More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1953 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1953  ribosomal protein L6  100 
 
 		 178 aa  355  1.9999999999999998e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0099  50S ribosomal protein L6  71.91 
 
 		 178 aa  266  1e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.492804  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1761  50S ribosomal protein L6  69.1 
 
 		 178 aa  262  2e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00139046  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0049  50S ribosomal protein L6  69.66 
 
 		 178 aa  262  2e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.560841  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1018  50S ribosomal protein L6  69.66 
 
 		 178 aa  261  3e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000674747  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1860  50S ribosomal protein L6  67.98 
 
 		 178 aa  258  2e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1689  50S ribosomal protein L6  67.98 
 
 		 178 aa  258  2e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.267616  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0074  50S ribosomal protein L6  67.42 
 
 		 178 aa  258  3e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.54113  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2066  50S ribosomal protein L6  67.98 
 
 		 178 aa  256  8e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0301  50S ribosomal protein L6  61.8 
 
 		 178 aa  228  4e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.258574  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0862  50S ribosomal protein L6P  51.7 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0120235  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1923  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591582  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0338  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3990  ribosomal protein L6  47.75 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101136  normal  0.864616 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  174  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  174  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 181 aa  173  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  45.71 
 
 		 177 aa  171  5.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  171  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 177 aa  170  7.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0436  50S ribosomal protein L6P  48.57 
 
 		 176 aa  170  7.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0157307  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  170  7.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4533  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 177 aa  170  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000653047  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  170  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0723  50S ribosomal protein L6  46.89 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0843452  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1730  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00717993  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 177 aa  167  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 177 aa  167  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  167  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  167  6e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  167  6e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  167  6e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  167  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  46.89 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0852  50S ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115405  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  166  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  46.89 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  48.04 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09000  50S ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000131703  normal  0.1847 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  46.89 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0641  ribosomal protein L6  46.33 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000196267  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  50.82 
 
 		 180 aa  166  2e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0565  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 177 aa  165  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1971  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  164  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000104023  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  45.14 
 
 		 177 aa  164  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  44.57 
 
 		 177 aa  164  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0713  50S ribosomal protein L6  46.89 
 
 		 177 aa  164  5e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0735747  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1856  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  164  8e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.789542  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0300  50S ribosomal protein L6  45.71 
 
 		 177 aa  164  9e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3894  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149542  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  49.17 
 
 		 179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2203  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0750089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1162  50S ribosomal protein L6  46.41 
 
 		 180 aa  162  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000404659  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  48.89 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  49.45 
 
 		 179 aa  162  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 177 aa  161  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  161  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2673  50S ribosomal protein L6  45.14 
 
 		 177 aa  161  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711819  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  48.35 
 
 		 179 aa  160  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 177 aa  161  6e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  160  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00745  50S ribosomal protein L6  46.89 
 
 		 177 aa  159  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2050  ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 178 aa  160  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.0184636 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0681  50S ribosomal protein L6  46.7 
 
 		 180 aa  159  1e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  45.76 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001727  LSU ribosomal protein L6p (L9e)  46.89 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000194026  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3302  50S ribosomal protein L6  45.76 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  47.78 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  46.11 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0388  50S ribosomal protein L6  45.71 
 
 		 177 aa  158  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000757352  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0396  50S ribosomal protein L6  45.71 
 
 		 177 aa  158  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0491976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2159  50S ribosomal protein L6  46.89 
 
 		 177 aa  158  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000302064  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1347  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 177 aa  158  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000134886  normal  0.277418 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1445  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 177 aa  158  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.279932 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5055  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  157  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0037225  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3282  50S ribosomal protein L6  45.76 
 
 		 177 aa  157  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000490691  hitchhiker  0.00000852439 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3899  50S ribosomal protein L6  44.57 
 
 		 177 aa  157  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139368  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  48.89 
 
 		 179 aa  157  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0598  50S ribosomal protein L6  44.57 
 
 		 177 aa  157  8e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000013887  normal  0.735029 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0298  50S ribosomal protein L6  44.57 
 
 		 177 aa  157  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000138851  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  49.45 
 
 		 179 aa  156  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  47.49 
 
 		 181 aa  155  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3164  50S ribosomal protein L6  45.2 
 
 		 177 aa  155  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000424619  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  46.77 
 
 		 184 aa  155  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 177 aa  155  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 180 aa  155  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0240  ribosomal protein L6  45.3 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.358397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>