More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1426 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
634 aa  1258    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.57 
 
 
640 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  40.51 
 
 
629 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  41.64 
 
 
638 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0728  chemotaxis sensory transducer  40.75 
 
 
639 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.43 
 
 
638 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.8 
 
 
640 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.27 
 
 
638 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.11 
 
 
638 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  38.43 
 
 
633 aa  369  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.21 
 
 
619 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.48 
 
 
638 aa  362  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5092  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.13 
 
 
640 aa  361  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5160  methyl-accepting chemotaxis protein  41.01 
 
 
647 aa  360  6e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.391343  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  40.4 
 
 
647 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.27 
 
 
639 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.38 
 
 
647 aa  350  5e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0828859  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.58 
 
 
739 aa  350  5e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247309  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5159  methyl-accepting chemotaxis protein  40.61 
 
 
638 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5553  methyl-accepting chemotaxis protein  38.5 
 
 
640 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5811  putative chemotaxis transducer  40.74 
 
 
647 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0379  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.57 
 
 
647 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.454626  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0378  chemotaxis sensory transducer  43.3 
 
 
638 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68857  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0444  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.31 
 
 
647 aa  334  4e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414929  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37 
 
 
650 aa  332  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.33 
 
 
647 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.44 
 
 
632 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  37.69 
 
 
642 aa  325  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.63 
 
 
639 aa  324  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.66043 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37 
 
 
642 aa  320  6e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.47 
 
 
639 aa  317  5e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.52 
 
 
639 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.886367 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  37.79 
 
 
676 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4658  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.34 
 
 
639 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415489  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  51.33 
 
 
681 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43220  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  36.16 
 
 
652 aa  299  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1539  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.8 
 
 
626 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206608  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4192  chemotaxis sensory transducer  49 
 
 
654 aa  278  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  43.3 
 
 
541 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.92 
 
 
541 aa  271  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  decreased coverage  0.0000342214 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.71 
 
 
541 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.582352  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.63 
 
 
541 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.722367  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.8 
 
 
541 aa  267  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.8 
 
 
541 aa  267  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.25 
 
 
541 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46 
 
 
541 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.452969  normal  0.355365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2268  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.08 
 
 
541 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255239  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  45.17 
 
 
541 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43710  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  44.6 
 
 
541 aa  264  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  43.61 
 
 
541 aa  263  8e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.46 
 
 
544 aa  263  8e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4141  chemotaxis transducer  44.91 
 
 
541 aa  261  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2593  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.29 
 
 
540 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.591477 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
541 aa  259  9e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  45.3 
 
 
523 aa  258  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3279  methyl-accepting chemotaxis protein  41.21 
 
 
541 aa  258  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149652  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0868  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.52 
 
 
546 aa  257  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  42.25 
 
 
541 aa  257  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.8 
 
 
638 aa  256  7e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.85 
 
 
285 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.553976  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.74 
 
 
425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.59 
 
 
634 aa  254  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2907  chemotaxis sensory transducer  43.56 
 
 
541 aa  254  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.26 
 
 
674 aa  254  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0732  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.15 
 
 
555 aa  254  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.3 
 
 
541 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.476721 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4266  chemotaxis sensory transducer  42.06 
 
 
546 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261421  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.99 
 
 
637 aa  253  6e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.3 
 
 
541 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.3 
 
 
541 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.3 
 
 
541 aa  252  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  44.05 
 
 
634 aa  249  8e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3348  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40.75 
 
 
542 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.946905  normal  0.024921 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.56 
 
 
634 aa  248  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  40.91 
 
 
713 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4833  chemotaxis sensory transducer  42.68 
 
 
541 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000956827  normal  0.082646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3580  methyl-accepting chemotaxis protein  43.35 
 
 
546 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2109  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.92 
 
 
539 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.0787865 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48030  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  44.01 
 
 
541 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.478475 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0580  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.87 
 
 
679 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1418  chemotaxis sensory transducer  44.48 
 
 
541 aa  244  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3577  methyl-accepting chemotaxis protein  38.97 
 
 
542 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1397  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.35 
 
 
646 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1819  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.35 
 
 
646 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2634  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  42.74 
 
 
542 aa  243  6e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.917034  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3351  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.06 
 
 
570 aa  243  6e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540062  normal  0.0241334 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.73 
 
 
552 aa  243  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3892  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.35 
 
 
646 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.176231 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.49 
 
 
543 aa  243  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0712  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.61 
 
 
624 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  39.55 
 
 
546 aa  240  5e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1491  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  41.77 
 
 
539 aa  240  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.26 
 
 
637 aa  240  6.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.69 
 
 
522 aa  240  6.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4624  methyl-accepting chemotaxis protein  41.77 
 
 
539 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.54 
 
 
552 aa  238  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1334  methyl-accepting chemotaxis protein  40.95 
 
 
550 aa  238  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  42.9 
 
 
559 aa  237  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1150  chemotaxis sensory transducer  39.16 
 
 
551 aa  237  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  39.85 
 
 
712 aa  237  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>