51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_19301 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_19301  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  630  1e-180  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.665373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1057  porin-like protein  97.02 
 
 		 335 aa  586  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04791  hypothetical protein  84.52 
 
 		 333 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0282732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1757  porin-like protein  81.25 
 
 		 332 aa  468  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  44.03 
 
 		 450 aa  202  8e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0440  porin-like protein  41.76 
 
 		 328 aa  196  6e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11511  porin  41.76 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0116362 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  32.83 
 
 		 431 aa  146  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  32.07 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  29.06 
 
 		 426 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  31.22 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12271  porin  31.03 
 
 		 385 aa  109  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  29.74 
 
 		 415 aa  108  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12261  porin  30.99 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12271  porin  31.38 
 
 		 355 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  28.21 
 
 		 390 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  30.52 
 
 		 415 aa  96.3  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12251  porin  30 
 
 		 369 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.624505  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  29.29 
 
 		 384 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  28.02 
 
 		 432 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1131  porin precursor-like  27.68 
 
 		 371 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00125322  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  26.98 
 
 		 409 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  26.54 
 
 		 440 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  27.9 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1130  porin precursor-like  26.77 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0788851  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  25.17 
 
 		 432 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  27.11 
 
 		 514 aa  77.4  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  27.09 
 
 		 510 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  29.33 
 
 		 528 aa  73.2  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  34.22 
 
 		 515 aa  72.8  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  30.98 
 
 		 515 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  25.57 
 
 		 543 aa  70.1  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  32.8 
 
 		 500 aa  70.1  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  29.41 
 
 		 518 aa  69.7  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  23.75 
 
 		 524 aa  69.3  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  30.49 
 
 		 555 aa  69.3  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  28.64 
 
 		 475 aa  62.4  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  24.59 
 
 		 531 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  27.14 
 
 		 449 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  28.79 
 
 		 513 aa  56.6  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  25.57 
 
 		 548 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  31.06 
 
 		 551 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  26.84 
 
 		 561 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  28.7 
 
 		 639 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  25.2 
 
 		 550 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  83.33 
 
 		 188 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  25.63 
 
 		 581 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  23.02 
 
 		 531 aa  44.3  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  27.27 
 
 		 518 aa  43.9  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  28.12 
 
 		 622 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  31.58 
 
 		 533 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>