116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2353 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2651  alpha-1,2-mannosidase family protein  46.85 
 
 		 807 aa  741    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0899851  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3384  putative alpha-1,2-mannosidase  48.68 
 
 		 785 aa  755    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.570522  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0564  alpha-1,2-mannosidase family protein  47.83 
 
 		 784 aa  739    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.288531  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2358  putative alpha-1,2-mannosidase  67.23 
 
 		 778 aa  1111    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170522  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4715  alpha-1,2-mannosidase  45.45 
 
 		 777 aa  689    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.288424 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2174  alpha-1,2-mannosidase  49.32 
 
 		 784 aa  754    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2353  alpha-1,2-mannosidase  100 
 
 		 762 aa  1599    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00545904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2182  alpha-1,2-mannosidase  77.85 
 
 		 775 aa  1260    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6816  alpha-1,2-mannosidase  67.63 
 
 		 769 aa  1113    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0255235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3892  alpha-1,2-mannosidase  43.45 
 
 		 759 aa  621  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2714  putative alpha-1,2-mannosidase  44.5 
 
 		 753 aa  617  1e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3976  alpha-1,2-mannosidase  43.36 
 
 		 761 aa  611  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00516105  normal  0.689396 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2032  putative alpha-1,2-mannosidase  41.99 
 
 		 747 aa  591  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0117  putative alpha-1,2-mannosidase  41.87 
 
 		 742 aa  587  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  41.89 
 
 		 976 aa  582  1e-164  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0514  alpha-1,2-mannosidase, putative  41.6 
 
 		 771 aa  577  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0135562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0289  putative alpha-1,2-mannosidase  41.4 
 
 		 751 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0217  alpha-1,2-mannosidase  41.05 
 
 		 754 aa  549  1e-155  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0490349  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0130  putative alpha-1,2-mannosidase  38.9 
 
 		 747 aa  542  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1932  alpha-1,2-mannosidase  39.2 
 
 		 790 aa  526  1e-148  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0846  alpha-1,2-mannosidase  40.73 
 
 		 706 aa  528  1e-148  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2008  antigen  39.2 
 
 		 790 aa  524  1e-147  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.154316  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0902  alpha-1,2-mannosidase family protein  38.52 
 
 		 741 aa  504  1e-141  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2421  alpha-1,2-mannosidase, putative  37.73 
 
 		 769 aa  505  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262466  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0304  putative alpha-1,2-mannosidase  37.87 
 
 		 773 aa  503  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4820  alpha-1,2-mannosidase  36.94 
 
 		 757 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000525675  unclonable  0.0000000000000774884 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000707  putative alpha-1,2-mannosidase  34.99 
 
 		 806 aa  432  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340375  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06598  alpha-1,2-mannosidase  34.65 
 
 		 808 aa  432  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2596  alpha-1,2-mannosidase, putative  34.29 
 
 		 827 aa  431  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146801  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000706  alpha-1,2-mannosidase  32.72 
 
 		 943 aa  427  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000710  alpha-1,2-mannosidase  34 
 
 		 826 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878479  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06601  alpha-1,2-mannosidase  33.04 
 
 		 818 aa  413  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06602  alpha-1,2-mannosidase  33.87 
 
 		 826 aa  411  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000709  alpha-1,2-mannosidase  33.29 
 
 		 818 aa  412  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2715  putative alpha-1,2-mannosidase  34.31 
 
 		 759 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0373622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4808  alpha-1,2-mannosidase  34.6 
 
 		 758 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5524  alpha-1,2-mannosidase  33.5 
 
 		 774 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0588819  normal  0.180784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1457  alpha-1,2-mannosidase  33.94 
 
 		 780 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0288  putative alpha-1,2-mannosidase  32.04 
 
 		 740 aa  392  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0116  putative alpha-1,2-mannosidase  33.38 
 
 		 760 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0692372  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0298  alpha-1,2-mannosidase  34.43 
 
 		 760 aa  387  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000977732  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2906  Alpha-1,2-mannosidase, putative  31.57 
 
 		 888 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2041  putative alpha-1,2-mannosidase  33.29 
 
 		 749 aa  385  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0394657  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4817  alpha-1,2-mannosidase, putative  31.37 
 
