44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_12261 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_12271  porin  88 
 
 
385 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12261  porin  100 
 
 
399 aa  773    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  48.7 
 
 
449 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1130  porin precursor-like  55.53 
 
 
384 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0788851  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  49.76 
 
 
383 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1131  porin precursor-like  50.74 
 
 
371 aa  317  3e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00125322  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12251  porin  46.65 
 
 
369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.624505  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12271  porin  43.07 
 
 
355 aa  235  9e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  31.97 
 
 
440 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  34.42 
 
 
415 aa  153  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  30.98 
 
 
426 aa  139  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  30.79 
 
 
432 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  30.51 
 
 
437 aa  126  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  29.28 
 
 
432 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  31.59 
 
 
431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1757  porin-like protein  32.45 
 
 
332 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1057  porin-like protein  31.18 
 
 
335 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04791  hypothetical protein  32.2 
 
 
333 aa  109  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0282732  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  30.27 
 
 
415 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11511  porin  30.07 
 
 
328 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0116362 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19301  hypothetical protein  30.99 
 
 
336 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.665373  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  28.12 
 
 
414 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0440  porin-like protein  29.66 
 
 
328 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  30.61 
 
 
450 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  28.41 
 
 
384 aa  83.6  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  24.88 
 
 
390 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  26.74 
 
 
515 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  27.35 
 
 
515 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  23.6 
 
 
409 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  23.64 
 
 
528 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  26.42 
 
 
513 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  24.61 
 
 
518 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  26.77 
 
 
514 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  31.16 
 
 
555 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  61.11 
 
 
531 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  61.11 
 
 
543 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  61.11 
 
 
188 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  25 
 
 
524 aa  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  23.78 
 
 
581 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  23.78 
 
 
581 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  61.11 
 
 
500 aa  47.8  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  58.33 
 
 
510 aa  46.6  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  24.62 
 
 
531 aa  46.2  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  28.92 
 
 
475 aa  43.1  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>