
 
 		 382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  36.49 
 
 		 373 aa  189  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  31.25 
 
 		 365 aa  189  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  31.53 
 
 		 417 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  35.96 
 
 		 368 aa  189  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  31.53 
 
 		 417 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  35.44 
 
 		 368 aa  189  7e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0362  rod shape-determining protein RodA  34.77 
 
 		 382 aa  189  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  38.74 
 
 		 379 aa  189  9e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  33.23 
 
 		 423 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  36.81 
 
 		 371 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0158  rod shape-determining protein RodA  34.77 
 
 		 382 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2789  rod shape-determining protein RodA  34.77 
 
 		 382 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2290  rod shape-determining protein RodA  34.77 
 
 		 382 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.765831  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0177  rod shape-determining protein RodA  34.77 
 
 		 382 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365127  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0672  rod shape-determining protein  33.52 
 
 		 353 aa  188  1e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.722456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2370  rod shape-determining protein RodA  34.77 
 
 		 382 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  36.13 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0166  rod shape-determining protein RodA  34.77 
 
 		 382 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0591  rod shape-determining protein RodA  33.24 
 
 		 373 aa  187  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  37.68 
 
 		 370 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  33.83 
 
 		 376 aa  187  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2764  rod shape-determining protein RodA  36.33 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  39.51 
 
 		 367 aa  187  3e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0142  rod shape-determining protein RodA  34.77 
 
 		 382 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0099283  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  36.18 
 
 		 366 aa  186  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1786  rod shape-determining protein RodA  35.11 
 
 		 380 aa  186  5e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  37.33 
 
 		 376 aa  186  5e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  36.66 
 
 		 373 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  35.03 
 
 		 371 aa  186  5e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  36.67 
 
 		 382 aa  186  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>