More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0488 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 253 aa  520  1e-146  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.55 
 
 		 252 aa  360  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.203943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.32 
 
 		 256 aa  344  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1452  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.52 
 
 		 259 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.47 
 
 		 253 aa  330  1e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.2 
 
 		 254 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0490038  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.27 
 
 		 250 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.32 
 
 		 253 aa  305  6e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.355972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.83 
 
 		 255 aa  302  4.0000000000000003e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.69 
 
 		 254 aa  296  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.43 
 
 		 251 aa  296  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4321  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.77 
 
 		 251 aa  295  5e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.91 
 
 		 254 aa  292  4e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91487  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.22 
 
 		 259 aa  291  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.33 
 
 		 254 aa  291  6e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.199031 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.56 
 
 		 252 aa  290  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.32 
 
 		 251 aa  289  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.22 
 
 		 256 aa  285  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.02 
 
 		 255 aa  285  5e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.4 
 
 		 252 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.281349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.97 
 
 		 256 aa  281  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.87 
 
 		 253 aa  279  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.87 
 
 		 253 aa  278  6e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1990  oxidoreductase  54.18 
 
 		 254 aa  278  7e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1730  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  55.28 
 
 		 256 aa  277  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.87 
 
 		 253 aa  276  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.87 
 
 		 253 aa  276  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.87 
 
 		 253 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.06 
 
 		 253 aa  271  9e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.61 
 
 		 251 aa  267  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.94 
 
 		 269 aa  265  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.5 
 
 		 251 aa  263  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.18 
 
 		 269 aa  263  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167231  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.59 
 
 		 254 aa  263  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.37 
 
 		 194 aa  261  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000473762 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.4 
 
 		 263 aa  257  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 		 254 aa  257  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 252 aa  254  9e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58328  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 		 250 aa  248  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0215528 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2597  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  50.2 
 
 		 252 aa  246  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 		 252 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673149  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3073  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  48.41 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175378  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.2 
 
 		 275 aa  231  8.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 		 256 aa  226  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000552143 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.38 
 
 		 247 aa  224  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.86 
 
 		 247 aa  218  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32440  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  43.37 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.77 
 
 		 277 aa  212  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 		 250 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 		 248 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 		 248 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 		 248 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 		 254 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 		 255 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 253 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  40.87 
 
 		 257 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  40.87 
 
 		 254 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  40.87 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  40.87 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00687705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  40.87 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.293604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  39.68 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.1 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204744  normal  0.374158 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 254 aa  158  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.260797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1886  short chain dehydrogenase  39.68 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1689  short chain dehydrogenase  39.68 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1712  short chain dehydrogenase  39.29 
 
 		 252 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1847  short chain dehydrogenase  39.29 
 
 		 252 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 		 252 aa  156  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5176  short-chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 254 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0340709  hitchhiker  0.00401231 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1664  short chain dehydrogenase  39.61 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316007  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.69 
 
 		 247 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 		 252 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4562  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0570869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1705  short chain dehydrogenase  39.29 
 
 		 252 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 		 246 aa  152  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1932  short chain dehydrogenase  39.61 
 
 		 252 aa  152  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.362835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1849  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 252 aa  152  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 		 249 aa  152  5e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 		 265 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 248 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0549  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  35.86 
 
 		 248 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.613292 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 		 250 aa  148  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1091  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  38.49 
 
 		 246 aa  149  6e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0983747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 		 262 aa  148  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 248 aa  148  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>