More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1523 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  100 
 
 		 469 aa  964    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  35.83 
 
 		 429 aa  265  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  29.93 
 
 		 430 aa  234  4.0000000000000004e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  31.18 
 
 		 443 aa  220  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  31.72 
 
 		 452 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  32.37 
 
 		 437 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  31.84 
 
 		 438 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  31.84 
 
 		 438 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  31.84 
 
 		 438 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  31.84 
 
 		 438 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  31.84 
 
 		 438 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  31.84 
 
 		 438 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  31.44 
 
 		 449 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  31.84 
 
 		 438 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  32.04 
 
 		 449 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  30.44 
 
 		 442 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  32.17 
 
 		 440 aa  207  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  34.04 
 
 		 430 aa  204  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  30.65 
 
 		 413 aa  203  5e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  31.42 
 
 		 460 aa  201  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  33.93 
 
 		 453 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  29.76 
 
 		 460 aa  196  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  31.05 
 
 		 415 aa  197  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  32.03 
 
 		 434 aa  195  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  32.54 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  31.48 
 
 		 432 aa  193  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6109  hypothetical protein  28.67 
 
 		 447 aa  189  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480365 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  30.63 
 
 		 421 aa  189  9e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  30.63 
 
 		 421 aa  189  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  30.63 
 
 		 426 aa  189  9e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  30.63 
 
 		 421 aa  189  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  30.37 
 
 		 421 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  30.37 
 
 		 421 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  30.37 
 
 		 421 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  30.45 
 
 		 443 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  30.41 
 
 		 431 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  31.75 
 
 		 494 aa  183  6e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  29.04 
 
 		 429 aa  177  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  32.71 
 
 		 434 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  32.71 
 
 		 434 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  32.71 
 
 		 434 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  30.13 
 
 		 458 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  32.4 
 
 		 434 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  30.13 
 
 		 458 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  30.66 
 
 		 456 aa  173  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  29.66 
 
 		 433 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  29.66 
 
 		 433 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00251  OmpA family membrane protein  31.05 
 
 		 438 aa  170  6e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  30.1 
 
 		 433 aa  170  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6042  OmpA-type porin  28.64 
 
 		 511 aa  168  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0935  hypothetical protein  32.39 
 
 		 414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  29.58 
 
 		 433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6678  hypothetical protein  31.15 
 
 		 436 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  30.99 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3034  OmpA/MotB  28.32 
 
 		 487 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.047877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2882  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  28.72 
 
 		 493 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132662 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  30.4 
 
 		 291 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  26.11 
 
 		 463 aa  127  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  29.44 
 
 		 291 aa  126  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2553  hypothetical protein  31.33 
 
 		 290 aa  123  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00740521  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3725  hypothetical protein  28.74 
 
 		 273 aa  121  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364927  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1938  SciP protein  28.52 
 
 		 278 aa  120  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0552232  normal  0.859509 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3486  OmpA/MotB domain-containing protein  24.93 
 
 		 404 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0632352  normal  0.779995 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  29.49 
 
 		 293 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2799  type IV / VI secretion system protein, DotU family  31.48 
 
 		 258 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6107  DotU family type IV/VI secretion system protein  24.94 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3551  hypothetical protein  26.06 
 
 		 536 aa  116  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178777  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1078  type IV / VI secretion system protein, DotU family  30.05 
 
 		 258 aa  114  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3422  hypothetical protein  27.47 
 
 		 536 aa  113  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2952  hypothetical protein  27.47 
 
 		 535 aa  113  8.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.314306 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2616  hypothetical protein  26.81 
 
 		 289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188045 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3247  type IV / VI secretion system protein, DotU family  29.41 
 
 		 258 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1758  IcmH  29.96 
 
 		 257 aa  111  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  29.85 
 
 		 261 aa  111  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2119  hypothetical protein  27.55 
 
 		 289 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0053  hypothetical protein  32 
 
 		 271 aa  110  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2089  hypothetical protein  24.71 
 
 		 571 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0458657  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0716  hypothetical protein  25.06 
 
 		 552 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0804  hypothetical protein  25.06 
 
 		 552 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.624526  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  27.65 
 
 		 289 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0429  hypothetical protein  29.52 
 
 		 257 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1886  hypothetical protein  25.58 
 
 		 594 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.419438  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  27.65 
 
 		 289 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3923  DotU family type IV/VI secretion system protein  23.64 
 
 		 405 aa  108  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3232  hypothetical protein  30.23 
 
 		 289 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0732  hypothetical protein  24.83 
 
 		 552 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0245739  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2001  hypothetical protein  24.83 
 
 		 552 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66757  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0453  hypothetical protein  24.49 
 
 		 571 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3385  hypothetical protein  28.86 
 
 		 282 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0993  OmpA/MotB family outer membrane protein  23.96 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2372  hypothetical protein  27.73 
 
 		 282 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1027  hypothetical protein  24.67 
 
 		 560 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4081  hypothetical protein  27.85 
 
 		 310 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  hitchhiker  0.000110004 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1204  hypothetical protein  36.25 
 
 		 258 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0809723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2859  hypothetical protein  27.01 
 
 		 290 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486796  normal  0.274768 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0022  hypothetical protein  28.51 
 
 		 257 aa  98.6  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.828521  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000429  ImpK/VasF outer membrane protein  29.19 
 
 		 263 aa  97.8  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1114  putative type VI secretion protein VasF  31.15 
 
 		 275 aa  97.1  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2558  hypothetical protein  27.01 
 
 		 282 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654353  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  42.15 
 
 		 272 aa  97.1  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>