More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0013 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1355  glycosyl transferase family protein  94.36 
 
 		 674 aa  1137    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.186022  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0263  penicillin-binding protein 1C  55.41 
 
 		 679 aa  703    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0013  penicillin-binding protein 1C  100 
 
 		 674 aa  1301    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0471043 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2772  penicillin-binding protein 1C  57.49 
 
 		 690 aa  677    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0023  penicillin-binding protein 1C  93.77 
 
 		 674 aa  1159    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0637  penicillin-binding protein 1C  57.25 
 
 		 683 aa  638    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405443  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2824  penicillin-binding protein 1C  53.29 
 
 		 680 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2918  penicillin-binding protein 1C  54.19 
 
 		 731 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2552  penicillin-binding protein 1C  51.45 
 
 		 750 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0465357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2077  penicillin-binding protein 1C  51.45 
 
 		 706 aa  585  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145944  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3446  penicillin-binding protein 1C  50.22 
 
 		 695 aa  587  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3916  penicillin-binding protein 1C (PBP-1C)  51.16 
 
 		 745 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.787281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0258  penicillin-binding protein 1C  52.31 
 
 		 699 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7154  penicillin-binding protein 1C  50.91 
 
 		 692 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.334526  normal  0.789669 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1534  penicillin-binding protein 1C  50.15 
 
 		 706 aa  578  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232379  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2543  penicillin-binding protein 1C  52.75 
 
 		 696 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.845119  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6006  penicillin-binding protein 1C  50.23 
 
 		 693 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.155172 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4628  penicillin-binding protein 1C  51.14 
 
 		 684 aa  570  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.170087 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0605  penicillin-binding protein 1C  50.76 
 
 		 691 aa  555  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3922  penicillin-binding protein  49 
 
 		 695 aa  551  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.731246  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3260  penicillin-binding protein 1C  51.78 
 
 		 696 aa  546  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247594  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0405  penicillin-binding protein 1C  53.81 
 
 		 699 aa  542  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00905597  normal  0.606283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1733  penicillin-binding protein 1C  53.11 
 
 		 705 aa  544  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0777193  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0912  penicillin-binding protein 1C  53.44 
 
 		 710 aa  536  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108824  normal  0.087359 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1391  penicillin-binding protein 1C  52.41 
 
 		 704 aa  533  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1671  penicillin-binding protein 1C  52.32 
 
 		 733 aa  528  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.60886 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1396  penicillin-binding protein 1C  51.72 
 
 		 767 aa  528  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279545 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0105  penicillin-binding protein 1C  48.11 
 
 		 706 aa  478  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1160  penicillin-binding protein 1C  46.04 
 
 		 686 aa  445  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.215949  normal  0.138456 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0269  penicillin-binding protein 1C  43.4 
 
 		 734 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3614  penicillin-binding protein 1C  47.95 
 
 		 774 aa  403  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.355013 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1149  penicillin-binding protein 1C  44.71 
 
 		 770 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391736  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1158  penicillin-binding protein 1C  44.71 
 
 		 770 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.729598  normal  0.0485769 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1435  bifunctional penicillin-binding protein 1C precursor  47.92 
 
 		 794 aa  401  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.443847  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3013  penicillin-binding protein 1C  45.18 
 
 		 774 aa  401  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.928991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1366  penicillin-binding protein 1C  47.92 
 
 		 794 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0369246  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0603  bifunctional penicillin-binding protein 1C  44.83 
 
 		 807 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2670  penicillin-binding protein 1C  44.71 
 
 		 770 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02411  fused transglycosylase/transpeptidase  45.34 
 
 		 770 aa  398  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2803  penicillin-binding protein 1C  44.71 
 
 		 770 aa  396  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02373  hypothetical protein  45.34 
 
 		 770 aa  398  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0611  penicillin-binding protein 1C  48.95 
 
 		 784 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585704  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0572  penicillin-binding protein 1C  48.95 
 
 		 784 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09670  penicillin-binding protein 1C  39.71 
 
 		 770 aa  393  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3748  penicillin-binding protein 1C  44.54 
 
 		 770 aa  394  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2671  penicillin-binding protein 1C  44.54 
 
 		 770 aa  395  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.122147 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2894  penicillin-binding protein 1C  44.54 
 
 		 770 aa  393  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0107  penicillin-binding protein 1C  40.44 
 
