55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1757 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1757  porin-like protein  100 
 
 		 332 aa  626  1e-178  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04791  hypothetical protein  92.79 
 
 		 333 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0282732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1057  porin-like protein  82.39 
 
 		 335 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19301  hypothetical protein  81.25 
 
 		 336 aa  468  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.665373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  44.05 
 
 		 450 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0440  porin-like protein  39.23 
 
 		 328 aa  179  7e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11511  porin  39.23 
 
 		 328 aa  176  7e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0116362 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  34 
 
 		 431 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  31.44 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  32.22 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12261  porin  32.29 
 
 		 399 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12271  porin  32.92 
 
 		 385 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  32.33 
 
 		 383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12271  porin  33.69 
 
 		 355 aa  113  6e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  28.39 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  29.69 
 
 		 426 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12251  porin  32.47 
 
 		 369 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.624505  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  29.81 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  30.77 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1131  porin precursor-like  29.69 
 
 		 371 aa  96.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00125322  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  25.81 
 
 		 409 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  27.29 
 
 		 432 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  29.49 
 
 		 514 aa  92  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  26.94 
 
 		 432 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  26.6 
 
 		 515 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1130  porin precursor-like  28.21 
 
 		 384 aa  87  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0788851  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  26.72 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  27.61 
 
 		 515 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  26.75 
 
 		 524 aa  83.2  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  27.58 
 
 		 543 aa  82.4  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  26.14 
 
 		 528 aa  80.1  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  26.04 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  33.04 
 
 		 518 aa  77.4  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  25.44 
 
 		 510 aa  73.6  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  28.88 
 
 		 531 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  27.32 
 
 		 500 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  31.9 
 
 		 555 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  27.61 
 
 		 449 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  23.44 
 
 		 550 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  29.44 
 
 		 475 aa  59.7  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  25 
 
 		 513 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  25.94 
 
 		 531 aa  53.9  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  33.33 
 
 		 527 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  28.72 
 
 		 561 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  31.43 
 
 		 639 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  34.71 
 
 		 551 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  24.29 
 
 		 581 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  24.29 
 
 		 581 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  31.01 
 
 		 561 aa  47.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  87.5 
 
 		 188 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  31.13 
 
 		 548 aa  47  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  27.54 
 
 		 581 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  30.71 
 
 		 491 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  29.79 
 
 		 544 aa  43.9  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  41.25 
 
 		 550 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>