44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1130 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1130  porin precursor-like  100 
 
 		 384 aa  756    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0788851  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1131  porin precursor-like  88.54 
 
 		 371 aa  628  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00125322  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12261  porin  55.53 
 
 		 399 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  49.49 
 
 		 383 aa  328  7e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12271  porin  51.72 
 
 		 385 aa  322  8e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12251  porin  48.45 
 
 		 369 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.624505  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  39.07 
 
 		 449 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12271  porin  43.15 
 
 		 355 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  34 
 
 		 440 aa  185  9e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  35.45 
 
 		 437 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  32.18 
 
 		 432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  34.42 
 
 		 415 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  30.48 
 
 		 432 aa  154  4e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  30.61 
 
 		 426 aa  133  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  29.72 
 
 		 415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  29.29 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  29.41 
 
 		 450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  31 
 
 		 431 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  25.43 
 
 		 515 aa  97.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0440  porin-like protein  27.88 
 
 		 328 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11511  porin  27.62 
 
 		 328 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0116362 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  24.81 
 
 		 515 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1757  porin-like protein  28.21 
 
 		 332 aa  82.8  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1057  porin-like protein  26.77 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19301  hypothetical protein  26.77 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.665373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  24.94 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  27.13 
 
 		 514 aa  77  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04791  hypothetical protein  26.77 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0282732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  26.75 
 
 		 524 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  27.51 
 
 		 510 aa  73.6  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  24.48 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  26.19 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  25.91 
 
 		 513 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  25.74 
 
 		 543 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  25.82 
 
 		 531 aa  59.7  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  24.76 
 
 		 561 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  24.67 
 
 		 518 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  25.22 
 
 		 528 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  24.46 
 
 		 500 aa  54.3  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  24.47 
 
 		 555 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  27.68 
 
 		 578 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  50 
 
 		 188 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  25.21 
 
 		 531 aa  44.3  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  28.92 
 
 		 475 aa  43.5  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>