135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3356 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3356  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 213 aa  436  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0708547  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0748  Sel1 domain-containing protein  69.81 
 
 		 218 aa  300  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000706188  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0727  Sel1 domain protein repeat-containing protein  69.34 
 
 		 218 aa  299  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159211  hitchhiker  0.00000977989 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3648  Sel1 domain-containing protein  69.34 
 
 		 218 aa  299  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000102064  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0706  Sel1 domain-containing protein  69.34 
 
 		 218 aa  299  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00465752  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0736  Sel1 domain-containing protein  69.34 
 
 		 218 aa  299  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00305878  hitchhiker  0.000755145 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3265  Sel1 domain-containing protein  67.45 
 
 		 218 aa  292  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000032376  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0682  Sel1 domain-containing protein  67.45 
 
 		 218 aa  292  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0696  Sel1 domain-containing protein  67.45 
 
 		 218 aa  293  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0105771  hitchhiker  0.000122446 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3936  sodium-type flagellar protein MotX  68.45 
 
 		 206 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3591  Sel1 domain-containing protein  64.04 
 
 		 207 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000355002  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0510  Sel1  72.28 
 
 		 205 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.209308  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0751  Sel1 domain-containing protein  60.09 
 
 		 227 aa  275  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000018908  hitchhiker  0.00284234 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3290  Sel1 domain-containing protein  65.28 
 
 		 228 aa  272  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000129217  hitchhiker  0.00111993 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4218  Sel1 domain-containing protein  68.28 
 
 		 220 aa  271  6e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.259342  hitchhiker  0.000336684 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3068  sodium-type flagellar protein MotX  59.61 
 
 		 204 aa  246  3e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.214299  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03473  sodium-type flagellar motor component  47.37 
 
 		 214 aa  182  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0993  Sel1 repeat-containing protein  47.78 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00088  sodium-type polar flagellar protein MotX  45.41 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002265  sodium-type polar flagellar protein MotX  44.16 
 
 		 211 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4618  sodium-type flagellar protein MotX  41.95 
 
 		 211 aa  166  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2179  sodium-type flagellar protein MotX  45.36 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000273255  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2771  sodium-type polar flagellar protein MotX  40.82 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  28.93 
 
 		 685 aa  59.7  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  27.97 
 
 		 971 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.97 
 
 		 971 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  32.29 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0886  Sel1 domain-containing protein  33.64 
 
 		 475 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.488862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  31.25 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 976 aa  52.8  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4440  Sel1 domain-containing protein  34.44 
 
 		 477 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.736326  normal  0.553998 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  30.19 
 
 		 789 aa  52.4  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1285  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.44 
 
 		 484 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000475097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.11 
 
 		 222 aa  52  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  36.08 
 
 		 684 aa  51.2  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  33.03 
 
 		 831 aa  50.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  29.77 
 
 		 410 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4564  Sel1 domain-containing protein  32.71 
 
 		 516 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  30.2 
 
 		 2413 aa  50.1  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1402 aa  49.7  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  43.66 
 
 		 1430 aa  49.7  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  26.96 
 
 		 680 aa  49.7  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  34.18 
 
 		 245 aa  48.9  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  32.2 
 
 		 260 aa  48.9  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  31.71 
 
 		 1078 aa  48.1  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  31.71 
 
 		 1044 aa  48.1  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  28.12 
 
 		 267 aa  47.4  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  32.26 
 
 		 961 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  30.21 
 
 		 961 aa  48.1  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2175  hypothetical protein  29.9 
 
 		 156 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3402  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.14 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0326  Sel1 domain-containing protein  32.69 
 
 		 155 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452789  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  38.57 
 
 		 1200 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  25.19 
 
 		 765 aa  46.2  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  30.7 
 
 		 117 aa  46.2  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.93 
 
 		 255 aa  46.2  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  31.37 
 
 		 1493 aa  46.6  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.14 
 
 		 1263 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 293 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1108  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.57 
 
 		 342 aa  46.2  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633913  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.04 
 
 		 343 aa  46.2  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  28.43 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  30.43 
 
 		 490 aa  45.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  28.21 
 
 		 373 aa  45.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  30.43 
 
 		 490 aa  45.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 303 aa  45.8  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.26 
 
 		 859 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1586  hypothetical protein  31.58 
 
 		 115 aa  45.8  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0198878 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  26.8 
 
 		 1037 aa  45.4  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0043  Sel1  30.21 
 
 		 236 aa  45.4  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.521433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  32.94 
 
 		 358 aa  45.4  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1674  hypothetical protein  28.18 
 
 		 491 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.411481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  27.17 
 
 		 393 aa  45.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1207  Sel1 domain-containing protein  34 
 
 		 350 aa  45.4  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.838617  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  28.86 
 
 		 416 aa  45.4  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1141 aa  45.4  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3725  Sel1 domain protein repeat-containing protein  22.22 
 
 		 248 aa  45.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0361  hypothetical protein  30.53 
 
 		 258 aa  45.1  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  27.35 
 
 		 373 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6466  Sel1 repeat-containing protein  29.17 
 
 		 258 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  33.33 
 
 		 425 aa  44.3  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  24.35 
 
 		 679 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3170  Sel1 domain-containing protein  29.17 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0384839  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  30.93 
 
 		 255 aa  44.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  26.52 
 
 		 448 aa  44.3  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0165  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 258 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0176  hypothetical protein  30.53 
 
 		 258 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3053  Sel1 domain-containing protein  29.17 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  37.08 
 
 		 1910 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.45 
 
 		 380 aa  44.3  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  38.89 
 
 		 1200 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0066  Sel1 repeat-containing protein  29.29 
 
 		 249 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4948  Sel1 repeat-containing protein  32.39 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  31.18 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0141  hypothetical protein  30.53 
 
 		 255 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0246228  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  27.36 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.03 
 
 		 811 aa  43.9  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  32.47 
 
 		 731 aa  43.9  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.96 
 
 		 1260 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  30.85 
 
 		 376 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>