More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0072 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3235  penicillin-binding protein 1C  48.71 
 
 
809 aa  711  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0509  penicillin-binding protein 1C  49.48 
 
 
804 aa  722  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583992  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1881  penicillin-binding protein 1C  48.28 
 
 
787 aa  717  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.983342  hitchhiker  0.000428352 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5133  penicillin-binding protein 1C  48.84 
 
 
809 aa  713  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391992  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0072  penicillin-binding protein 1C  100 
 
 
760 aa  1555  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4282  penicillin-binding protein 1C  98.95 
 
 
760 aa  1535  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0067  penicillin-binding protein 1C  99.21 
 
 
762 aa  1541  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0067  penicillin-binding protein 1C, putative  93.03 
 
 
760 aa  1440  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2980  penicillin-binding protein 1C  48.28 
 
 
787 aa  717  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3054  penicillin-binding protein 1C  48.28 
 
 
787 aa  717  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5148  penicillin-binding protein 1C  48.84 
 
 
809 aa  714  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0543  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein PbpC  44.63 
 
 
780 aa  609  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1635  hypothetical protein  42.49 
 
 
775 aa  607  1e-172  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1629  hypothetical protein  42.1 
 
 
772 aa  605  1e-172  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1293  penicillin-binding protein 1C  41.23 
 
 
772 aa  544  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09670  penicillin-binding protein 1C  37.55 
 
 
770 aa  456  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3903  penicillin-binding protein 1C  34.97 
 
 
766 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5076  penicillin-binding protein 1C  32.74 
 
 
816 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.634438  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2639  penicillin-binding protein 1C  36.42 
 
 
793 aa  372  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1192  glycosyltransferase  31.87 
 
 
774 aa  346  8e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.224348  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0603  bifunctional penicillin-binding protein 1C  32.16 
 
 
807 aa  321  4e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0390  penicillin-binding protein 1C  32.76 
 
 
780 aa  320  9e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4592  penicillin-binding protein 1C  33.84 
 
 
784 aa  319  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0233923 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3614  penicillin-binding protein 1C  33.81 
 
 
774 aa  318  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.355013 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3022  penicillin-binding protein 1C  33.46 
 
 
793 aa  318  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.505998 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0107  penicillin-binding protein 1C  32.93 
 
 
762 aa  317  7e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2789  penicillin-binding protein 1C  32.94 
 
 
771 aa  315  1e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0400715  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2901  penicillin-binding protein 1C  32.81 
 
 
771 aa  315  2e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2683  penicillin-binding protein 1C  32.81 
 
 
771 aa  315  2e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2770  penicillin-binding protein 1C  33.07 
 
 
771 aa  315  3e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2726  penicillin-binding protein 1C  32.65 
 
 
771 aa  314  4e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3748  penicillin-binding protein 1C  31.7 
 
 
770 aa  314  5e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4387  penicillin-binding protein 1C  33.17 
 
 
782 aa  310  5e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2671  penicillin-binding protein 1C  31.37 
 
 
770 aa  310  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.122147 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1158  penicillin-binding protein 1C  31.91 
 
 
770 aa  310  6e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.729598  normal  0.0485769 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1149  penicillin-binding protein 1C  31.91 
 
 
770 aa  310  6e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391736  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02373  hypothetical protein  31.91 
 
 
770 aa  310  7e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02411  fused transglycosylase/transpeptidase  31.91 
 
 
770 aa  310  7e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2894  penicillin-binding protein 1C  32.04 
 
 
770 aa  310  7e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2803  penicillin-binding protein 1C  31.33 
 
 
770 aa  309  1e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1500  penicillin-binding protein 1C  37 
 
 
734 aa  309  1e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2670  penicillin-binding protein 1C  32 
 
 
770 aa  308  2e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0617  penicillin-binding protein 1C  33.54 
 
 
784 aa  306  1e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701974  normal  0.0771525 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3013  penicillin-binding protein 1C  31.37 
 
 
774 aa  304  3e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.928991  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3968  penicillin-binding protein  30.86 
 
 
790 aa  303  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337015  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1435  bifunctional penicillin-binding protein 1C precursor  34.03 
 
 
794 aa  303  1e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.443847  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1366  penicillin-binding protein 1C  34.24 
 
 
794 aa  299  1e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0369246  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2472  penicillin-binding protein 1C  32.91 
 
 
799 aa  297  5e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.62783e-07 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2077  penicillin-binding protein 1C  38.01 
 
 
706 aa  297  5e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145944  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0611  penicillin-binding protein 1C  33.13 
 
