More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2068 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2211  major facilitator transporter  81.8 
 
 		 480 aa  640    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214988  normal  0.704415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2068  major facilitator transporter  100 
 
 		 496 aa  955    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.695646  normal  0.718016 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1835  major facilitator superfamily MFS_1  53.91 
 
 		 501 aa  322  8e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0636096  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.48 
 
 		 763 aa  303  5.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.79 
 
 		 493 aa  289  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  42.92 
 
 		 475 aa  283  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.08 
 
 		 527 aa  281  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.65 
 
 		 487 aa  281  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.18 
 
 		 487 aa  266  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.5 
 
 		 498 aa  258  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  40.24 
 
 		 487 aa  256  8e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.32 
 
 		 478 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.5 
 
 		 509 aa  249  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  42.16 
 
 		 490 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.74 
 
 		 487 aa  247  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.87 
 
 		 508 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  38.63 
 
 		 481 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  38.71 
 
 		 470 aa  237  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 483 aa  236  8e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.95 
 
 		 519 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4328  major facilitator transporter  39.96 
 
 		 482 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.07 
 
 		 534 aa  229  9e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.83 
 
 		 788 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.88 
 
 		 474 aa  226  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  37.99 
 
 		 497 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.36 
 
 		 489 aa  224  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7524  major facilitator superfamily MFS_1  37.96 
 
 		 503 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0103  major facilitator transporter  37.39 
 
 		 470 aa  221  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360848  hitchhiker  0.000281581 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.98 
 
 		 490 aa  220  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.2 
 
 		 514 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.91 
 
 		 499 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  37.47 
 
 		 492 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1704  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.28 
 
 		 757 aa  213  5.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.86 
 
 		 519 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.56 
 
 		 505 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 471 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.99 
 
 		 507 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3272  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.04 
 
 		 469 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1705  major facilitator superfamily MFS_1  36.62 
 
 		 733 aa  210  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.24 
 
 		 487 aa  209  9e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.608352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  36.27 
 
 		 481 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  37.32 
 
 		 491 aa  207  3e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.65 
 
 		 500 aa  207  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4680  major facilitator superfamily MFS_1  38.16 
 
 		 467 aa  207  5e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4141  major facilitator superfamily MFS_1  37.86 
 
 		 486 aa  206  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 		 494 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.73 
 
 		 522 aa  205  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.45 
 
 		 553 aa  203  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4088  major facilitator superfamily MFS_1  38.79 
 
 		 501 aa  202  9e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1233  putative transmembrane efflux protein  42.96 
 
 		 505 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.67 
 
 		 489 aa  200  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.84 
 
 		 1112 aa  199  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  33.19 
 
 		 498 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  36.86 
 
 		 485 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.63 
 
 		 482 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4243  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.66 
 
 		 504 aa  197  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.63 
 
 		 478 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4981  major facilitator superfamily MFS_1  38.38 
 
 		 518 aa  193  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.547375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.59 
 
 		 501 aa  193  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5593  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 499 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23710  arabinose efflux permease family protein  39.08 
 
 		 469 aa  192  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  0.277036 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.33 
 
 		 479 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  37.18 
 
 		 506 aa  192  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  35.94 
 
 		 492 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.91 
 
 		 489 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8232  major facilitator superfamily MFS_1  36.79 
 
 		 513 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3703  permease of the major facilitator superfamily  37.65 
 
 		 477 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805067  normal  0.0440675 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.09 
 
 		 498 aa  191  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.54 
 
 		 543 aa  189  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1149  major facilitator transporter  36.48 
 
 		 460 aa  189  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.91 
 
 		 487 aa  188  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0336  transporter protein  37.91 
 
 		 489 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0230531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2475  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 468 aa  187  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.06 
 
 		 500 aa  186  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.47 
 
 		 496 aa  186  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.99 
 
 		 512 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.82 
 
 		 488 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0633  major facilitator superfamily MFS_1  35.9 
 
 		 474 aa  184  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4079  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 470 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0276069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4798  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.18 
 
 		 518 aa  184  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2293  major facilitator superfamily MFS_1  35.08 
 
 		 513 aa  184  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3935  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.25 
 
 		 479 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000976381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2075  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 529 aa  183  7e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0542399  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2121  major facilitator superfamily transporter  37.2 
 
 		 529 aa  183  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.360369  normal  0.0488476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2058  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 529 aa  183  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.283059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2144  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.74 
 
 		 520 aa  182  9.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.434739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0766  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.53 
 
 		 499 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176707 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.14 
 
 		 506 aa  182  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2069  major facilitator superfamily permease  29.56 
 
 		 440 aa  182  1e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.11 
 
 		 532 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 528 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.68 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0817  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.1 
 
 		 479 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278156  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1611  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.15 
 
 		 503 aa  182  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2306  major facilitator superfamily transporter  37.04 
 
 		 543 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0864673  normal  0.0994822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.02 
 
 		 510 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.14 
 
 		 479 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.14 
 
 		 479 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.880414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  35.05 
 
 		 454 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0693  major facilitator superfamily MFS_1  36.56 
 
 		 472 aa  180  5.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>