More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2211 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2068  major facilitator transporter  81.8 
 
 
496 aa  662    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.695646  normal  0.718016 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2211  major facilitator transporter  100 
 
 
480 aa  912    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214988  normal  0.704415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1835  major facilitator superfamily MFS_1  52.53 
 
 
501 aa  345  8.999999999999999e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0636096  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.54 
 
 
763 aa  304  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.58 
 
 
487 aa  293  5e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42 
 
 
527 aa  287  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.08 
 
 
493 aa  287  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  43.74 
 
 
475 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.42 
 
 
498 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  40.91 
 
 
487 aa  265  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.6 
 
 
508 aa  259  9e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  38.74 
 
 
481 aa  258  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  41.98 
 
 
490 aa  259  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.83 
 
 
478 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  40.3 
 
 
470 aa  250  4e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.62 
 
 
487 aa  250  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.67 
 
 
509 aa  250  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.21 
 
 
487 aa  244  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.2 
 
 
534 aa  242  9e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  40.39 
 
 
483 aa  241  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4328  major facilitator transporter  40.17 
 
 
482 aa  240  5e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.09 
 
 
474 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.44 
 
 
489 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.27 
 
 
490 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.27 
 
 
519 aa  229  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.15 
 
 
788 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.1 
 
 
499 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  38.97 
 
 
497 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.2 
 
 
519 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4680  major facilitator superfamily MFS_1  39.18 
 
 
467 aa  221  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  40.15 
 
 
471 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0103  major facilitator transporter  36.77 
 
 
470 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360848  hitchhiker  0.000281581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.19 
 
 
514 aa  218  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4141  major facilitator superfamily MFS_1  39.27 
 
 
486 aa  217  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.19 
 
 
507 aa  217  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4088  major facilitator superfamily MFS_1  42.22 
 
 
501 aa  216  5.9999999999999996e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7524  major facilitator superfamily MFS_1  37.77 
 
 
503 aa  216  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47136  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  36.61 
 
 
481 aa  216  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.15 
 
 
482 aa  215  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.09 
 
 
553 aa  215  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  38.96 
 
 
492 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  38.37 
 
 
491 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.11 
 
 
487 aa  213  7.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.608352  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3272  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.07 
 
 
469 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 
494 aa  206  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.24 
 
 
505 aa  206  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  37.47 
 
 
492 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.21 
 
 
1112 aa  205  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.68 
 
 
501 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1233  putative transmembrane efflux protein  42.16 
 
 
505 aa  204  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1705  major facilitator superfamily MFS_1  33.69 
 
 
733 aa  203  5e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2475  major facilitator transporter  37.94 
 
 
468 aa  202  9e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.36 
 
 
500 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.11 
 
 
498 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1149  major facilitator transporter  37.42 
 
 
460 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  37.21 
 
 
498 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.07 
 
 
479 aa  201  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.31 
 
 
478 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.81 
 
 
522 aa  200  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5578  major facilitator superfamily MFS_1  38.68 
 
 
478 aa  199  7.999999999999999e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.65 
 
 
487 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1704  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.4 
 
 
757 aa  198  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.2 
 
 
489 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.31 
 
 
496 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23710  arabinose efflux permease family protein  39.08 
 
 
469 aa  197  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  0.277036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  37.05 
 
 
454 aa  196  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.54 
 
 
489 aa  196  9e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4981  major facilitator superfamily MFS_1  39.35 
 
 
518 aa  195  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.547375  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5593  major facilitator superfamily MFS_1  41.2 
 
 
499 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3703  permease of the major facilitator superfamily  37.44 
 
 
477 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805067  normal  0.0440675 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.53 
 
 
506 aa  193  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.92 
 
 
512 aa  193  7e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.038471 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  37.25 
 
 
506 aa  193  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4079  major facilitator transporter  38.01 
 
 
470 aa  192  9e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0276069  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8232  major facilitator superfamily MFS_1  36.44 
 
 
513 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4413  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.06 
 
 
497 aa  191  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1611  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.45 
 
 
503 aa  190  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5374  major facilitator transporter  37.89 
 
 
481 aa  189  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.558764 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.75 
 
 
482 aa  189  9e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.75 
 
 
482 aa  189  9e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3935  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38 
 
 
479 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000976381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.7 
 
 
488 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  33.64 
 
 
469 aa  187  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.69 
 
 
479 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.69 
 
 
479 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.880414  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4243  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.88 
 
 
504 aa  186  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891003  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  37.28 
 
 
485 aa  186  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0817  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.47 
 
 
479 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278156  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.86 
 
 
458 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.81 
 
 
480 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.189888  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.81 
 
 
480 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.81 
 
 
480 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.81 
 
 
480 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3141  drug resistance MFS transporter  38.81 
 
 
480 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3178  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.81 
 
 
480 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1885  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.81 
 
 
480 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0633  major facilitator superfamily MFS_1  37.04 
 
 
474 aa  184  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0766  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.49 
 
 
499 aa  183  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.176707 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4798  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.41 
 
 
518 aa  183  6e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.42 
 
 
500 aa  183  7e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>