 		 886 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3350  putative alpha-1,2-mannosidase  31.37 
 
 		 886 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4166  alpha-1,2-mannosidase  31.37 
 
 		 886 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4742  alpha-1,2-mannosidase  33.29 
 
 		 771 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.155391 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000708  putative alpha-1,2-mannosidase  31.21 
 
 		 901 aa  372  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0120  putative alpha-1,2-mannosidase  32.9 
 
 		 772 aa  371  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147573  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5005  alpha-1,2-mannosidase  32.21 
 
 		 797 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06599  hypothetical protein  31.32 
 
 		 917 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  32.73 
 
 		 1075 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0293  putative alpha-1,2-mannosidase  32.69 
 
 		 782 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.262519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  31.81 
 
 		 1089 aa  368  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4827  alpha-1,2-mannosidase  32.32 
 
 		 755 aa  366  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000010701 
 
 
-
 
NC_002950  PG0973  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.48 
 
 		 771 aa  364  3e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.303191 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  30.91 
 
 		 1084 aa  338  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2907  Alpha-1,2-mannosidase, putative  32.04 
 
 		 823 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.69 
 
 		 964 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  31.26 
 
 		 986 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  31.39 
 
 		 986 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.26 
 
 		 955 aa  337  5e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.26 
 
 		 955 aa  337  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.26 
 
 		 986 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.26 
 
 		 986 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.26 
 
 		 986 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  31.01 
 
 		 1189 aa  335  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4818  alpha-1,2-mannosidase, putative  32.29 
 
 		 819 aa  335  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3349  putative alpha-1,2-mannosidase  32.29 
 
 		 819 aa  335  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4167  alpha-1,2-mannosidase  32.29 
 
 		 819 aa  335  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2891  alpha-1,2-mannosidase  29.61 
 
 		 795 aa  334  4e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  31.43 
 
 		 961 aa  334  5e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1774  alpha-1,2-mannosidase  30.43 
 
 		 821 aa  333  6e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.437788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  31.43 
 
 		 899 aa  331  3e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3124  putative alpha-1,2-mannosidase  29.49 
 
 		 757 aa  329  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1114  alpha-1,2-mannosidase  30.43 
 
 		 745 aa  322  9.999999999999999e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3125  putative alpha-1,2-mannosidase  29.63 
 
 		 768 aa  321  3e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0733524  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10595  hypothetical protein  31.27 
 
 		 877 aa  319  1e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2956  alpha-1,2-mannosidase  29.62 
 
 		 764 aa  315  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.756886  hitchhiker  0.00000545459 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3507  alpha-1,2-mannosidase  30.45 
 
 		 811 aa  310  5e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5632  alpha-1,2-mannosidase  30.55 
 
 		 716 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427335  normal  0.872558 
 
 
-
 
NC_002950  PG1712  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.68 
 
 		 781 aa  300  8e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1744  alpha-1,2-mannosidase  35.78 
 
 		 751 aa  298  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0722738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3359  alpha-1,2-mannosidase  29.57 
 
 		 728 aa  297  6e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.822505  normal  0.0441552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  28.82 
 
 		 890 aa  285  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2650  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.62 
 
 		 846 aa  273  8.000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0929725  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0563  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.95 
 
 		 849 aa  271  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.372368  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5720  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.85 
 
 		 900 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0689456  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6084  putative alpha-1,2-mannosidase  27.85 
 
 		 900 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7335  putative alpha-1,2-mannosidase  29.07 
 
 		 754 aa  267  5e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3385  putative alpha-1,2-mannosidase  27.26 
 
 		 839 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0761  alpha-1,2-mannosidase  28.05 
 
 		 901 aa  266  8e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  28.88 
 
 		 1426 aa  265  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1711  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.26 
 
 		 753 aa  259  2e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.19 
 
 		 1322 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0134  alpha-1,2-mannosidase  32.02 
 
 		 771 aa  252  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3350  alpha-1,2-mannosidase  27.95 
 
 		 1114 aa  251  4e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.357812  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10672  alpha-1,2-mannosidase, putative subfamily (AFU_orthologue; AFUA_6G13760)  26.78 
 
 		 798 aa  250  6e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  28.7 
 
 		 1422 aa  247  6e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  26.91 
 
 		 1124 aa  246  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>