More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1194 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1194  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 294 aa  592  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1081  preprotein translocase subunit SecF  94.9 
 
 		 294 aa  568  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.121562  normal  0.1541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1020  preprotein translocase subunit SecF  95.24 
 
 		 294 aa  568  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00412183  hitchhiker  0.000205706 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1016  preprotein translocase subunit SecF  93.54 
 
 		 294 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0271563  hitchhiker  0.00537871 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2844  preprotein translocase subunit SecF  92.95 
 
 		 298 aa  557  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000056416  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3291  preprotein translocase subunit SecF  89.67 
 
 		 300 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1118  preprotein translocase subunit SecF  89.67 
 
 		 300 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.377111  hitchhiker  0.000000000101209 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3249  preprotein translocase subunit SecF  89.33 
 
 		 300 aa  534  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.015855  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3427  preprotein translocase subunit SecF  89.33 
 
 		 300 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000133978  decreased coverage  0.000105765 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0980  preprotein translocase subunit SecF  75.68 
 
 		 307 aa  448  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00161117  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3399  protein-export membrane protein SecF  72.39 
 
 		 308 aa  431  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00684412  decreased coverage  0.000027343 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3571  protein-export membrane protein SecF  71.38 
 
 		 314 aa  428  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00137282  hitchhiker  0.0015659 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3070  protein-export membrane protein SecF  70.37 
 
 		 302 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0587358  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2498  protein-export membrane protein SecF  60.55 
 
 		 301 aa  345  5e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05362  preprotein translocase subunit SecF  57.91 
 
 		 300 aa  343  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000523  protein-export membrane protein SecF  57.24 
 
 		 300 aa  339  2.9999999999999998e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0632  protein-export membrane protein SecF  62.01 
 
 		 300 aa  327  1.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4204  preprotein translocase subunit SecF  44.11 
 
 		 328 aa  246  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  43.05 
 
 		 322 aa  223  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  43.25 
 
 		 315 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  42.47 
 
 		 315 aa  219  6e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  43.53 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2334  preprotein translocase subunit SecF  44.44 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  40 
 
 		 315 aa  208  9e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  43.2 
 
 		 315 aa  208  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  39.12 
 
 		 323 aa  205  8e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1385  preprotein translocase subunit SecF  43.79 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00983524  hitchhiker  0.000000302266 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1450  preprotein translocase subunit SecF  43.79 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1438  preprotein translocase subunit SecF  43.79 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107161  hitchhiker  0.00000672809 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  43.99 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  39.94 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  39.94 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  39.94 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  39.94 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  39.94 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  39.94 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  39.94 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  39.78 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  39.94 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  39.79 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  39.94 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  38.38 
 
 		 323 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  38.38 
 
 		 323 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  38.38 
 
 		 323 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  38.38 
 
 		 323 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  38.38 
 
 		 323 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  42.81 
 
 		 315 aa  201  9e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1573  preprotein translocase subunit SecF  42.81 
 
 		 315 aa  201  9e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00583403  hitchhiker  0.000000100837 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1759  preprotein translocase subunit SecF  47.15 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.020465  normal  0.0122623 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1473  preprotein translocase subunit SecF  42.86 
 
 		 315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13163  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  42.47 
 
 		 315 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  42.07 
 
 		 315 aa  199  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  42.47 
 
 		 315 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  35.47 
 
 		 323 aa  199  5e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  40.14 
 
 		 313 aa  199  5e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2889  preprotein translocase subunit SecF  46.67 
 
 		 315 aa  199  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000629469 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  38.83 
 
 		 315 aa  196  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  39.66 
 
 		 316 aa  196  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  34.48 
 
 		 323 aa  196  3e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  37.04 
 
 		 323 aa  195  6e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  39.93 
 
 		 303 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  39.93 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  43.31 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  40.14 
 
 		 313 aa  192  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0600  protein-export membrane protein SecF  35.19 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2211  preprotein translocase subunit SecF  39.66 
 
 		 314 aa  192  6e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.220964 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  40.86 
 
 		 302 aa  191  9e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2903  preprotein translocase subunit SecF  37.67 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  38.1 
 
 		 313 aa  190  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  35.86 
 
 		 316 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  35.86 
 
 		 337 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  38.26 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  37.75 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  38.19 
 
 		 302 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3261  preprotein translocase subunit SecF  40.34 
 
 		 322 aa  186  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.578435  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3120  preprotein translocase subunit SecF  40.34 
 
 		 322 aa  186  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0405125  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3381  preprotein translocase subunit SecF  40.34 
 
 		 322 aa  186  5e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144101  normal  0.396634 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  38.54 
 
 		 302 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  37.76 
 
 		 310 aa  185  9e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3993  preprotein translocase subunit SecF  38.19 
 
 		 316 aa  185  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117459  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  37.14 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  40.78 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  40.78 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2080  preprotein translocase subunit SecF  37.67 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.348624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  38.11 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0702  preprotein translocase subunit SecF  37.12 
 
 		 316 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.686375  normal  0.807805 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1022  preprotein translocase subunit SecF  39.94 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1162  preprotein translocase subunit SecF  36.46 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  36.46 
 
 		 316 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2384  preprotein translocase subunit SecF  36.46 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  36.86 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  36.81 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2570  preprotein translocase subunit SecF  36.46 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  37.97 
 
 		 291 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0300  preprotein translocase subunit SecF  36.46 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3365  preprotein translocase subunit SecF  36.46 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3374  preprotein translocase subunit SecF  36.46 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4618  preprotein translocase subunit SecF  39.72 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  36.5 
 
 		 323 aa  179  5.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  36.5 
 
 		 323 aa  179  5.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>