More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3816 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
261 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  91.19 
 
 
261 aa  484  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  90.8 
 
 
261 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  68.34 
 
 
264 aa  363  1e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  65.12 
 
 
262 aa  350  1e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.2 
 
 
266 aa  334  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.14 
 
 
275 aa  298  8e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.42 
 
 
273 aa  294  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.65 
 
 
269 aa  285  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.88 
 
 
269 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  54.86 
 
 
273 aa  277  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.31 
 
 
260 aa  276  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  54.62 
 
 
275 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  56.2 
 
 
264 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  56.03 
 
 
266 aa  272  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.71 
 
 
269 aa  272  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.04 
 
 
263 aa  272  5.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  56.59 
 
 
264 aa  271  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  56.59 
 
 
290 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  56.59 
 
 
290 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  54.65 
 
 
269 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  56.03 
 
 
270 aa  268  7e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  56.59 
 
 
278 aa  267  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  55.81 
 
 
264 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  51.16 
 
 
262 aa  266  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  55.04 
 
 
264 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  53.08 
 
 
275 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  55.08 
 
 
264 aa  265  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  55.43 
 
 
272 aa  265  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  55.43 
 
 
272 aa  265  5e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  55.47 
 
 
261 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  55.47 
 
 
261 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.26 
 
 
260 aa  264  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1221  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.92 
 
 
273 aa  263  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212556  normal  0.0915283 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.6 
 
 
276 aa  263  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  55.08 
 
 
261 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  52.14 
 
 
269 aa  260  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  51.54 
 
 
275 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.64 
 
 
274 aa  260  2e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0757  enoyl-CoA hydratase  53.57 
 
 
269 aa  259  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457291  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  52.71 
 
 
266 aa  259  4e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.31 
 
 
262 aa  258  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  51.75 
 
 
274 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4950  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.3 
 
 
265 aa  256  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2717  enoyl-CoA hydratase  51.76 
 
 
265 aa  254  7e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4900  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.34 
 
 
266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  54.76 
 
 
280 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.92 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.34 
 
 
270 aa  253  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  53.63 
 
 
269 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  52.82 
 
 
269 aa  251  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  51.16 
 
 
275 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  56.75 
 
 
267 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.47 
 
 
265 aa  249  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  53.23 
 
 
261 aa  244  8e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0864  enoyl-CoA hydratase  54.3 
 
 
273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281406  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  53.05 
 
 
257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1325  enoyl-CoA hydratase  47.86 
 
 
277 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  46.9 
 
 
264 aa  236  4e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 
272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  49.61 
 
 
272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2559  enoyl-CoA hydratase  51.74 
 
 
261 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2388  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.2 
 
 
269 aa  231  9e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.22 
 
 
270 aa  227  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.97 
 
 
261 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.6 
 
 
269 aa  199  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40.61 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.31 
 
 
263 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 
258 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6127  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.38 
 
 
255 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29450  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  38.64 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.36 
 
 
262 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  40 
 
 
263 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
258 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4125  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 
257 aa  149  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
258 aa  148  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.88 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.04 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.04 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.04 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.87 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.69 
 
 
264 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 
256 aa  143  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 
260 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 
259 aa  142  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2206  enoyl-CoA hydratase  36.59 
 
 
259 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0233003  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.96 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2927  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 
258 aa  139  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 
268 aa  140  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.07 
 
 
255 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.51 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.46 
 
 
258 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 
265 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 
264 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2437  enoyl-CoA hydratase  36.59 
 
 
259 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1666  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
259 aa  138  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.458425  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 
266 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 
260 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 
264 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>