More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3624 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_4230  peptidase M6, immune inhibitor A  56.91 
 
 
871 aa  891    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.187448  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0094  peptidase M6, immune inhibitor A  56.13 
 
 
865 aa  928    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  58.26 
 
 
935 aa  1050    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  57.37 
 
 
945 aa  1055    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  57.45 
 
 
936 aa  1034    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  54.64 
 
 
938 aa  966    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4432  peptidase M6, immune inhibitor A  58.46 
 
 
951 aa  1059    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00957911  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0129  M6 family metalloprotease  57.28 
 
 
871 aa  902    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0124  peptidase M6, immune inhibitor A  57.64 
 
 
856 aa  939    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000205942  unclonable  0.000000000253026 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4827  M6 family metalloprotease  57.07 
 
 
965 aa  1048    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0124  peptidase M6 immune inhibitor A  57.16 
 
 
867 aa  925    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  57.56 
 
 
936 aa  1034    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  100 
 
 
938 aa  1917    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  57.32 
 
 
869 aa  942    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0828059  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  57.29 
 
 
951 aa  1039    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0128  M6 family metalloprotease domain protein  57.43 
 
 
865 aa  927    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  36.87 
 
 
918 aa  555  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2642  M6 family metalloprotease domain protein  33.72 
 
 
751 aa  362  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4009  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  32.82 
 
 
795 aa  360  7e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000486649  decreased coverage  2.1693499999999997e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0740  immune inhibitor A metalloprotease  33.16 
 
 
799 aa  353  8e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000142513  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0800  immune inhibitor A metalloprotease  33.16 
 
 
799 aa  353  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000400442  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1199  peptidase M6 immune inhibitor A  32.68 
 
 
795 aa  353  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0164626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1175  immune inhibitor A  32.27 
 
 
795 aa  352  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1373  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  32.27 
 
 
795 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000139862 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1396  immune inhibitor A metalloprotease  32.51 
 
 
796 aa  352  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00116744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1197  immune inhibitor A metalloprotease  32.27 
 
 
795 aa  352  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.989973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1295  immune inhibitor a metalloprotease  32.27 
 
 
795 aa  352  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00741002  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0638  immune inhibitor A metalloprotease  33.55 
 
 
799 aa  351  3e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.160109  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1177  immune inhibitor A  32.64 
 
 
796 aa  351  3e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0672  immune inhibitor a metalloprotease  33.55 
 
 
799 aa  351  3e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000318006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0728  immune inhibitor A metalloprotease  33.55 
 
 
799 aa  350  6e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.74275e-60 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0703  immune inhibitor A metalloprotease  33.04 
 
 
799 aa  350  7e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000682941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0585  peptidase M6 immune inhibitor A  32.09 
 
 
796 aa  349  1e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0581  immune inhibitor A, metalloprotease  33.42 
 
 
799 aa  349  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0582  immune inhibitor A, metalloprotease  33.42 
 
 
799 aa  348  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4635  immune inhibitor A metalloprotease  32.65 
 
 
799 aa  348  3e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000450227  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1005  peptidase M6 immune inhibitor A  31.97 
 
 
795 aa  347  5e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1335  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  32.43 
 
 
796 aa  347  6e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00051672  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1437  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  31.83 
 
 
795 aa  346  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3001  immune inhibitor A  32.67 
 
 
795 aa  343  9e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.018121  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0880  peptidase M6 immune inhibitor A  32.74 
 
 
812 aa  342  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000627944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2240  immune inhibitor A  32.55 
 
 
795 aa  342  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00227044  hitchhiker  0.00000656343 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3037  proteinase  32.78 
 
 
794 aa  342  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000211319  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3035  immune inhibitor A  32.65 
 
 
794 aa  340  8e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000174925  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3107  immune inhibitor A  32.96 
 
 
795 aa  328  3e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.628659  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1564  M6 family metalloprotease domain protein  28.8 
 
 
770 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0322  peptidase M6, immune inhibitor A  28.94 
 
 
764 aa  200  9e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117868  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0333  M6 family metalloprotease domain protein  29.35 
 
 
763 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.596223  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0344  M6 family metalloprotease domain protein  28.8 
 
 
763 aa  193  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0799  M6 family metalloprotease domain-containing protein  29.01 
 
 
744 aa  192  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.252815  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0829  peptidase M6, immune inhibitor A  29.9 
 
 
746 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2142  M6 family metalloprotease domain-containing protein  28.17 
 
 
927 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.395329  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2724  peptidase M6 immune inhibitor A  27.25 
 
 
771 aa  184  7e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  27.24 
 
 
1045 aa  183  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4435  peptidase M6 immune inhibitor A  28.53 
 
 
806 aa  181  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431227  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1277  peptidase M6, immune inhibitor A  26.14 
 
 
781 aa  179  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.733002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4803  M6 family metalloprotease domain-containing protein  30.58 
 
 
747 aa  170  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0015  peptidase M6, immune inhibitor A  27.55 
 
 
760 aa  169  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6351  hypothetical protein  23.78 
 
 
924 aa  158  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5286  M6 family metalloprotease domain protein  27.41 
 
 
768 aa  147  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal  0.474282 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3939  peptidase M6, immune inhibitor A  26.83 
 
 
825 aa  142  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530479  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2257  M6 family metalloprotease domain protein  26.85 
 
 
811 aa  137  8e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974167  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  37.16 
 
 
918 aa  112  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  48.19 
 
 
1150 aa  112  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  51.27 
 
 
1565 aa  110  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  47.48 
 
 
792 aa  107  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  39.61 
 
 
669 aa  95.5  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  43.57 
 
 
3295 aa  95.1  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  38.18 
 
 
581 aa  94.7  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  37.16 
 
 
1732 aa  94  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  41.67 
 
 
2066 aa  93.2  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  42.95 
 
 
1236 aa  93.2  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  40.4 
 
 
551 aa  92.8  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  39.86 
 
 
791 aa  92.4  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  40 
 
 
773 aa  92.4  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  38.41 
 
 
675 aa  91.3  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  42.25 
 
 
2554 aa  90.9  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  42.48 
 
 
1916 aa  90.5  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  41.18 
 
 
859 aa  90.9  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  42.54 
 
 
575 aa  90.5  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  37.31 
 
 
816 aa  90.9  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  39.08 
 
 
1356 aa  89.7  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  40.85 
 
 
644 aa  89.7  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  42.54 
 
 
978 aa  90.1  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  45 
 
 
1095 aa  89.7  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  39.53 
 
 
910 aa  90.1  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  36.36 
 
 
658 aa  89.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  38.12 
 
 
184 aa  89  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  35.16 
 
 
547 aa  89.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  37.78 
 
 
1027 aa  89  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  42.94 
 
 
460 aa  89.4  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  37.33 
 
 
713 aa  89  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  39.74 
 
 
679 aa  89  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  37.66 
 
 
1667 aa  88.6  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  43.24 
 
 
1842 aa  89  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  40.14 
 
 
561 aa  89  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  38.61 
 
 
816 aa  88.6  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  29.8 
 
 
1862 aa  88.2  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  33.8 
 
 
1602 aa  87.8  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  40.14 
 
 
1094 aa  87.4  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>