 
784 aa  297  6e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585704  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0572  penicillin-binding protein 1C  33 
 
 
784 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4847  penicillin-binding protein  32.14 
 
 
782 aa  295  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0732  penicillin-binding protein 1C  33.77 
 
 
774 aa  293  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1534  penicillin-binding protein 1C  37.73 
 
 
706 aa  288  3e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232379  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2824  penicillin-binding protein 1C  36.46 
 
 
680 aa  288  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2918  penicillin-binding protein 1C  36.43 
 
 
731 aa  284  5e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7154  penicillin-binding protein 1C  36.69 
 
 
692 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.334526  normal  0.789669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0605  penicillin-binding protein 1C  37.15 
 
 
691 aa  281  4e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2552  penicillin-binding protein 1C  35.53 
 
 
750 aa  281  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0465357  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3446  penicillin-binding protein 1C  38.24 
 
 
695 aa  279  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2192  penicillin-binding protein 1C  29.64 
 
 
794 aa  278  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0836  penicillin-binding protein 1C  33.45 
 
 
719 aa  277  4e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0734378 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3922  penicillin-binding protein  35.58 
 
 
695 aa  277  5e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.731246  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3916  penicillin-binding protein 1C (PBP-1C)  36.47 
 
 
745 aa  275  2e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.787281 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0023  penicillin-binding protein 1C  36.7 
 
 
674 aa  274  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0309  penicillin-binding protein 1C  29.53 
 
 
792 aa  273  7e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3260  penicillin-binding protein 1C  38.93 
 
 
696 aa  273  7e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247594  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6006  penicillin-binding protein 1C  36.14 
 
 
693 aa  273  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.155172 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1078  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.48 
 
 
724 aa  272  2e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  6.738e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2356  penicillin-binding protein 1C  32.65 
 
 
762 aa  270  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0258  penicillin-binding protein 1C  35.61 
 
 
699 aa  269  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1355  glycosyl transferase family protein  36.71 
 
 
674 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.186022  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4628  penicillin-binding protein 1C  36.73 
 
 
684 aa  266  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.170087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0164  penicillin-binding protein 1C  29.24 
 
 
797 aa  263  9e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1168  penicillin-binding protein 1C  34.24 
 
 
798 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.676311  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0105  penicillin-binding protein 1C  37.32 
 
 
706 aa  261  4e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1225  penicillin-binding protein  29.97 
 
 
716 aa  260  6e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.555971  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2543  penicillin-binding protein 1C  36.73 
 
 
696 aa  260  9e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.845119  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1530  penicillin-binding protein 1C  29.44 
 
 
764 aa  260  9e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0013  penicillin-binding protein 1C  36.71 
 
 
674 aa  258  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0471043 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0637  penicillin-binding protein 1C  37.78 
 
 
683 aa  257  7e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405443  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1160  penicillin-binding protein 1C  34.3 
 
 
686 aa  257  7e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.215949  normal  0.138456 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2772  penicillin-binding protein 1C  34.1 
 
 
690 aa  252  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1254  flagellar P-ring protein (basal body P-ring protein)  30 
 
 
722 aa  247  6e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0263  penicillin-binding protein 1C  34.1 
 
 
679 aa  245  2e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1671  penicillin-binding protein 1C  34.04 
 
 
733 aa  245  2e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.60886 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0912  penicillin-binding protein 1C  35.63 
 
 
710 aa  243  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108824  normal  0.087359 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1396  penicillin-binding protein 1C  33.86 
 
 
767 aa  241  3e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00279545 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2518  glycosyl transferase family 51  29.26 
 
 
857 aa  239  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.1285e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0405  penicillin-binding protein 1C  35.79 
 
 
699 aa  238  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00905597  normal  0.606283 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1391  penicillin-binding protein 1C  33.16 
 
 
704 aa  238  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2143  penicillin-binding protein  27.88 
 
 
765 aa  233  9e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0068  penicillin-binding protein 1C  33.17 
 
 
680 aa  230  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3225  1A family penicillin-binding protein  29.78 
 
 
952 aa  229  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00720883  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1733  penicillin-binding protein 1C  35.33 
 
 
705 aa  229  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0777193  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  31.61 
 
 
853 aa  227  5e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1948  1A family penicillin-binding protein  29.36 
 
 
855 aa  225  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2036  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  33.53 
 
 
779 aa  224  5e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0247082  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0269  penicillin-binding protein 1C  33.57 
 
 
734 aa  223  1e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3834  1A family penicillin-binding protein  30.6 
 
 
861 aa  221  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>