More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1546 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  100 
 
 		 234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  65.33 
 
 		 233 aa  310  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  63.09 
 
 		 234 aa  308  5e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  65.45 
 
 		 233 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  64.89 
 
 		 234 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  64.44 
 
 		 234 aa  305  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  63.16 
 
 		 233 aa  303  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  64.44 
 
 		 233 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  62.72 
 
 		 233 aa  301  5.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  60.43 
 
 		 234 aa  298  4e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  63.68 
 
 		 235 aa  293  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2075  ribosomal protein L1  61.37 
 
 		 234 aa  291  7e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  61.78 
 
 		 231 aa  289  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  60.44 
 
 		 230 aa  289  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  58.85 
 
 		 235 aa  287  9e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  58.59 
 
 		 231 aa  287  9e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1633  50S ribosomal protein L1  58.37 
 
 		 235 aa  286  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.858056  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  60.26 
 
 		 233 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  59.73 
 
 		 232 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1452  50S ribosomal protein L1  60.09 
 
 		 235 aa  285  5e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  57.96 
 
 		 235 aa  284  9e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0442  50S ribosomal protein L1  60.09 
 
 		 235 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  56.19 
 
 		 233 aa  276  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  55.65 
 
 		 230 aa  275  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  55.65 
 
 		 230 aa  275  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  55.51 
 
 		 233 aa  275  5e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  54.78 
 
 		 231 aa  272  3e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  61.06 
 
 		 232 aa  272  3e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  54.94 
 
 		 235 aa  272  4.0000000000000004e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  57.14 
 
 		 235 aa  271  7e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  56.14 
 
 		 235 aa  268  4e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  59.72 
 
 		 234 aa  266  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  58.33 
 
 		 230 aa  265  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  54.66 
 
 		 242 aa  265  5e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  54.78 
 
 		 238 aa  265  5.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  54.35 
 
 		 238 aa  264  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  58.77 
 
 		 234 aa  263  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  58.77 
 
 		 234 aa  263  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  57.08 
 
 		 233 aa  262  3e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  55.9 
 
 		 235 aa  262  4e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  55.9 
 
 		 232 aa  261  8e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  54.74 
 
 		 236 aa  260  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  57.82 
 
 		 234 aa  260  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  55 
 
 		 229 aa  259  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  56.82 
 
 		 229 aa  259  3e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  55.02 
 
 		 233 aa  259  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0365  50S ribosomal protein L1  56.77 
 
 		 235 aa  259  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.716572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2725  50S ribosomal protein L1  60.62 
 
 		 229 aa  259  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000462552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2411  50S ribosomal protein L1  60.62 
 
 		 229 aa  259  3e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1896  50S ribosomal protein L1  56.77 
 
 		 235 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0132214  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1105  ribosomal protein L1  53.45 
 
 		 236 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0193805  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  56 
 
 		 238 aa  258  6e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  53.45 
 
 		 259 aa  258  7e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  55.11 
 
 		 231 aa  258  7e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 230 aa  258  8e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  57.02 
 
 		 231 aa  257  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  57.64 
 
 		 233 aa  257  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  52.34 
 
 		 237 aa  257  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  54.91 
 
 		 241 aa  256  2e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2545  50S ribosomal protein L1  54.67 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 229 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  53.33 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  52.86 
 
 		 235 aa  256  2e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  56.39 
 
 		 230 aa  255  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0564  50S ribosomal protein L1  52.44 
 
 		 232 aa  255  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1940  50S ribosomal protein L1  54.59 
 
 		 229 aa  255  5e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.559759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  55.51 
 
 		 230 aa  254  6e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  54.39 
 
 		 232 aa  254  6e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  53.78 
 
 		 229 aa  254  6e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  52.61 
 
 		 242 aa  254  8e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000226656  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0837  50S ribosomal protein L1P  58.08 
 
 		 229 aa  254  8e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0423664  normal  0.0981496 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0261  50S ribosomal protein L1  54.02 
 
 		 232 aa  254  9e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  54.67 
 
 		 232 aa  254  9e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  57.21 
 
 		 233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  54.42 
 
 		 232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 232 aa  253  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  54.15 
 
 		 231 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0350  50S ribosomal protein L1  53.33 
 
 		 232 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.81183  normal  0.731209 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3452  50S ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 232 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00102084  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1702  50S ribosomal protein L1  53.33 
 
 		 232 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.311882  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  53.33 
 
 		 238 aa  252  4.0000000000000004e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 229 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0336  50S ribosomal protein L1  53.33 
 
 		 232 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28407  normal  0.840151 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1441  50S ribosomal protein L1  53.78 
 
 		 232 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0252476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0744  50S ribosomal protein L1  54.67 
 
 		 233 aa  252  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00583178 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  54.05 
 
 		 229 aa  251  6e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1344  50S ribosomal protein L1  54.59 
 
 		 231 aa  251  8.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0377064  normal  0.0460128 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  55.31 
 
 		 229 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  51.95 
 
 		 236 aa  250  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  54.42 
 
 		 231 aa  251  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 236 aa  249  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3361  50S ribosomal protein L1  54.98 
 
 		 232 aa  249  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.235181  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  51.07 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  56.7 
 
 		 230 aa  249  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  51.75 
 
 		 242 aa  249  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1419  50S ribosomal protein L1  54.67 
 
 		 233 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560035  normal  0.451837 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1146  ribosomal protein L1  53.74 
 
 		 236 aa  249  3e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000284572  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  57.52 
 
 		 238 aa  249  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2685  ribosomal protein L1  53.28 
 
 		 229 aa  248  4e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0114395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  48.93 
 
 		 242 aa  247  9e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>