More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1473 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1473  surface antigen (D15)  100 
 
 		 856 aa  1692    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000179625  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1519  surface antigen (D15)  26.66 
 
 		 882 aa  197  6e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  22.17 
 
 		 913 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  21.72 
 
 		 888 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1686  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.96 
 
 		 749 aa  112  4.0000000000000004e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.998639  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  22.93 
 
 		 896 aa  108  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.88 
 
 		 781 aa  107  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.85 
 
 		 895 aa  106  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  20.29 
 
 		 763 aa  105  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.94 
 
 		 892 aa  102  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.37 
 
 		 768 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  22.24 
 
 		 768 aa  97.8  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.27 
 
 		 895 aa  95.9  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.43 
 
 		 769 aa  95.5  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  22.37 
 
 		 769 aa  94.7  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  22.34 
 
 		 769 aa  94.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  22.34 
 
 		 769 aa  94.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  21.5 
 
 		 769 aa  94  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  21.5 
 
 		 768 aa  93.6  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  21.5 
 
 		 769 aa  94  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  21.37 
 
 		 768 aa  93.2  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.45 
 
 		 765 aa  92.8  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  21.12 
 
 		 758 aa  92  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  21.37 
 
 		 769 aa  91.7  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  21.37 
 
 		 768 aa  91.3  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  21.37 
 
 		 768 aa  91.3  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  21.37 
 
 		 768 aa  91.3  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.18 
 
 		 769 aa  90.9  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1501  OMP85 family outer membrane protein  22.66 
 
 		 757 aa  90.5  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.64 
 
 		 770 aa  89.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  21.22 
 
 		 752 aa  89.4  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.67 
 
 		 752 aa  88.6  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.54 
 
 		 770 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  21.49 
 
 		 767 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0322  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.01 
 
 		 784 aa  87.4  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0357  outer membrane antigen  20.89 
 
 		 784 aa  85.5  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.433119  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1446  surface antigen (D15)  21.13 
 
 		 765 aa  85.1  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.332057 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.21 
 
 		 920 aa  85.1  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  20.61 
 
 		 765 aa  85.1  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.61 
 
 		 765 aa  85.1  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.51 
 
 		 758 aa  84  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  20.67 
 
 		 820 aa  84.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  23.28 
 
 		 751 aa  83.2  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1053  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.72 
 
 		 807 aa  82.8  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  21.6 
 
 		 765 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1446  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.75 
 
 		 800 aa  82.8  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  21.36 
 
 		 893 aa  81.6  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0215  conserved hypothetical protein, putative outer membrane protein  22.22 
 
 		 738 aa  80.9  0.00000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0238562  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0124  OMP85 family outer membrane protein  25.07 
 
 		 739 aa  80.5  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0164  OMP85 family outer membrane protein  25.07 
 
 		 739 aa  80.5  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00465042  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0142  OMP85 family outer membrane protein  22.01 
 
 		 739 aa  80.5  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0561822  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  22.03 
 
 		 765 aa  80.5  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  21.44 
 
 		 788 aa  80.5  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3490  surface antigen (D15)  21.05 
 
 		 705 aa  79  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.430681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2687  surface antigen (D15)  21.83 
 
 		 784 aa  79  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.379638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.01 
 
 		 787 aa  78.6  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1751  surface antigen family protein  21.54 
 
 		 820 aa  78.2  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1757  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.78 
 
 		 759 aa  78.2  0.0000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000442418  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  24.18 
 
 		 781 aa  78.2  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.82 
 
 		 769 aa  77.8  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  20.28 
 
 		 769 aa  77.8  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.88 
 
 		 765 aa  77.8  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.64 
 
 		 750 aa  77  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  22.24 
 
 		 765 aa  76.6  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4254  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.28 
 
 		 800 aa  76.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.09 
 
 		 772 aa  75.9  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1458  surface antigen (D15)  20.39 
 
 		 780 aa  75.5  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.39 
 
 		 781 aa  75.5  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  22.39 
 
 		 781 aa  75.5  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  21.81 
 
 		 785 aa  74.7  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  22.22 
 
 		 790 aa  74.3  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2447  OMP85 family outer membrane protein  21.65 
 
 		 796 aa  73.6  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.019137  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0397  surface antigen (D15)  22.19 
 
 		 830 aa  73.9  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00277353  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  21.88 
 
 		 766 aa  73.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  27.54 
 
 		 637 aa  73.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1766  surface antigen (D15)  23.19 
 
 		 766 aa  73.2  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0726033  normal  0.0207518 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  21.68 
 
 		 794 aa  73.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  19.75 
 
 		 848 aa  72.8  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  19.91 
 
 		 779 aa  72.8  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0400  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.9 
 
 		 827 aa  72.4  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000108596  unclonable  0.0000045929 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  22.62 
 
 		 610 aa  72.8  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0292  outer membrane protein, OMP85 family protein  25.57 
 
 		 578 aa  71.6  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0339  outer membrane protein  22.77 
 
 		 588 aa  71.2  0.00000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0408659  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  28.87 
 
 		 622 aa  70.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0254  surface antigen (D15)  23.54 
 
 		 683 aa  70.5  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103892  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  21.58 
 
 		 770 aa  70.5  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.9 
 
 		 821 aa  69.7  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000592139  normal  0.27128 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1971  putative outer membrane signal peptide protein  19.85 
 
 		 781 aa  69.7  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.208049  normal  0.130084 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0660  surface antigen (D15)  23.35 
 
 		 755 aa  69.7  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.665209  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2842  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.75 
 
 		 770 aa  70.1  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0942  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.32 
 
 		 751 aa  70.1  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000918625  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.68 
 
 		 793 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1855  surface antigen (D15)  20.23 
 
 		 799 aa  69.3  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  20.42 
 
 		 792 aa  68.9  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1898  outer membrane protein  25.34 
 
 		 578 aa  68.6  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  21.79 
 
 		 560 aa  68.2  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2172  surface antigen (D15)  23.48 
 
 		 636 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.41 
 
 		 793 aa  67  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  23.98 
 
 		 905 aa  67  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  21.68 
 
 		 806 aa  67  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>