72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_12271 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_12261  porin  88 
 
 		 399 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12271  porin  100 
 
 		 385 aa  747    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1131  porin precursor-like  59.8 
 
 		 371 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00125322  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  58.81 
 
 		 449 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  54.99 
 
 		 383 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1130  porin precursor-like  51.72 
 
 		 384 aa  323  3e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0788851  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12271  porin  50.64 
 
 		 355 aa  305  8.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12251  porin  43.67 
 
 		 369 aa  239  4e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.624505  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  36.86 
 
 		 440 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  31.44 
 
 		 426 aa  153  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  31.1 
 
 		 432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  30.6 
 
 		 437 aa  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  30.79 
 
 		 432 aa  139  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  32.46 
 
 		 431 aa  132  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  31.71 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  29.82 
 
 		 414 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1757  porin-like protein  33 
 
 		 332 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  32.14 
 
 		 450 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  32.01 
 
 		 415 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11511  porin  31.39 
 
 		 328 aa  109  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0116362 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04791  hypothetical protein  32.83 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0282732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1057  porin-like protein  31.51 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0440  porin-like protein  30.96 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19301  hypothetical protein  31.5 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.665373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  28.61 
 
 		 515 aa  99.8  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  28.68 
 
 		 515 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  25.49 
 
 		 528 aa  86.3  7e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  25.36 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  28.12 
 
 		 513 aa  83.6  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  26.41 
 
 		 518 aa  80.5  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  33.63 
 
 		 555 aa  80.1  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  28.47 
 
 		 514 aa  79.7  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  28.37 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  26.74 
 
 		 543 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  27.21 
 
 		 524 aa  76.3  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  26.6 
 
 		 531 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  23.82 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  31.72 
 
 		 475 aa  67.4  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  25.91 
 
 		 531 aa  66.2  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  25.85 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  27.44 
 
 		 561 aa  62.8  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  24.59 
 
 		 581 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  24.59 
 
 		 581 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  33.81 
 
 		 500 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  42.71 
 
 		 578 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  27.44 
 
 		 550 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  35.61 
 
 		 639 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  29.68 
 
 		 544 aa  55.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  29.63 
 
 		 600 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  32.52 
 
 		 530 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  31.11 
 
 		 561 aa  50.8  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  30.97 
 
 		 572 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  36.05 
 
 		 548 aa  50.8  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  32.09 
 
 		 491 aa  50.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  33.99 
 
 		 658 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  24.71 
 
 		 574 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  38.37 
 
 		 641 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  31.85 
 
 		 533 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  25.47 
 
 		 543 aa  46.6  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  35.59 
 
 		 539 aa  46.6  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  39.58 
 
 		 542 aa  46.6  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  34.85 
 
 		 589 aa  46.2  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  31.88 
 
 		 518 aa  46.2  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  34.17 
 
 		 527 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  37.36 
 
 		 568 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  36.11 
 
 		 629 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  42.68 
 
 		 551 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  24.83 
 
 		 531 aa  43.1  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  34.69 
 
 		 563 aa  43.1  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  35.42 
 
 		 643 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  36.78 
 
 		 606 aa  42.7  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  35.92 
 
 		 622 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>