144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3290 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3290  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 228 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000129217  hitchhiker  0.00111993 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0751  Sel1 domain-containing protein  84.57 
 
 		 227 aa  344  6e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000018908  hitchhiker  0.00284234 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3591  Sel1 domain-containing protein  81.38 
 
 		 207 aa  338  4e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000355002  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4218  Sel1 domain-containing protein  79.14 
 
 		 220 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.259342  hitchhiker  0.000336684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0727  Sel1 domain protein repeat-containing protein  75.53 
 
 		 218 aa  309  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159211  hitchhiker  0.00000977989 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3648  Sel1 domain-containing protein  75.53 
 
 		 218 aa  309  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000102064  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0736  Sel1 domain-containing protein  75.53 
 
 		 218 aa  309  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00305878  hitchhiker  0.000755145 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0706  Sel1 domain-containing protein  75 
 
 		 218 aa  308  4e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00465752  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0748  Sel1 domain-containing protein  74.47 
 
 		 218 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000706188  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0696  Sel1 domain-containing protein  74.47 
 
 		 218 aa  300  9e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0105771  hitchhiker  0.000122446 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3936  sodium-type flagellar protein MotX  74.47 
 
 		 206 aa  300  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3265  Sel1 domain-containing protein  74.47 
 
 		 218 aa  300  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000032376  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0682  Sel1 domain-containing protein  74.47 
 
 		 218 aa  300  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0510  Sel1  68.09 
 
 		 205 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.209308  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3356  Sel1 domain-containing protein  66.49 
 
 		 213 aa  271  4.0000000000000004e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0708547  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3068  sodium-type flagellar protein MotX  63.19 
 
 		 204 aa  256  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.214299  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0993  Sel1 repeat-containing protein  50.26 
 
 		 232 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03473  sodium-type flagellar motor component  45.7 
 
 		 214 aa  188  8e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4618  sodium-type flagellar protein MotX  43.48 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2179  sodium-type flagellar protein MotX  42.94 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000273255  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2771  sodium-type polar flagellar protein MotX  40 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002265  sodium-type polar flagellar protein MotX  41.81 
 
 		 211 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00088  sodium-type polar flagellar protein MotX  41.81 
 
 		 211 aa  148  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  29.69 
 
 		 685 aa  58.5  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0361  hypothetical protein  35.71 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0165  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0176  hypothetical protein  35.71 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0141  hypothetical protein  35.4 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0246228  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2501  Sel1 repeat-containing protein  32.43 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3115  Sel1 domain-containing protein  32.43 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  33.73 
 
 		 789 aa  53.5  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6466  Sel1 repeat-containing protein  32.43 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  32.29 
 
 		 489 aa  53.9  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  29.57 
 
 		 393 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3170  Sel1 domain-containing protein  30.63 
 
 		 260 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0384839  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  33.33 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0954  Sel1 domain-containing protein  35.56 
 
 		 478 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.683818  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3053  Sel1 domain-containing protein  30.63 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0157  hypothetical protein  34.69 
 
 		 258 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3131  Sel1 domain-containing protein  31.53 
 
 		 250 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.705283 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2790  hypothetical protein  34.69 
 
 		 258 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2289  hypothetical protein  34.69 
 
 		 258 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2369  hypothetical protein  34.69 
 
 		 258 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  28.44 
 
 		 1037 aa  52.4  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  28.44 
 
 		 831 aa  52  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  35.87 
 
 		 693 aa  52  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3112  Sel1 domain-containing protein  31.53 
 
 		 257 aa  52  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.73458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  30.43 
 
 		 971 aa  51.6  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  28.24 
 
 		 680 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  31.25 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0047  Sel1 domain-containing protein  33.67 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  38.89 
 
 		 1430 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.43 
 
 		 971 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.18 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1107  Sel1 domain-containing protein  31.67 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.747543 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0321  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.65 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4403  hypothetical protein  32.65 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  27.35 
 
 		 679 aa  49.3  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1108  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.43 
 
 		 342 aa  49.7  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633913  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  31.33 
 
 		 2413 aa  49.7  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  30.19 
 
 		 961 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0241  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.38 
 
 		 480 aa  49.3  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.381439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 976 aa  48.9  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  32.99 
 
 		 410 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  31.87 
 
 		 373 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 303 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 1032 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  31.4 
 
 		 961 aa  47  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  28.78 
 
 		 415 aa  47.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  32.91 
 
 		 1078 aa  47.4  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  28.08 
 
 		 416 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  32.91 
 
 		 1044 aa  47.4  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1402 aa  47.4  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  29.35 
 
 		 1002 aa  47  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.05 
 
 		 325 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  30 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  30.77 
 
 		 373 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  26.05 
 
 		 325 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  32.97 
 
 		 271 aa  46.2  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  34.12 
 
 		 358 aa  46.2  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  28.18 
 
 		 509 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  28.18 
 
 		 509 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.46 
 
 		 255 aa  45.8  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  24.55 
 
 		 254 aa  46.2  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.52 
 
 		 343 aa  45.8  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  26.04 
 
 		 523 aa  45.4  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3725  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.73 
 
 		 248 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  25.77 
 
 		 765 aa  45.1  0.0008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 252 aa  45.4  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  25.6 
 
 		 232 aa  45.1  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  27.43 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  30 
 
 		 1493 aa  44.7  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  31.25 
 
 		 305 aa  44.7  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  31.03 
 
 		 425 aa  45.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  28.18 
 
 		 509 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  29.66 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  28.18 
 
 		 509 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  26.98 
 
 		 448 aa  44.7  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2980  Sel1 domain-containing protein  31.65 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  31.4 
 
 		 293 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>