More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0693 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0693  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 472 aa  907    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447559 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4316  major facilitator transporter  62.61 
 
 		 486 aa  469  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  61.87 
 
 		 471 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  56.04 
 
 		 485 aa  388  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  57.14 
 
 		 481 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4898  putative transport protein  47.53 
 
 		 489 aa  300  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00331224  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1431  major facilitator superfamily MFS_1  49.88 
 
 		 733 aa  286  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.634406  normal  0.254269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0337  major facilitator superfamily MFS_1  49.51 
 
 		 494 aa  275  9e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0498428  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0548  major facilitator transporter  43.67 
 
 		 500 aa  272  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8208  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  48.42 
 
 		 463 aa  257  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2293  major facilitator superfamily MFS_1  42.23 
 
 		 513 aa  254  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.42 
 
 		 487 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.82 
 
 		 487 aa  244  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.43 
 
 		 527 aa  237  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.32 
 
 		 498 aa  226  7e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  37.47 
 
 		 497 aa  223  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.37 
 
 		 519 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.32 
 
 		 763 aa  217  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 		 494 aa  216  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.13 
 
 		 489 aa  214  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.63 
 
 		 478 aa  213  7.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.5 
 
 		 508 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  38.67 
 
 		 491 aa  202  8e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2475  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 468 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.51 
 
 		 788 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.31 
 
 		 522 aa  201  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  35.66 
 
 		 487 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  37.62 
 
 		 490 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1233  putative transmembrane efflux protein  42 
 
 		 505 aa  194  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1276  major facilitator superfamily MFS_1  37.82 
 
 		 483 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8690  major facilitator superfamily MFS_1  38.37 
 
 		 507 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00880  sugar phosphate permease  33.33 
 
 		 458 aa  194  4e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.97 
 
 		 519 aa  193  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.61 
 
 		 487 aa  193  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0103  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 470 aa  193  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360848  hitchhiker  0.000281581 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1718  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 500 aa  192  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1149  major facilitator transporter  38.33 
 
 		 460 aa  192  9e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  37.72 
 
 		 506 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4704  major facilitator superfamily MFS_1  35.61 
 
 		 478 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.89 
 
 		 490 aa  191  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0892  major facilitator superfamily MFS_1  35.79 
 
 		 508 aa  189  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  35.37 
 
 		 481 aa  188  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  38.14 
 
 		 492 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  32.93 
 
 		 463 aa  186  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.5 
 
 		 473 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  34.04 
 
 		 498 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3703  permease of the major facilitator superfamily  37.17 
 
 		 477 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805067  normal  0.0440675 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  35 
 
 		 470 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.28 
 
 		 500 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.38 
 
 		 479 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.77 
 
 		 452 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.12 
 
 		 478 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3272  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.82 
 
 		 469 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.32 
 
 		 509 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2451  transporter protein  34.85 
 
 		 472 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.507711 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1772  major facilitator transporter  39.09 
 
 		 487 aa  177  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.819492  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.89 
 
 		 493 aa  176  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.21 
 
 		 534 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.29 
 
 		 553 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.22 
 
 		 486 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.22 
 
 		 486 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.22 
 
 		 486 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.22 
 
 		 486 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.22 
 
 		 486 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.22 
 
 		 486 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.18 
 
 		 528 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.96 
 
 		 485 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 463 aa  172  7.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 468 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 468 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0336  transporter protein  35.37 
 
 		 489 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0230531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4580  major facilitator superfamily MFS_1  37.75 
 
 		 500 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.85 
 
 		 514 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4079  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 470 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0276069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.68 
 
 		 512 aa  171  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.96 
 
 		 480 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.55 
 
 		 458 aa  170  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.45 
 
 		 521 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1704  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.68 
 
 		 757 aa  169  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23710  arabinose efflux permease family protein  35.95 
 
 		 469 aa  169  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  0.277036 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.02 
 
 		 484 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.02 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.02 
 
 		 478 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.9 
 
 		 478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4141  major facilitator superfamily MFS_1  34.96 
 
 		 486 aa  167  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.67 
 
 		 474 aa  167  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2068  major facilitator transporter  35.98 
 
 		 496 aa  167  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.695646  normal  0.718016 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  34.95 
 
 		 582 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.87 
 
 		 532 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4798  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.67 
 
 		 518 aa  166  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  35.26 
 
 		 483 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7524  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 		 503 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5374  major facilitator transporter  39.53 
 
 		 481 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.558764 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 		 457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 397 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.95 
 
 		 1112 aa  164  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.04 
 
 		 489 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.23 
 
 		 507 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0100  major facilitator transporter  36.42 
 
 		 468 aa  163  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.02 
 
 		 522 aa  162  8.000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>