More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0236 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  100 
 
 		 402 aa  743    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0208  hypothetical protein  89.82 
 
 		 289 aa  403  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  38.52 
 
 		 432 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  39.16 
 
 		 421 aa  199  7.999999999999999e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  41 
 
 		 402 aa  194  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  39.15 
 
 		 420 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  39.59 
 
 		 435 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  40.33 
 
 		 408 aa  173  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  36.01 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  36.9 
 
 		 415 aa  169  9e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  37.88 
 
 		 411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  40.66 
 
 		 432 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 425 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 426 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  37.77 
 
 		 434 aa  160  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  33.85 
 
 		 451 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  36.6 
 
 		 411 aa  157  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  35.01 
 
 		 416 aa  154  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  37.73 
 
 		 442 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  34.58 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 456 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  35.63 
 
 		 418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  33.7 
 
 		 439 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  40.47 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0207  hypothetical protein  85.57 
 
 		 97 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  33.86 
 
 		 406 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  34.74 
 
 		 461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  33.05 
 
 		 418 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  32.77 
 
 		 418 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  32.77 
 
 		 418 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  32.77 
 
 		 417 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  32.77 
 
 		 397 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  32.77 
 
 		 417 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 410 aa  124  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  37.67 
 
 		 427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  22.91 
 
 		 405 aa  119  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  22.91 
 
 		 405 aa  119  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 		 447 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 426 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1968  major facilitator superfamily MFS_1  36.56 
 
 		 405 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000336752  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 439 aa  110  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  32.07 
 
 		 417 aa  107  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 		 420 aa  106  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  35.34 
 
 		 420 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  23.83 
 
 		 410 aa  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 427 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 420 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 431 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5351  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 401 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804378  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 416 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  24.86 
 
 		 408 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 		 430 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 416 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 416 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  25.41 
 
 		 408 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 432 aa  86.3  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3437  protein of unknown function DUF894 DitE  29.04 
 
 		 551 aa  84  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545505  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  25.14 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  25.14 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  24.53 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 428 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  21.5 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  22.25 
 
 		 421 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  27.24 
 
 		 431 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1155  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.128986 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  24.86 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  24.73 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  21.5 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 416 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2483  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 440 aa  77.4  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  20.98 
 
 		 414 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  29.23 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  29.18 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 442 aa  73.2  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 406 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>