More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4860 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 164 aa  318  3e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  83.44 
 
 		 165 aa  269  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4037  lipoprotein signal peptidase  81.6 
 
 		 165 aa  266  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3163  lipoprotein signal peptidase  71.95 
 
 		 164 aa  226  9e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2543  lipoprotein signal peptidase  71.43 
 
 		 165 aa  219  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1394  lipoprotein signal peptidase  79.72 
 
 		 190 aa  200  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.660722  normal  0.96884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1715  lipoprotein signal peptidase  70.95 
 
 		 165 aa  171  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.488769  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1007  lipoprotein signal peptidase  46.06 
 
 		 167 aa  140  9e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2281  lipoprotein signal peptidase  46.95 
 
 		 171 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2326  lipoprotein signal peptidase  47.56 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2603  lipoprotein signal peptidase  46.95 
 
 		 171 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0288  lipoprotein signal peptidase  44.72 
 
 		 184 aa  127  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1799  lipoprotein signal peptidase  49.68 
 
 		 171 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.408205  normal  0.0603455 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0632  lipoprotein signal peptidase  48.67 
 
 		 177 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.263263  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0392  lipoprotein signal peptidase  49.03 
 
 		 165 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.034269  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2861  lipoprotein signal peptidase  46.2 
 
 		 171 aa  121  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978018 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  45 
 
 		 154 aa  120  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  44.37 
 
 		 160 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2219  lipoprotein signal peptidase  45.81 
 
 		 165 aa  111  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0614  lipoprotein signal peptidase  39.33 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.107984 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1410  lipoprotein signal peptidase  40.67 
 
 		 174 aa  103  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2356  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 173 aa  100  8e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0383384 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2206  lipoprotein signal peptidase  46.67 
 
 		 177 aa  99.4  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.252335  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  39.88 
 
 		 169 aa  96.7  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  35.8 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  42.31 
 
 		 169 aa  93.6  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4439  signal peptidase II  35.58 
 
 		 165 aa  92.4  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  40.82 
 
 		 173 aa  91.7  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  35.53 
 
 		 174 aa  89.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  39.62 
 
 		 178 aa  89.4  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  39.46 
 
 		 174 aa  87.8  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  39.19 
 
 		 172 aa  87.8  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  38.78 
 
 		 174 aa  87.8  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  38.62 
 
 		 157 aa  87.4  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0760  lipoprotein signal peptidase  38.97 
 
 		 158 aa  87  9e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.473173  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  38.51 
 
 		 172 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  37.66 
 
 		 170 aa  85.1  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 166 aa  84.7  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 166 aa  84.3  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 166 aa  84.3  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 166 aa  84.3  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 166 aa  84.3  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  36.73 
 
 		 176 aa  84.3  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 166 aa  84.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 166 aa  84.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 166 aa  84.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  35.85 
 
 		 172 aa  84  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4414  signal peptidase II  39.32 
 
 		 123 aa  83.6  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849735  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  38.67 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  35.53 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  31.79 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  32.43 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2207  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  37.67 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2717  lipoprotein signal peptidase  32.69 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  34.01 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  35.9 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  34.93 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  37.18 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4043  signal peptidase II  38.56 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0092  lipoprotein signal peptidase  34.46 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.142417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3614  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.463393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  37.11 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3952  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.386002  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  38.26 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  37.33 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  37.84 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  33.93 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  37.84 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  38.75 
 
 		 174 aa  77.4  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  32.19 
 
 		 180 aa  77.4  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  35.26 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  37.33 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  35.85 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  35.85 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  35.86 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  38.22 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  31.41 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  36.23 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  39.29 
 
 		 364 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  38.1 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  32.41 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>