64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_12111 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_13341  porin  86.89 
 
 
426 aa  741    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  100 
 
 
415 aa  842    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  54.44 
 
 
432 aa  438  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  54.32 
 
 
432 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  42.66 
 
 
415 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  44.52 
 
 
437 aa  316  4e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  41.38 
 
 
414 aa  290  4e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  34.92 
 
 
515 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  36.34 
 
 
515 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  32.52 
 
 
524 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  37.8 
 
 
514 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12261  porin  34.19 
 
 
399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1130  porin precursor-like  33.95 
 
 
384 aa  180  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0788851  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  35.29 
 
 
383 aa  179  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12251  porin  32.79 
 
 
369 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.624505  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  29.54 
 
 
510 aa  146  6e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1131  porin precursor-like  31.54 
 
 
371 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00125322  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  28.21 
 
 
513 aa  144  3e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12271  porin  31.78 
 
 
385 aa  143  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  30.69 
 
 
528 aa  138  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  30.79 
 
 
543 aa  133  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  31.22 
 
 
518 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1057  porin-like protein  31.21 
 
 
335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  30.56 
 
 
431 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  30.71 
 
 
500 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  29.44 
 
 
450 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  29.98 
 
 
555 aa  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12271  porin  31.54 
 
 
355 aa  122  8e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  26.3 
 
 
390 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19301  hypothetical protein  30.52 
 
 
336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.665373  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04791  hypothetical protein  30.44 
 
 
333 aa  116  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0282732  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1757  porin-like protein  29.98 
 
 
332 aa  116  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  25.33 
 
 
409 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  25.29 
 
 
384 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  25.51 
 
 
449 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  26.67 
 
 
531 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  29.44 
 
 
561 aa  95.1  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11511  porin  26.6 
 
 
328 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0116362 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  24.89 
 
 
440 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0440  porin-like protein  25.65 
 
 
328 aa  87  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  26.16 
 
 
531 aa  79.3  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  25.41 
 
 
491 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  25.42 
 
 
518 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  25.19 
 
 
544 aa  63.9  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  23.62 
 
 
571 aa  62.8  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  26.49 
 
 
543 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  24.47 
 
 
624 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  25 
 
 
574 aa  60.1  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  24.54 
 
 
548 aa  59.7  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  27.05 
 
 
475 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  27.09 
 
 
561 aa  57  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  56.86 
 
 
188 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  23.02 
 
 
581 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  26.44 
 
 
639 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  23.27 
 
 
550 aa  53.1  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  36.36 
 
 
551 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  21.99 
 
 
589 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  25.35 
 
 
533 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  32.23 
 
 
645 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  32.23 
 
 
632 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  23.37 
 
 
530 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  23.92 
 
 
581 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  23.92 
 
 
581 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  27.05 
 
 
658 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>