More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0497 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  100 
 
 		 420 aa  817    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  75.6 
 
 		 431 aa  501  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  51.4 
 
 		 440 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  60.32 
 
 		 441 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.51 
 
 		 440 aa  322  9.000000000000001e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  39.81 
 
 		 440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16231  GTPase SAR1 and related small G proteins  30.26 
 
 		 413 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.283634  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  38.9 
 
 		 472 aa  232  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.66 
 
 		 413 aa  231  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  35.41 
 
 		 492 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  28.47 
 
 		 413 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  28.68 
 
 		 413 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  35.11 
 
 		 484 aa  215  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  33.25 
 
 		 475 aa  209  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  35.1 
 
 		 489 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  36.71 
 
 		 566 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  33.96 
 
 		 453 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  34.41 
 
 		 479 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  34.41 
 
 		 479 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  38.75 
 
 		 448 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  34.61 
 
 		 462 aa  186  8e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  38.75 
 
 		 448 aa  186  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.25 
 
 		 457 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  40.14 
 
 		 469 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  35.43 
 
 		 481 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  27.7 
 
 		 506 aa  123  7e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  25.74 
 
 		 529 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.93 
 
 		 517 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.72 
 
 		 513 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  26.2 
 
 		 531 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  27.75 
 
 		 520 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  25.13 
 
 		 531 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  31.31 
 
 		 532 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  26.53 
 
 		 545 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  32.28 
 
 		 529 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.77 
 
 		 529 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  28.62 
 
 		 516 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.01 
 
 		 517 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  27.74 
 
 		 517 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.5 
 
 		 499 aa  92.8  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  24.56 
 
 		 499 aa  89  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  23.86 
 
 		 499 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  23.05 
 
 		 496 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  24.82 
 
 		 471 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  27.34 
 
 		 472 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2545  GTP-binding protein EngA  38.71 
 
 		 458 aa  68.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  22.67 
 
 		 492 aa  66.6  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  34.19 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0692  GTP-binding protein EngA  37.4 
 
 		 470 aa  63.2  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  34.85 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  34.85 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  31.84 
 
 		 440 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  24.55 
 
 		 463 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3302  GTP-binding protein EngA  37.1 
 
 		 474 aa  62  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  24.11 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  31.28 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  37.1 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  35.2 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  34.45 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  24.37 
 
 		 481 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0374  GTP-binding protein EngA  35.48 
 
 		 473 aa  59.3  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  32.12 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  28.84 
 
 		 679 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  30.3 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0183  small GTP-binding protein  36.64 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  27.4 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  39.53 
 
 		 455 aa  57  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  41.35 
 
 		 461 aa  57  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19310  small GTP-binding protein  35.54 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00194835  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0488  GTP-binding protein EngA  32.52 
 
 		 483 aa  56.6  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  32.31 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3115  GTP-binding protein EngA  33.59 
 
 		 474 aa  56.2  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0969  Dynamin family protein  45.12 
 
 		 648 aa  56.2  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  31.75 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  33.85 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0548  tRNA modification GTPase TrmE  30.22 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0822  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.66 
 
 		 464 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.460708  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1277  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.89 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038791  hitchhiker  0.00000385407 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2317  GTP-binding protein EngA  34.15 
 
 		 470 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.318648  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  27.51 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1339  GTP-binding protein EngA  27.59 
 
 		 463 aa  55.8  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1538  GTP-binding protein EngA  30.86 
 
 		 516 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000734498 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1445  GTP-binding protein Era  36.84 
 
 		 298 aa  55.1  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1376  GTP-binding protein Era  36.84 
 
 		 298 aa  54.7  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0245  small GTP-binding protein  27.81 
 
 		 403 aa  54.3  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31412  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  28.33 
 
 		 324 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1390  GTP-binding protein EngA  31.54 
 
 		 443 aa  54.7  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1329  GTP-binding protein EngA  31.54 
 
 		 443 aa  54.7  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1572  GTP-binding protein EngA  26.9 
 
 		 460 aa  54.7  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14661  GTP-binding protein Era  29.14 
 
 		 303 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3478  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  31.69 
 
 		 219 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1754  GTP-binding protein Era  31.75 
 
 		 302 aa  54.3  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.141942  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  32.82 
 
 		 408 aa  54.3  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5015  GTP-binding protein EngA  29.35 
 
 		 448 aa  53.9  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2251  GTP-binding protein Era  31.67 
 
 		 311 aa  53.9  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.41102  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0524  GTP-binding protein EngA  26.19 
 
 		 439 aa  53.9  0.000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  33.08 
 
 		 303 aa  53.9  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0473  small GTP-binding protein  31.3 
 
 		 403 aa  53.9  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038153  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4514  GTP-binding protein EngA  33.87 
 
 		 477 aa  53.5  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.194124 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  27.81 
 
 		 299 aa  53.5  0.000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>