220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2733 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 
360 aa  720    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  24.66 
 
 
356 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  24.73 
 
 
359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  24.65 
 
 
356 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  25.07 
 
 
360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  23.86 
 
 
391 aa  111  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  25.54 
 
 
359 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  24.6 
 
 
434 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  23.78 
 
 
391 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  23.89 
 
 
358 aa  106  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  23.12 
 
 
359 aa  106  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  24.16 
 
 
364 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  24.24 
 
 
359 aa  104  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  25.4 
 
 
374 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  24.66 
 
 
387 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  23.18 
 
 
388 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  21.88 
 
 
360 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  23.56 
 
 
360 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  24.54 
 
 
401 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  23.39 
 
 
365 aa  99  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  20.79 
 
 
361 aa  99  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  23.45 
 
 
394 aa  95.5  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  24.8 
 
 
401 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  25.53 
 
 
367 aa  93.6  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  23.91 
 
 
370 aa  92.8  7e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  22.99 
 
 
418 aa  92.4  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  22.55 
 
 
360 aa  92.4  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  24.15 
 
 
382 aa  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  21.07 
 
 
359 aa  90.9  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  23.5 
 
 
400 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  22.7 
 
 
359 aa  90.5  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  23.12 
 
 
392 aa  90.1  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  25.41 
 
 
389 aa  89.4  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  23.25 
 
 
391 aa  88.6  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  22.25 
 
 
395 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  21.94 
 
 
1153 aa  88.6  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  23.92 
 
 
360 aa  86.7  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  24.19 
 
 
362 aa  86.7  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  21.88 
 
 
362 aa  86.3  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  23.14 
 
 
391 aa  85.9  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6917  permease YjgP/YjgQ family protein  23.73 
 
 
359 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  normal  0.723746 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  21.98 
 
 
395 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  24.16 
 
 
1040 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  21.75 
 
 
384 aa  84.7  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  21.45 
 
 
386 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0027  permease YjgP/YjgQ family protein  23.99 
 
 
357 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  24.18 
 
 
357 aa  82.8  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  21.94 
 
 
1111 aa  82.4  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  21.45 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 
423 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00860  hypothetical protein  23.92 
 
 
359 aa  80.5  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  22.5 
 
 
792 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  24.03 
 
 
359 aa  79  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  23.56 
 
 
403 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  20.82 
 
 
1061 aa  76.3  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  23.28 
 
 
418 aa  75.9  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  23.08 
 
 
360 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  20.55 
 
 
1061 aa  75.5  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  20.27 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  21.33 
 
 
401 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  21.14 
 
 
366 aa  73.6  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  22.3 
 
 
358 aa  72.8  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  17.08 
 
 
360 aa  72.8  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  23.98 
 
 
364 aa  72.8  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  20.05 
 
 
391 aa  72  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  23.36 
 
 
358 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  20.17 
 
 
1096 aa  69.7  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  21.02 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  22.22 
 
 
359 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  21.33 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  22.55 
 
 
363 aa  68.2  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0106  permease YjgP/YjgQ family protein  22.25 
 
 
356 aa  68.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3066  permease YjgP/YjgQ family protein  22.38 
 
 
355 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.326563 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  21.33 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  21.33 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  20.53 
 
 
396 aa  66.2  0.0000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  20.87 
 
 
357 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  20.62 
 
 
360 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  23.1 
 
 
395 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  22.4 
 
 
358 aa  61.6  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  21.15 
 
 
358 aa  61.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  19.12 
 
 
378 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1016  permease YjgP/YjgQ family protein  22.7 
 
 
352 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00281225  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  20.11 
 
 
358 aa  59.3  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  22.47 
 
 
395 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1230  permease YjgP/YjgQ family protein  20.27 
 
 
376 aa  58.5  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.494831  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1141  putative permease  21.35 
 
 
355 aa  58.2  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  19.94 
 
 
369 aa  57.8  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0054  permease YjgP/YjgQ  21.97 
 
 
408 aa  57  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.520112 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  22.4 
 
 
353 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  19.95 
 
 
356 aa  56.6  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  17.93 
 
 
369 aa  56.6  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  21.02 
 
 
353 aa  56.2  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2101  hypothetical protein  22.64 
 
 
356 aa  56.2  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0046  hypothetical protein  20.2 
 
 
402 aa  56.2  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  19.46 
 
 
370 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  19.46 
 
 
370 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  21.07 
 
 
370 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  31.78 
 
 
498 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  18.33 
 
 
371 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>