More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_22560 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5233  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.3 
 
 		 704 aa  761    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5584  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  60.17 
 
 		 718 aa  739    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128967  normal  0.346665 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0376  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.95 
 
 		 712 aa  638    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1612  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  65.08 
 
 		 733 aa  846    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.644858 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4745  ATP-dependent DNA helicase RecQ  60.31 
 
 		 691 aa  766    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.865957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.81 
 
 		 689 aa  744    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3226  ATP-dependent DNA helicase RecQ family  56.76 
 
 		 691 aa  683    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225844  hitchhiker  0.0000186089 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0677  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.57 
 
 		 754 aa  666    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00766403  normal  0.0478204 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  59.52 
 
 		 691 aa  720    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346189  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03530  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.48 
 
 		 734 aa  711    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0133  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61 
 
 		 714 aa  782    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.931384  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  63.83 
 
 		 724 aa  834    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  0.167588 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06850  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57 
 
 		 713 aa  693    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4657  ATP-dependent DNA helicase RecQ  60.31 
 
 		 691 aa  766    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1626  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  58.91 
 
 		 706 aa  731    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.135098  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2394  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  65.13 
 
 		 756 aa  852    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396069  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1091  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  57.44 
 
 		 788 aa  787    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.305899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0447  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.16 
 
 		 708 aa  654    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0452326  decreased coverage  0.00000647403 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1524  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.92 
 
 		 712 aa  737    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3301  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  59.52 
 
 		 723 aa  760    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22560  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 		 979 aa  1930    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5040  ATP-dependent DNA helicase RecQ  60.03 
 
 		 691 aa  761    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0672  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.94 
 
 		 729 aa  705    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20415  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5950  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.48 
 
 		 749 aa  656    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0569292 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  70.97 
 
 		 766 aa  971    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.572742  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0819  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  55.17 
 
 		 745 aa  684    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0184  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  54.79 
 
 		 741 aa  623  1e-177  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18920  ATP-dependent DNA helicase RecQ  51.68 
 
 		 762 aa  620  1e-176  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275245  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0827  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.57 
 
 		 706 aa  532  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.493882  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1571  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.82 
 
 		 693 aa  519  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.000060483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1940  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.78 
 
 		 706 aa  509  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187923  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.85 
 
 		 708 aa  506  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0315  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  45.96 
 
 		 698 aa  502  1e-140  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4035  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  47.71 
 
 		 679 aa  497  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000527005  normal  0.0486665 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1532  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.71 
 
 		 697 aa  499  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1318  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.73 
 
 		 756 aa  491  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0376564  decreased coverage  0.0000000122508 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0559  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.7 
 
 		 698 aa  485  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000154535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0673  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.9 
 
 		 695 aa  476  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.293047  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4347  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.64 
 
 		 699 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0558193  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3804  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.97 
 
 		 698 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00343497  decreased coverage  0.0000140841 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3718  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.26 
 
 		 698 aa  462  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0485  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.79 
 
 		 697 aa  452  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.38 
 
 		 693 aa  445  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000979868  decreased coverage  0.000575313 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1126  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.86 
 
 		 691 aa  421  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.760992  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1436  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.49 
 
 		 691 aa  415  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000631982  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0495  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.57 
 
 		 448 aa  253  2e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264596  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.8 
 
 		 563 aa  225  4e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.75 
 
 		 602 aa  222  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.53 
 
 		 1376 aa  222  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.9 
 
 		 543 aa  217  8e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.69 
 
 		 543 aa  215  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.69 
 
 		 543 aa  215  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5632  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.67 
 
 		 545 aa  212  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.13 
 
 		 588 aa  210  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3200  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37 
 
 		 600 aa  204  5e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0829  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.38 
 
 		 546 aa  204  9e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.91 
 
 		 593 aa  202  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.91 
 
 		 593 aa  202  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4005  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.42 
 
 		 630 aa  202  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.98 
 
 		 552 aa  202  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.82 
 
 		 562 aa  202  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.16 
 
 		 626 aa  201  5e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4547  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.15 
 
 		 556 aa  201  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908744  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4797  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.52 
 
 		 590 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.29 
 
 		 451 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.17 
 
 		 630 aa  197  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47969  ATP-dependent DNA helicase  33.24 
 
 		 1148 aa  196  2e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4236  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.52 
 
 		 535 aa  195  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2064  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.77 
 
 		 729 aa  194  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256854  normal  0.150426 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.86 
 
 		 646 aa  194  7e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.59 
 
 		 705 aa  194  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4974  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.73 
 
 		 568 aa  192  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581094  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.91 
 
 		 705 aa  192  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1249  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.36 
 
 		 557 aa  192  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.91 
 
 		 705 aa  192  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.68 
 
 		 708 aa  193  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.79 
 
 		 731 aa  192  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.08 
 
 		 706 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  36.91 
 
 		 705 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3305  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.06 
 
 		 637 aa  192  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.563115  normal  0.0132339 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.91 
 
 		 705 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18280  predicted protein  33.59 
 
 		 504 aa  192  2.9999999999999997e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1542  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.88 
 
 		 592 aa  192  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.59 
 
 		 705 aa  192  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  36.59 
 
 		 705 aa  191  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6295  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.4 
 
 		 590 aa  191  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.28 
 
 		 705 aa  191  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3877  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.13 
 
 		 717 aa  191  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2958  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.75 
 
 		 636 aa  191  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217223 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.59 
 
 		 705 aa  190  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.59 
 
 		 705 aa  190  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0153  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.99 
 
 		 633 aa  191  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.99 
 
 		 615 aa  190  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0911  superfamily II DNA helicase  38.89 
 
 		 621 aa  190  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0170  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.56 
 
 		 633 aa  190  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00196  ATP-dependent DNA helicase  35.19 
 
 		 613 aa  189  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.7 
 
 		 793 aa  190  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3025  ATP-dependent DNA helicase protein  38.49 
 
 		 637 aa  189  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0062287  normal  0.0101494 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0084  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.64 
 
 		 623 aa  189  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0114  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.58 
 
 		 639 aa  189  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.186389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>