42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0440 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0440  porin-like protein  100 
 
 		 328 aa  645    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11511  porin  97.87 
 
 		 328 aa  607  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0116362 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1057  porin-like protein  40.71 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19301  hypothetical protein  40.35 
 
 		 336 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.665373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1757  porin-like protein  39.23 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04791  hypothetical protein  38.64 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0282732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  34.92 
 
 		 450 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  27.47 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  28.5 
 
 		 383 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12271  porin  29.95 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12261  porin  28.68 
 
 		 399 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  27.74 
 
 		 384 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  28.37 
 
 		 415 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1131  porin precursor-like  28.57 
 
 		 371 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00125322  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  27 
 
 		 431 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  27.57 
 
 		 390 aa  99.4  7e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1130  porin precursor-like  27.62 
 
 		 384 aa  96.3  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0788851  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  26.23 
 
 		 409 aa  92.8  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  27.92 
 
 		 440 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  27.08 
 
 		 449 aa  86.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  26.85 
 
 		 514 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  27.15 
 
 		 528 aa  80.9  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  26.81 
 
 		 515 aa  79.7  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  24.03 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  27 
 
 		 513 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12271  porin  27.54 
 
 		 355 aa  76.3  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  26.81 
 
 		 531 aa  76.3  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  24.48 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  25.59 
 
 		 515 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  26.27 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  25.94 
 
 		 524 aa  72  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  26.21 
 
 		 500 aa  70.9  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  24.74 
 
 		 543 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12251  porin  26.29 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.624505  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  25.95 
 
 		 437 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  26.52 
 
 		 518 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  24.09 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  25 
 
 		 510 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  22.83 
 
 		 555 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  27.63 
 
 		 475 aa  46.6  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  24.09 
 
 		 639 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  75 
 
 		 188 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>