 		 762 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3022  penicillin-binding protein 1C  45.37 
 
 		 793 aa  391  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505998 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2789  penicillin-binding protein 1C  44.52 
 
 		 771 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0400715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2683  penicillin-binding protein 1C  44.52 
 
 		 771 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0732  penicillin-binding protein 1C  49.43 
 
 		 774 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2901  penicillin-binding protein 1C  44.52 
 
 		 771 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2726  penicillin-binding protein 1C  44.34 
 
 		 771 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4847  penicillin-binding protein  46.55 
 
 		 782 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0617  penicillin-binding protein 1C  48.66 
 
 		 784 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701974  normal  0.0771525 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4592  penicillin-binding protein 1C  48.18 
 
 		 784 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0233923 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2770  penicillin-binding protein 1C  44.34 
 
 		 771 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4387  penicillin-binding protein 1C  45.98 
 
 		 782 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0068  penicillin-binding protein 1C  44.56 
 
 		 680 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0390  penicillin-binding protein 1C  44.34 
 
 		 780 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3968  penicillin-binding protein  38.82 
 
 		 790 aa  366  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337015  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2472  penicillin-binding protein 1C  45.52 
 
 		 799 aa  360  4e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462783 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1192  glycosyltransferase  35.49 
 
 		 774 aa  332  1e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.224348  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5076  penicillin-binding protein 1C  38.03 
 
 		 816 aa  328  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.634438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3903  penicillin-binding protein 1C  36.45 
 
 		 766 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2254  penicillin-binding protein 1C, putative  36.18 
 
 		 688 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.531479  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1901  glycosyl transferase family 51  36.18 
 
 		 688 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1635  hypothetical protein  37.55 
 
 		 775 aa  309  9e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1629  hypothetical protein  37.36 
 
 		 772 aa  307  4.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2639  penicillin-binding protein 1C  39.17 
 
 		 793 aa  306  6e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3054  penicillin-binding protein 1C  36.27 
 
 		 787 aa  293  6e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2980  penicillin-binding protein 1C  36.27 
 
 		 787 aa  293  6e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1881  penicillin-binding protein 1C  36.27 
 
 		 787 aa  293  6e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.983342  hitchhiker  0.000428352 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0543  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein PbpC  38.23 
 
 		 780 aa  290  6e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2192  penicillin-binding protein 1C  36.41 
 
 		 794 aa  286  8e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1530  penicillin-binding protein 1C  33.21 
 
 		 764 aa  280  7e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0164  penicillin-binding protein 1C  35.61 
 
 		 797 aa  279  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0067  penicillin-binding protein 1C, putative  36.79 
 
 		 760 aa  278  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2143  penicillin-binding protein  32.35 
 
 		 765 aa  270  5.9999999999999995e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0836  penicillin-binding protein 1C  29.68 
 
 		 719 aa  269  1e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0734378 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0072  penicillin-binding protein 1C  37.15 
 
 		 760 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5148  penicillin-binding protein 1C  37.14 
 
 		 809 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5133  penicillin-binding protein 1C  37.14 
 
 		 809 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0067  penicillin-binding protein 1C  37.15 
 
 		 762 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0509  penicillin-binding protein 1C  37.59 
 
 		 804 aa  267  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3235  penicillin-binding protein 1C  37.14 
 
 		 809 aa  266  7e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1078  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.91 
 
 		 724 aa  266  1e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00006738  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1293  penicillin-binding protein 1C  37.35 
 
 		 772 aa  265  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4282  penicillin-binding protein 1C  36.96 
 
 		 760 aa  262  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1254  flagellar P-ring protein (basal body P-ring protein)  32.02 
 
 		 722 aa  259  1e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0309  penicillin-binding protein 1C  32.56 
 
 		 792 aa  257  5e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1500  penicillin-binding protein 1C  33.27 
 
 		 734 aa  254  4.0000000000000004e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1225  penicillin-binding protein  30.61 
 
 		 716 aa  251  4e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.555971  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2356  penicillin-binding protein 1C  33.85 
 
 		 762 aa  239  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2036  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  38.28 
 
 		 779 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0247082  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1168  penicillin-binding protein 1C  33.4 
 
 		 798 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.676311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  33 
 
 		 801 aa  232  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  34.22 
 
 		 732 aa  224  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1842  glycosyl transferase family 51  38.2 
 
 		 782 aa  224  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0117542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>