More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1173 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1173  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 337 aa  676    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0506  secretion protein HlyD family protein  44.51 
 
 		 324 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0531  secretion protein HlyD family protein  44.2 
 
 		 324 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0527  secretion protein HlyD family protein  44.2 
 
 		 324 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0568004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0583  secretion protein HlyD family protein  44.2 
 
 		 324 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3813  secretion protein HlyD family protein  43.89 
 
 		 324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103325  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3639  secretion protein HlyD family protein  43.75 
 
 		 324 aa  253  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3463  secretion protein HlyD family protein  43.44 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0488  secretion protein HlyD family protein  43.44 
 
 		 324 aa  250  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0412  secretion protein HlyD family protein  42.45 
 
 		 323 aa  249  4e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.604128  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4089  HlyD family secretion protein  43.57 
 
 		 324 aa  248  8e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0567  secretion protein HlyD family protein  43.44 
 
 		 323 aa  242  7e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.142155 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  38.25 
 
 		 427 aa  239  5.999999999999999e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3729  secretion protein HlyD family protein  38.56 
 
 		 329 aa  237  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4571  secretion protein HlyD family protein  48.67 
 
 		 349 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1026  secretion protein HlyD family protein  39.62 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3745  secretion protein HlyD family protein  41.82 
 
 		 323 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003317  membrane-fusion protein  38.82 
 
 		 326 aa  232  7.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4393  secretion protein HlyD family protein  43.2 
 
 		 323 aa  231  9e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0150137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0478  HlyD family secretion protein  41.19 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.161841 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0653  secretion protein HlyD family protein  40.53 
 
 		 357 aa  231  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0604  secretion protein HlyD family protein  43.95 
 
 		 326 aa  220  3e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0477  hypothetical protein  38.26 
 
 		 332 aa  219  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1840  hypothetical protein  38.44 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.137202  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1212  hypothetical protein  39.87 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000214097  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0396  secretion protein HlyD family protein  39.37 
 
 		 330 aa  216  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0618  putative secretion protein, HlyD family  37.42 
 
 		 326 aa  206  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0093  HlyD family secretion protein  40.32 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0320304 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  38.61 
 
 		 323 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  37.66 
 
 		 323 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02435  hypothetical protein  40 
 
 		 326 aa  199  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1189  secretion protein HlyD  38.64 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.315896  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4808  secretion protein HlyD family protein  37.25 
 
 		 330 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2777  secretion protein HlyD family protein  38.64 
 
 		 323 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.991626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2682  secretion protein HlyD family protein  38.44 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0499  secretion protein HlyD family protein  34.28 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2703  secretion protein HlyD family protein  35.83 
 
 		 367 aa  169  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1925  secretion protein HlyD family protein  29.56 
 
 		 328 aa  152  8.999999999999999e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0178624 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2701  secretion protein HlyD family protein  31.76 
 
 		 333 aa  133  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  29.71 
 
 		 334 aa  122  7e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  29.59 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  28.15 
 
 		 347 aa  108  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9216  HlyD family secretion protein  27.99 
 
 		 356 aa  99.8  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  27.47 
 
 		 398 aa  97.4  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  28.66 
 
 		 342 aa  97.1  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  28.09 
 
 		 335 aa  93.2  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  26.83 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  25.08 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6554  multidrug resistance protein MdtN  30.22 
 
 		 351 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  25.08 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  29.63 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  25 
 
 		 331 aa  88.6  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  26.54 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0700  putative lipoprotein  32.16 
 
 		 359 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  27.31 
 
 		 421 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4577  secretion protein HlyD  26.16 
 
 		 354 aa  86.7  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.231546  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  28.43 
 
 		 329 aa  86.7  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  26.77 
 
 		 339 aa  86.3  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  22.96 
 
 		 328 aa  86.3  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.87 
 
 		 462 aa  85.9  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  30.13 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  33.47 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.33 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1013  secretion protein HlyD  26.07 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  28.66 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  29.48 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  28.66 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  29.47 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  28.1 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  27.7 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  27.24 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  27.57 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  25.4 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  27.11 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  28.14 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.17 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  29.37 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  26.3 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  25.08 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  27.57 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  24.14 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  29.06 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7850  HlyD family secretion protein  28.48 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800045  normal  0.246605 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  29.47 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  29.46 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  29.27 
 
 		 340 aa  79.3  0.00000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.61 
 
 		 376 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  20.47 
 
 		 349 aa  79.3  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2082  secretion protein HlyD  30.56 
 
 		 371 aa  79.3  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  25.27 
 
 		 366 aa  79.3  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  27.12 
 
 		 334 aa  79  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  28.96 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  24.83 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.31 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  28.82 
 
 		 517 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  25.52 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  32.71 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  28.77 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  29.72 
 
 		 460 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  29.72 
 
 		 460 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>