133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3878 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  100 
 
 		 391 aa  808    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  74.35 
 
 		 390 aa  596  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  48.4 
 
 		 388 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  47.58 
 
 		 389 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  38.68 
 
 		 378 aa  285  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  47.69 
 
 		 285 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  43.52 
 
 		 307 aa  179  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  42.16 
 
 		 438 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  38.26 
 
 		 354 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  45.28 
 
 		 429 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  40.48 
 
 		 372 aa  137  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  38.18 
 
 		 359 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  38.54 
 
 		 358 aa  133  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2948  chitin-binding domain 3 protein  38.73 
 
 		 306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0411375  hitchhiker  0.000170836 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  39.02 
 
 		 360 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  33.67 
 
 		 392 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  37.75 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0217  chitinase B  30.82 
 
 		 395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.14 
 
 		 471 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  33.77 
 
 		 389 aa  124  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  36.2 
 
 		 443 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  30.82 
 
 		 491 aa  121  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  35.17 
 
 		 347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02190  hypothetical protein  35.51 
 
 		 497 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.52 
 
 		 485 aa  117  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.31 
 
 		 491 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.1 
 
 		 491 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  31.34 
 
 		 402 aa  113  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.02 
 
 		 491 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  28.75 
 
 		 486 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.37 
 
 		 481 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.37 
 
 		 481 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.95 
 
 		 487 aa  109  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.37 
 
 		 481 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.49 
 
 		 481 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  35.21 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  30.08 
 
 		 487 aa  107  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  31.17 
 
 		 400 aa  107  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  28.14 
 
 		 477 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  31.48 
 
 		 197 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.32 
 
 		 481 aa  101  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4563  chitin-binding domain 3 protein  36.36 
 
 		 212 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3154  chitin binding domain-containing protein  26.97 
 
 		 534 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3305  chitin binding domain-containing protein  26.97 
 
 		 534 aa  95.5  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000109771  hitchhiker  0.000135909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3293  chitin-binding domain-containing protein  26.97 
 
 		 534 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  25.76 
 
 		 473 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  26.02 
 
 		 405 aa  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.56 
 
 		 497 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2475  chitin-binding domain 3 protein  29.86 
 
 		 223 aa  87  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2047  chitin binding domain-containing protein  28.83 
 
 		 417 aa  86.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1070  chitin-binding protein  28.31 
 
 		 378 aa  86.3  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1785  chitin binding domain-containing protein  28.31 
 
 		 365 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361699  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0777  chitin-binding protein  28.31 
 
 		 365 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.875326  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0759  chitin binding domain-containing protein  28.31 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0669  chitin-binding protein  28.31 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2045  chitin-binding protein  28.31 
 
 		 365 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.548348  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  32.23 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0633  hypothetical protein  30 
 
 		 436 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.746615  normal  0.741737 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3518  chitin-binding domain 3 protein  28.97 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1925  chitin binding domain-containing protein  26.85 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1268  putative secreted cellulose-binding protein  26.89 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.459217  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  29.05 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4693  chitin-binding domain 3 protein  27.7 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  32.28 
 
 		 445 aa  72.8  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  27.75 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  26.57 
 
 		 216 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  27.75 
 
 		 221 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2244  chitin-binding domain 3 protein  26.4 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.620526  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  28.45 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  28.84 
 
 		 455 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  26.79 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  26.79 
 
 		 221 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  26.79 
 
 		 221 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  26.79 
 
 		 221 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  26.79 
 
 		 221 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  26.79 
 
 		 221 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  26.79 
 
 		 221 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  32.54 
 
 		 456 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  28.37 
 
 		 455 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  26.79 
 
 		 221 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  28.37 
 
 		 455 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  28.37 
 
 		 455 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  27.91 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  27.91 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  27.91 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  27.91 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  27.91 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  27.44 
 
 		 455 aa  67  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6726  chitin-binding protein  29.06 
 
 		 236 aa  67  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  24.75 
 
 		 362 aa  67  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  26.47 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  27.91 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  25.7 
 
 		 459 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  29.46 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3105  chitin-binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.179745 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5855  chitin-binding domain-containing protein  30.83 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.78659  normal  0.147977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5334  chitin-binding domain 3 protein  26.87 
 
 		 262 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  25.46 
 
 		 197 aa  62  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0274  endochitinase  52.63 
 
 		 587 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0255  endochitinase  52.63 
 
 		 587 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.942643 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>