More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3054 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  100 
 
 		 197 aa  397  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0334  Ribonuclease H  59.49 
 
 		 199 aa  223  1e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  52.02 
 
 		 210 aa  188  5e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  57.61 
 
 		 242 aa  185  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  53.33 
 
 		 214 aa  182  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  55.26 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  52.72 
 
 		 256 aa  180  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  45.88 
 
 		 206 aa  174  9e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  53.07 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  51.65 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  51.87 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  48.42 
 
 		 211 aa  167  9e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  51.63 
 
 		 209 aa  166  1e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  49.73 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  52.25 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  49.19 
 
 		 198 aa  164  5.9999999999999996e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  50.54 
 
 		 209 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  50.54 
 
 		 209 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  50.83 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  44.9 
 
 		 207 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  50.84 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  53.11 
 
 		 203 aa  162  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  46.35 
 
 		 199 aa  161  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2192  RNase HII  50.28 
 
 		 218 aa  161  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  49.72 
 
 		 198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  52.46 
 
 		 255 aa  161  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 240 aa  161  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 202 aa  160  9e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 202 aa  160  9e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  51.12 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  47.47 
 
 		 272 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  48.66 
 
 		 272 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  47.22 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  48.7 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  47.8 
 
 		 225 aa  159  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 229 aa  158  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  44.32 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  46.11 
 
 		 216 aa  158  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  47.59 
 
 		 212 aa  157  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  45.76 
 
 		 206 aa  157  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1910  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 216 aa  157  8e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  46.52 
 
 		 210 aa  157  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  49.16 
 
 		 218 aa  156  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  47.49 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  46.91 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 267 aa  155  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  42.29 
 
 		 205 aa  155  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  47.85 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  50.81 
 
 		 245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  46.93 
 
 		 214 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  46.93 
 
 		 214 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  49.18 
 
 		 253 aa  154  7e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  46.93 
 
 		 214 aa  154  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  47.67 
 
 		 254 aa  154  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 217 aa  154  8e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  45.64 
 
 		 257 aa  154  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  46.37 
 
 		 214 aa  154  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2002  ribonuclease HII  51.4 
 
 		 207 aa  154  9e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  50.56 
 
 		 209 aa  153  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  51.09 
 
 		 213 aa  153  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  47.54 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  49.2 
 
 		 202 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  45.81 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  45.81 
 
 		 217 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  47.75 
 
 		 257 aa  152  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  45.81 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  46 
 
 		 198 aa  152  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  50.56 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  51.11 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  46.93 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  48.6 
 
 		 240 aa  152  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  46.93 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  48.02 
 
 		 279 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  43.46 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  48.6 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  47.75 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  49.44 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  48.6 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  50.84 
 
 		 208 aa  152  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  48.92 
 
 		 211 aa  152  4e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  49.72 
 
 		 308 aa  152  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  46.49 
 
 		 229 aa  151  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  45.5 
 
 		 198 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  47.49 
 
 		 201 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  47.06 
 
 		 204 aa  151  5.9999999999999996e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  47.49 
 
 		 201 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  48.6 
 
 		 255 aa  151  7e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  51.61 
 
 		 238 aa  150  8e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  48.04 
 
 		 217 aa  150  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  51.61 
 
 		 238 aa  150  8e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  47.19 
 
 		 197 aa  150  8.999999999999999e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0011  ribonuclease HII  46.03 
 
 		 208 aa  150  8.999999999999999e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150276  normal  0.177364 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  47.59 
 
 		 193 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  48.04 
 
 		 250 aa  150  8.999999999999999e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  46.15 
 
 		 221 aa  150  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  50.8 
 
 		 217 aa  149  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  50 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  46.07 
 
 		 202 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  45.74 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>