More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1219 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1219  short chain dehydrogenase  100 
 
 
243 aa  501  1e-141  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4050  short chain dehydrogenase  53.91 
 
 
243 aa  271  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2832  short chain dehydrogenase  48.33 
 
 
244 aa  241  6e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0580098  normal  0.214495 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0143  short chain dehydrogenase  45.45 
 
 
243 aa  231  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1026  short chain dehydrogenase  44.4 
 
 
270 aa  205  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.969015  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5791  short chain dehydrogenase  41.74 
 
 
249 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2164  short chain dehydrogenase  42.56 
 
 
247 aa  202  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1597  short chain dehydrogenase  41.49 
 
 
245 aa  201  9e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139184  normal  0.109463 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.904003  normal  0.571542 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1950  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 
246 aa  195  6e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3786  short chain dehydrogenase  40.49 
 
 
246 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0896  short chain dehydrogenase  39.68 
 
 
246 aa  191  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3976  short chain dehydrogenase  43.75 
 
 
245 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00930617  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2567  short chain dehydrogenase  40.65 
 
 
245 aa  188  7e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0171  short chain dehydrogenase  39.27 
 
 
246 aa  186  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.808724 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6249  short chain dehydrogenase  40.49 
 
 
245 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7180  short chain dehydrogenase  41.74 
 
 
248 aa  182  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367118  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2273  short chain dehydrogenase  38.06 
 
 
246 aa  182  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  0.452458 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2301  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 
246 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00458311  hitchhiker  0.00750193 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03335  putative oxidoreductase  38.78 
 
 
240 aa  173  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
248 aa  171  9e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 
244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 
241 aa  153  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.914636  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
247 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.500614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
251 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0498  short chain dehydrogenase  36.84 
 
 
243 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.795397 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
249 aa  139  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.726547  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
249 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 
245 aa  137  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01390  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  33.61 
 
 
251 aa  135  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.253341 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22830  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  32.64 
 
 
247 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.702609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.362714  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1708  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 
250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361807  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0680281  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 
256 aa  126  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
255 aa  125  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
246 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
254 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 
247 aa  123  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286474  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 
257 aa  122  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12109  short-chain type dehydrogenase  32.37 
 
 
249 aa  122  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0969854  normal  0.809118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5628  short chain dehydrogenase  31.01 
 
 
260 aa  122  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
249 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.786749  normal  0.588294 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
249 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
249 aa  116  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13825  short chain dehydrogenase  29.92 
 
 
254 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1177  short chain dehydrogenase  29.46 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56412  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.61 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 
254 aa  112  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5001  short chain dehydrogenase  28.46 
 
 
256 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5382  short chain dehydrogenase  28.46 
 
 
256 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5089  short chain dehydrogenase  28.46 
 
 
256 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 
253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.67 
 
 
238 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136725 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2296  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.46 
 
 
238 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0366896 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2462  putative short chain dehydrogenase  28.92 
 
 
255 aa  98.2  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1759  hypothetical protein  30.42 
 
 
240 aa  97.1  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1759  hypothetical protein  28.93 
 
 
240 aa  95.9  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2534  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
247 aa  95.9  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.69 
 
 
245 aa  94  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.72 
 
 
260 aa  91.3  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.2 
 
 
242 aa  90.9  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.1 
 
 
247 aa  90.9  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0117  short chain dehydrogenase  28.34 
 
 
250 aa  90.1  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0449  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.81 
 
 
257 aa  89.4  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.237578  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13470  short chain dehydrogenase  27.64 
 
 
251 aa  89.4  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.82 
 
 
244 aa  88.2  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.46714  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.87 
 
 
249 aa  85.1  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.6 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000362575 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.89 
 
 
252 aa  84  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.65 
 
 
272 aa  84  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2452  short chain dehydrogenase  27.2 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  26.75 
 
 
261 aa  82  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.15 
 
 
257 aa  81.6  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2218  short chain dehydrogenase  24.49 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.44 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3487  short chain dehydrogenase  27.05 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.48 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200417  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1201  short chain dehydrogenase  27.45 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0718298  normal  0.0224844 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.67 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0469  short chain dehydrogenase  26.61 
 
 
292 aa  78.6  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.27 
 
 
257 aa  78.6  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.34 
 
 
261 aa  78.6  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.49 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.576341  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1188  short chain dehydrogenase  27.45 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0152839  normal  0.145128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.24 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.596662  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0352  short chain dehydrogenase  29.19 
 
 
259 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.7 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.22 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.892025  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.48 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.48 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4129  short chain dehydrogenase  27.46 
 
 
270 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3288  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  25.12 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2168  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  25.12 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408948  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1671  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.49 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>