126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1575 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  80.95 
 
 		 524 aa  881    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  100 
 
 		 514 aa  1051    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  51.32 
 
 		 510 aa  471  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  53.17 
 
 		 500 aa  471  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  50.75 
 
 		 513 aa  455  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  47.62 
 
 		 555 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  50 
 
 		 561 aa  432  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  46.73 
 
 		 543 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  47.25 
 
 		 528 aa  409  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  46.36 
 
 		 531 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  46.01 
 
 		 518 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  53.45 
 
 		 475 aa  370  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  42.86 
 
 		 515 aa  364  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  40.79 
 
 		 515 aa  337  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  40.1 
 
 		 415 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  40.54 
 
 		 414 aa  274  3e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  36.14 
 
 		 531 aa  262  8.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  81.82 
 
 		 188 aa  259  8e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  35.44 
 
 		 544 aa  250  4e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  35.61 
 
 		 543 aa  250  4e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  35.06 
 
 		 518 aa  248  1e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  34.23 
 
 		 548 aa  243  7.999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  34.62 
 
 		 432 aa  230  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  34.39 
 
 		 533 aa  226  7e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  34.04 
 
 		 426 aa  226  8e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  35.76 
 
 		 561 aa  225  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  35.06 
 
 		 550 aa  225  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  33.82 
 
 		 639 aa  224  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  34.09 
 
 		 432 aa  223  9e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  33.72 
 
 		 437 aa  219  7.999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  33.33 
 
 		 542 aa  218  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  34.48 
 
 		 491 aa  217  4e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  35.14 
 
 		 539 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  34.36 
 
 		 574 aa  213  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  31.81 
 
 		 581 aa  212  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  35.73 
 
 		 531 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  33.52 
 
 		 530 aa  207  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  50.63 
 
 		 658 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  37.8 
 
 		 415 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  45.08 
 
 		 450 aa  197  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  31.47 
 
 		 581 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  31.47 
 
 		 581 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  32.62 
 
 		 629 aa  193  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  46.01 
 
 		 622 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  29.93 
 
 		 563 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  49.58 
 
 		 572 aa  187  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  32.13 
 
 		 604 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  43.21 
 
 		 643 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  39.42 
 
 		 624 aa  179  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  47 
 
 		 529 aa  179  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  28.67 
 
 		 645 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  28.85 
 
 		 632 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  30.36 
 
 		 593 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  29.46 
 
 		 591 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  30.66 
 
 		 589 aa  171  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  43.64 
 
 		 551 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  43.15 
 
 		 578 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  42.13 
 
 		 586 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  42.13 
 
 		 586 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  41.9 
 
 		 571 aa  166  8e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  27.2 
 
 		 600 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  41.96 
 
 		 641 aa  156  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  48.59 
 
 		 666 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  48.59 
 
 		 666 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  30.97 
 
 		 550 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  30.75 
 
 		 606 aa  151  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  31.35 
 
 		 449 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  29.98 
 
 		 568 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  26.4 
 
 		 508 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  31.84 
 
 		 440 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  29.65 
 
 		 383 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  37.66 
 
 		 527 aa  123  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  28.72 
 
 		 384 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  28.32 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  27.97 
 
 		 409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  31.49 
 
 		 262 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1131  porin precursor-like  28.57 
 
 		 371 aa  93.2  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00125322  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  31.49 
 
 		 262 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  41.44 
 
 		 261 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04791  hypothetical protein  28.97 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0282732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11511  porin  28.13 
 
 		 328 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0116362 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0440  porin-like protein  27.11 
 
 		 328 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12271  porin  25.74 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1757  porin-like protein  27.95 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1057  porin-like protein  32.8 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12271  porin  27.72 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19301  hypothetical protein  32.35 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.665373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  25.79 
 
 		 431 aa  73.6  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1130  porin precursor-like  26.95 
 
 		 384 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0788851  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  34.31 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  35.11 
 
 		 485 aa  63.2  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12251  porin  24.24 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.624505  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  35.35 
 
 		 932 aa  59.3  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  36.46 
 
 		 919 aa  57.4  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  36.54 
 
 		 946 aa  57  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  31.76 
 
 		 1036 aa  55.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  34.19 
 
 		 673 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  31.63 
 
 		 441 aa  55.1  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  38.46 
 
 		 408 aa  54.7  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12261  porin  25.98 
 
 		 399 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>