More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_25170 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_25170  metalloendopeptidase-like membrane protein  100 
 
 
462 aa  931    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1037  Peptidase M23  45.7 
 
 
477 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501943  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1246  Peptidase M23  43.21 
 
 
446 aa  291  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2398  Peptidase M23  34.96 
 
 
474 aa  228  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0487248 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0866  Peptidase M23  43.53 
 
 
489 aa  199  7e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.329722  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2767  Peptidase M23  36.25 
 
 
451 aa  179  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.327973 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2663  peptidase M23B  33.56 
 
 
464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0453096  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1270  peptidase M23B  27.87 
 
 
419 aa  150  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  47.95 
 
 
411 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  23.85 
 
 
441 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20310  metalloendopeptidase-like membrane protein  45.83 
 
 
446 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  46.46 
 
 
681 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  47.54 
 
 
676 aa  124  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  45.77 
 
 
375 aa  123  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  48.03 
 
 
695 aa  122  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  26.44 
 
 
379 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  24.41 
 
 
375 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0912  Peptidase M23  49.26 
 
 
276 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.677753 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  34.04 
 
 
404 aa  121  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  46.46 
 
 
697 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  46.46 
 
 
697 aa  121  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  45.67 
 
 
699 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  24.81 
 
 
399 aa  120  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  30.91 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  47.11 
 
 
665 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  24.81 
 
 
399 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  22.73 
 
 
431 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  44.63 
 
 
683 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  44.09 
 
 
400 aa  117  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  46.92 
 
 
429 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  41.54 
 
 
527 aa  116  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  25.81 
 
 
377 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19390  metalloendopeptidase-like membrane protein  46.43 
 
 
287 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  25.05 
 
 
375 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0074  peptidase M23B  49.58 
 
 
513 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  47.86 
 
 
524 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  46.03 
 
 
238 aa  114  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  47.06 
 
 
253 aa  114  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  43.08 
 
 
674 aa  114  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  42.86 
 
 
440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  42.86 
 
 
440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  43.08 
 
 
437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  43.85 
 
 
645 aa  111  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  44.88 
 
 
621 aa  111  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  45.38 
 
 
651 aa  111  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  41.86 
 
 
490 aa  110  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  40.5 
 
 
676 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1041  peptidase, M23/M37 family  41.61 
 
 
302 aa  109  9.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.432604  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  42.64 
 
 
300 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  45.38 
 
 
651 aa  109  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  45.38 
 
 
651 aa  109  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  43.85 
 
 
656 aa  109  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  42.06 
 
 
314 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  41.6 
 
 
692 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  44.93 
 
 
529 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  38.84 
 
 
680 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  40.5 
 
 
695 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  28.91 
 
 
372 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  41.04 
 
 
379 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  46.09 
 
 
687 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  38.84 
 
 
681 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  43.51 
 
 
646 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  44.09 
 
 
615 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4531  Peptidase M23  47.76 
 
 
137 aa  107  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.45926 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0192  Peptidase M23  47.06 
 
 
312 aa  107  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  46.28 
 
 
569 aa  107  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  44.26 
 
 
300 aa  107  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  24.51 
 
 
376 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  42.19 
 
 
465 aa  106  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  39.37 
 
 
690 aa  106  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  38.81 
 
 
374 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  42.42 
 
 
442 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  40.91 
 
 
441 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  40.31 
 
 
430 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  37.59 
 
 
373 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3111  peptidase M23B  42.86 
 
 
225 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.324565  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  42.97 
 
 
457 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  25.38 
 
 
379 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  44.17 
 
 
648 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  43.07 
 
 
523 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  43.33 
 
 
233 aa  104  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  40.31 
 
 
464 aa  104  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  32.91 
 
 
377 aa  103  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  41.41 
 
 
387 aa  103  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  36.3 
 
 
471 aa  103  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  41.04 
 
 
287 aa  103  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  41.67 
 
 
538 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  36.3 
 
 
471 aa  103  8e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  42.86 
 
 
216 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  35.56 
 
 
305 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  45.38 
 
 
398 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  37.78 
 
 
472 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0565  Peptidase M23  44.83 
 
 
475 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  44.17 
 
 
271 aa  102  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  42.98 
 
 
286 aa  102  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  25.83 
 
 
402 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1145  Peptidase M23  41.67 
 
 
390 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  34.05 
 
 
443 aa  102  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  39.68 
 
 
402 aa  101  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  44.17 
 
 
271 aa  102  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>